Sample preparation

La Plataforma de Metabolómica CIAL es un servicio de análisis enmarcado en el Campus Internacional de Excelencia de la Universidad Autónoma de Madrid (UAM) y el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Se encuentra situada en el Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL) y tiene como misión el desarrollo analítico avanzado del metaboloma en matrices biológicas complejas, ofreciendo estrategias de análisis basadas en técnicas cromatográficas, espectrometría de masas de alta resolución, procesado avanzado de datos y análisis estadístico multivariante, entre otros. La Plataforma de Metabolómica ofrece servicio a todos los miembros de la comunidad científica (dentro y fuera del campus UAM-CSIC), así como a empresas que lo soliciten, anunciando sus servicios en la web: http://www.cial.uam-csic.es/metabolomics.html

El Servicio de Citometría de flujo del Centro Nacional de Biotecnología desarrolla su labor en el marco de los diferentes programas de investigación del centro. Además de dar servicio a los usuarios de Citometría, el personal del Servicio pone a punto los diferentes sistemas de trabajo y desarrolla nuevas metodologías antes de ponerlas a disposición de los usuarios. El Servicio da soporte técnico y tecnológico tanto a los diferentes grupos del centro que los soliciten, como a diferentes grupos del sector público o privado El Servicio ofrece: Formación y Supervisión en Citometría de Flujo y en el uso de los diferentes Citómetros del Centro. Elaboración, optimización y actualización de los protocolos . Análisis y presentación de resultados con diferentes softwares especializados. Puesta a punto de diferentes aplicaciones, Cuantificación de citoquinas solubles mediante ensayos de multiplexado. Aislamiento celular por Cell Sorting . Anticuerpos y reactivos de uso común

Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de ecología molecular: identificar el sexo de los individuos, identificar individuos de poblaciones salvajes mediante sus heces, determinar relaciones de parentesco entre individuos, detectar cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilizar marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos. Los marcadores nucleares se pueden desarrollar, optimizar y tipar para conocer mejor las relaciones entre individuos, poblaciones y especies. Se ofrece asimismo la posibilidad de secuenciar tanto genes diana mediante secuenciación Sanger como secuenciación de nueva generación de genomas enteros para estudios de genética poblacional, genética funcional y filogenias. las técnicas basadas en ARN están actualmente en expansión

El Servicio de Microscopía Confocal y Electrónica de Transmisión (CTEM) tiene como finalidad satisfacer la creciente demanda de los investigadores del Centro en este ámbito. El Servicio pretende organizar, gestionar, optimizar y fomentar el uso de los grandes equipos de microscopía disponibles en el Instituto. También facilita la preparación estándar de las muestras antes de su observación. El Servicio está disponible tanto para los investigadores de las sublíneas de investigación de la EEZ (servicio interno) como para otras instituciones académicas y comerciales (servicio externo).

La citometría de flujo es una de las técnicas que ha experimentado un mayor desarrollo en los últimos años. Ésta técnica proporciona datos multiparamétricos relativos a las características físicas y químicas de células o partículas en suspensión. Nuestro Servicio de Citometría de Flujo proporciona equipamiento y asistencia profesional para la realización de una amplia gama de análisis mediante citometría de flujo. Estos incluyen des del inmunofenotipaje más convencional a ensayos de biología celular (apoptosis, ciclo celular, la proliferación...), estudios de transducción de señal (fosforilación, movilización de Ca2 +), detección de moléculas solubles (citoquinas…), estudios genéticos y de ploidía. El Servicio dispone también de un separador de partículas (cell sorter) que permite la separación física de subpoblaciones con diferentes características de fluorescencia. El Servicio también proporciona asesoramiento en el diseño de experimentos, proporciona protocolos, y suminist

El Servicio de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.

Este Servicio ofrece soporte analítico en las áreas de la agricultura y la química ambiental a investigadores de los diferentes departamentos del Instituto, así como a otros centros públicos y entidades privadas. El SAI lleva a cabo análisis químicos y físicos de suelos y plantas y análisis metabolómicos, ofreciendo más de veinte tipos de ensayos diferentes. Utiliza una gran variedad de técnicas instrumentales, incluyendo espectroscopia de absorción atómica, espectrometría de emisión óptica por plasma de acoplamiento inductivo, espectrofotometría UV-Visible y autonalizador de flujo segmentado. Además, cuenta con una plataforma de metabolómica constituida por un UHPLC-MS-qTOF y CG-MS. Además de este soporte analítico, el Servicio ofrece asistencia técnica a agricultores locales y cooperativas agrícolas en relación con la mejora de la fertilidad de los suelos.

El Servicio de Microscopía Óptica Avanzada (SMOA) es un servicio central de apoyo a la investigación del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. El SMOA dispone de sistemas avanzados de microscopía óptica, así como equipamiento informático especializado en la visualización y el análisis de imágenes. El equipo técnico del SMOA gestiona y mantiene los equipos de microscopía e informáticos, brinda soporte científico-técnico y asesora y forma (mediante seminarios y sesiones teórico-prácticas) a los investigadores en las técnicas de microscopía óptica. Asimismo, el personal del SMOA almacena y distribuye reactivos relacionados con estas técnicas y trabaja para mantener el servicio actualizado, incorporando y configurando nuevos sistemas. El SMOA pertenece a la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada (REMOA), a la Red de Laboratorios e Infraestructuras (RedLab) y a la Plataforma de Microscopía para Biociencias y mantiene una acreditación de calidad y control ISO 9001:2015 (AENOR).

Equipos: dos microscopios electrónicos de barrido, uno de Emisión de Campo (FESEM) HITACHI SU8600, y otro de presión variable (VPSEM), HITACHI S-3500N. El SU8600, está equipado con los siguientes detectores: 2 de electrones secundarios, dos de retrodispersados y dos de rayos X por dispersión de energías (EDS, BRUKER QUANTAX XFlash 7) para la realización de microanálisis. Un detector STEM para campo claro y campo oscuro. El S-3500N dispone de un detector de secundarios, uno de retrodispersados, de un espectrómetro EDS (BRUKER QUANTAX 200 y detector XFlash 6/30) y de un crio-SEM (QUORUM PP3000T) para el estudio de muestras crio-fijadas. Preparación de muestras: secado por punto crítico (LEICA EM CPD300), metalización por sputtering con cromo, iridio u oro y evaporación de carbón (QUORUM Q150T Plus). 8 Microscopios Ópticos (OLYMPUS- BX40F4, OLYMPUS-BX61, LEITZ-DM IL, 2 NIKON-DIAPHOT-200, ZEISS-AXIOVERT, LEICA-DM IRB S8F, ZEISS-Colibri), la mayoría equipados con epifluorescencia.

La actividad principal del Servicio de Análisis Instrumental del ICVV consiste en proporcionar herramientas analíticas básicas para la selección, separación y análisis de metabolitos. Equipamiento actual: - Cromatógrafo Shimadzu Nexera-ABSciex 3200QTRAP, UHPLC-DAD-MS (tripleQ-trampa). - Cromatógrafo Waters Adquity I-Class- Detector DAD - Espectrometro de masas QToF Waters SYNAPT XS HDMS - Cromatógrafo Shimadzu Nexera UHPLC- DAD. - Cromatógrafo Shimadzu Prominence HPLC-FLUORESCENCIA-LIGHT SCATTERING. - GCMS - HPLC Preparativo Prestaciones generales: A Análisis cualitativo de analitos en mezclas complejas. B Análisis cuantitativo de analitos en mezclas complejas. C Análisis metabolomicos de mezclas complejas D Tratamiento de datos y preparación de informes E Utilización por el usuario. F Asesoramiento básico de la técnica. El Servicio no dispone de ninguna prestación acreditada, puesto que sus servicios están más orientados a la investigación

Estudio arqueológico y caracterización microscopica de materiales, preparción de muestras mediante metalización (Carbon y Au-Pd) y microanálisis mediante espectroscopia por energía dispersiva de rayos X (SEM-EDX)

El Servicio de Microscopía Electrónica del Centro de Estudios Avanzados de Blanes está disponible para la observación de muestras en el Microscopio Electrónico de Barrido (SEM) y la realización de microanálisis por dispersión de energía de Rayos X (EDS). Disponible para todos los investigadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), para otros centros públicos de investigación y para la empresa privada. Dispone de los equipos necesarios para la preparación de muestras y asesora a los usuarios, tanto en la preparación de muestras como en el manejo de los distintos equipos. Así mismo el servicio dispone de un formulario para tramitar e informar de posibles sugerencias o quejas con objeto de mejorar el servicio. Equipos: Hitachi SEM TM3000 Tabletop, EDS QUANTAX 70, Sputter Quórum Technologies Q150R S/E/ES Webpage: http://www.ceab.csic.es/web/?page_id=10691

Análisis cromatográficos de leche, productos lácteos, muestras biológicas y cultivos microbianos Equipación más importante: ACQUITY UPLC H-Class de Waters • Detector UV-visible (PDA), fluorescencia (FLR) y de dispersión de luz evaporativo (ELS) de Waters. HPLC Waters 2695. • Detector de índice de refracción RID 2414, de fotodiodos PDA 996 de Waters y de dispersión de láser multi-ángulo MALS Dawn Heleos-II de Wyatt HPLC Waters 2795 • Detector de fotodiodos PDA 2996 y de fluorescencia SFD 474 de Waters. CG Agilent GC 6890N • Detector de ionización de llama FID, espectrometría de masas 5975B inert MSD CG Agilent GC 8890N • Detector de espectrometría de masas 5977BMSD UPLC Agilent 1290 • Detector de espectrometría de masas LC-IM-QTOF 6560 Ion Mobility

Servicio de análisis de materiales arqueológicos que incluye: - Como servicios internos y externos: Captura y creación de modelos 3D, Análisis funcional de instrumentos líticos y en materias duras animales, Caracterización de materias primas líticas y determinación de su área fuente, y análisis de fitolitos. El servicio dispone, como equipamiento, de cámaras fotográficas réflex, escáner 3D, equipos de microscopía de altos y bajos aumentos, cubeta de ultrasonidos, campana extractora y equipo de toma y preparado de muestras.

EQUIPOS: VARIAN SYSTEM- 500 Equipo superconductor de 11.744 T, con sonda fría que permite disponer de una alta sensibilidad en los núcleos observados. Dispone de tres canales, una sonda de detección inversa con gradientes, una sonda multinuclear de detección directa y de una unidad de temperatura variable. BRUKER AVANCE III-400 Equipo superconductor de 9.395 T. Dispone de una sonda de detección inversa con gradientes, así como de una unidad de temperatura variable. JEOL JNM-ECZ400R Equipo superconductor de 9.395 T. Dispone de una sonda royal con gradientes, así como de una unidad de temperatura variable. VARIAN INOVA-300 Equipo superconductor de 7.046 T. Dispone de una sonda de detección inversa y una sonda multinuclear de detección directa, así como de una unidad de temperatura variable. Accesible a usuarios internos autorizados. BRUKER AVANCE-300 Equipo superconductor de 7.046 T . Dispone de una sonda de detección inversa y unidad de temperatura variable.

El equipamiento del Servicio de Espectrometría de Masas del CENQUIOR ofrece la posibilidad de realizar distintos tipos de análisis en función del modo de ionización elegido: impacto electrónico (EI), ionización química a presión atmosférica (APCI) o electrospray (ESI). Asimismo, en el caso de ESI y APCI permite la realización del análisis de la muestra mediante inyección directa o bien acoplada a cromatografía de líquidos. Equipos disponibles: - UHPLC-MS Cromatógrafo de líquidos LCMS2020 (Shimadzu) acoplado a espectrómetro de masas con analizador tipo cuadrupolo. CARACTERÍSTICAS: Rango de masas: 10-2000 u. Fuentes de ionización: ESI APCI - HP 5973-MSD (Fuera de servicio desde mayo de 2024). Espectrómetro de masas con analizador tipo cuadrupolo para la inyección directa de muestras. CARACTERÍSTICAS: Rango de masas: 100-800 u. Sonda de inyección directa

Usando técnicas de extracción adecuadas, en el Servicio se realiza la cuantificación de elementos biodisponibles, asimilables y contaminantes inorgánicos en suelos, plantas y otros materiales. Igualmente se cuantifican elementos metálicos y aniones en muestras líquidas de extractos y aguas de origen natural y residual. También es posible realizar determinaciones de materia orgánica, nitrógeno orgánico en suelos y plantas, pH, conductividad eléctrica y granulometría en suelos.