Ultrasecuenciación: Análisis Bioinformático de interacción de regiones cromosómicas 4c (Chromosome conformation capture-on-chip)

Descripción del servicio

Captura en chip de conformación cromosómica (4C), proporciona interacciones entre un locus y todos los demás loci genómicos. Implica un segundo paso de ligadura, para crear fragmentos de ADN auto-circularizados, que se utilizan para realizar PCR inversa. La PCR inversa permite que la secuencia conocida se use para amplificar la secuencia desconocida ligada a ella. A diferencia de 3C y 5C, la técnica 4C no requiere el conocimiento previo de ambas regiones cromosómicas que interactúan. Los resultados obtenidos con 4C son altamente reproducibles con la mayoría de las interacciones que se detectan entre regiones proximales entre sí. En un solo micromatriz, se pueden analizar aproximadamente un millón de interacciones.