- Áreas de investigación
-
- Biología y Biomedicina
- Grupo
-
- Consultoría y Calidad y Seguridad y Difusión
- Análisis y Métodos Biológicos
- Subgroup
-
- Consultoría
- Identificación
Molecular identification of species
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
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LABORATORIO DE ECOLOGÍA MOLECULAR y ECOFISIOLOGÍA (LEMF) EBD - Sevilla |
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Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb) IBB - Barcelona |
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Metabolómica y Genómica Vegetal EEAD - Zaragoza |
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Servicio de análisis moleculares en cultivos frutales IHSM - Algarrobo |
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Servicio de biología molecular COMA - Málaga |
Service general data
- Support unit: LABORATORIO DE ECOLOGÍA MOLECULAR y ECOFISIOLOGÍA (LEMF)
- Institute: ESTACION BIOLOGICA DE DOÑANA
- Locality: Sevilla (Sevilla)
- Service's web: http://www.ebd.csic.es/
Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de ecología molecular: identificar el sexo de los individuos, identificar individuos de poblaciones salvajes mediante sus heces, determinar relaciones de parentesco entre individuos, detectar cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilizar marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos. Los marcadores nucleares se pueden desarrollar, optimizar y tipar para conocer mejor las relaciones entre individuos, poblaciones y especies. Se ofrece asimismo la posibilidad de secuenciar tanto genes diana mediante secuenciación Sanger como secuenciación de nueva generación de genomas enteros para estudios de genética poblacional, genética funcional y filogenias. las técnicas basadas en ARN están actualmente en expansión
Molecular identification of species
Benefit description
In Molecular Biology there are different methods that allow the identification of species. In LEM, they are carried out mainly by specific PCR and amplicon sequencing. Given the close link between the laboratory and protocols for collecting samples in suboptimal conditions: field and museum samples, it is common for the samples to come from biological remains with scarce and / or degraded DNA. For their processing, the laboratory has the work protocols and the necessary infrastructure to properly process these samples. Specifically, the laboratory has a fully equipped room isolated from the rest that avoids contamination from higher quality genetic material or PCR products. In the case of fossil remains, the center has an ancient DNA laboratory described in the corresponding section| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies 6-48 muestras €/muestra | muestra | 32.67 € | 35.78 € |
| identificación molecular de especies mas de 49 mue €/muestra | muestra | 28.91 € | 31.67 € |
| identificación molecular de especies 1-5 muestras €/muestra | €/muestra | 35.16 € | 38.5 € |
Other services
- Análisis antioxidante métodos de radicales libres
- Análisis bioquímicos clínicos
- Biología Molecular: Amplificación de material genético (PCR, qPCR)
- Citometría de flujo
- Determinación molecular del sexo
- Identificación genética, paternidad, trazabilidad y genotipificación
- Inmunoensayo
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Resistencia a antibacterianos
- Técnicas ELISA
- Tratamiento muestra: Extracción
- Preparación de muestras
- Fragmentación de DNA
Service general data
- Support unit: Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb)
- Institute: INSTITUTO BOTANICO DE BARCELONA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://www.ibb.csic.es/
Con el objetivo de maximizar la transferencia de tecnología a las empresas, a otras instituciones de investigación y a la sociedad en general, el IBB creó en 2013 una unidad de servicios (CertIBB). Esta unidad ofrece servicios de formación, análisis y consultoría basados en su personal científico y técnico y sus instalaciones especializadas. El servicio de certificaciones y análisis del IBB tiene la misión de proporcionar a otros centros de investigación, empresas y a la sociedad en general, una serie de herramientas y técnicas moleculares y taxonómicas, así como la prestación de consultoría y formación a través de los servicios. Para ello, el IBB dispone de personal científico y técnico de experiencia probada, de un herbario de referencia con 800000 pliegos, una biblioteca especializada, laboratorios completamente equipados, cámaras de cultivo, invernaderos y mariposario.
Molecular identification of species
Benefit description
MOLECULAR IDENTIFICATION OF INSECTS AND PLANTS 1. INSECTS Description: The genetic barcode (DNA barcode) technique has revolutionized the exploration of the biodiversity of megadiverse groups such as insects, largely complementing the classical taxonomic identification criteria. The Molecular Insect Identification service offers the genetic characterization of insect tissue samples and their identification at the species level. Service offered: - DNA extraction from insect tissue samples (total or partial), including any stage of development: eggs, larvae, pupae, adults, as well as exuviae or feces. - Amplification and obtaining of sequences of the fragment of the mitochondrial gene cytochrome oxidase I (COI) - Alignment of sequences obtained with insect COI database repositories. - Identification at the species level according to criteria of genetic similarity. - Complementation of molecular identifications with taxonomic criteria based on morphology, ecology or distribution. 2. PLANTS Description: The DNA barcoding technique has revolutionized the exploration of biodiversity in plant groups, by complementing classical taxonomic identification criteria. The molecular identification service for plants offers genetic characterization of tissue samples (preferably from leaves or other green parts of the plant, but it is also possible from other tissues such as flowers, and even from dried material coming from herbarium sheets) at the species level. We are specialized in the Molecular Identification of allochthonous and invasive plant species, which is especially relevant for the plant production and distribution sector, in natural spaces, or in the productivity of agricultural operations. Service offered: - DNA extraction from samples of plant tissues. - Amplification and obtaining of "barcode" sequences, both plastidial and nuclear, among others: the rbcL gene (rubisco large subunit), the matK gene (maturase K), or the ITS (intergenic spacer) region of ribosomal DNA. These regions are especially useful due to their variability among species and their ability to identify them accurately. Additionally, they are short enough to be sequenced relatively easily, making them ideal for rapid and precise identification of plant speciess - Alignment of the obtained sequences with specific databases. - Identification at the species level based on genetic similarity criteria. - Complementation of molecular identifications with taxonomic criteria based on morphology, ecology, or distribution.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Identificación molecular de especies de insectos CTAB | € / 10 muestras | 591.18 € | 647.48 € |
| Identificación molecular de especies de insectos kit | € / 10 muestras | 626.52 € | 686.19 € |
| Identificación molecular de especies de plantas kit | € / 10 muestras | 626.58 € | 686.25 € |
| Identificación molecular de especies de plantas CTAB | € / 10 muestras | 591.23 € | 647.54 € |
Service general data
- Support unit: Metabolómica y Genómica Vegetal
- Institute: ESTACION EXPERIMENTAL AULA DEI
- Locality: Zaragoza (Zaragoza)
- Service's web: http://www.eead.csic.es/
Se ofrecen análisis de metabolitos y material genético en muestras vegetales. Se dispone de instrumentación, programas informáticos, bases de datos, protocolos, información, experiencia y conocimientos técnicos. La plataforma metabolómica, consistente en un UHPLC-MS Q-TOF y paquetes bioinformáticos, fue instalada en junio del 2021. La sección de genómica esta especializada en la aplicación y desarrollo de herramientas moleculares útiles para la mejora genética de cebada, especies frutales y vid. Las prestaciones disponibles son: - Análisis metabolómico mediante LC-Q/TOF MS - Análisis bioinformático de los resultados de metabolómica - Análisis HPLC-MS - Análisis de compuestos por UHPLC-MS-MS-Q-TOF - Estudios de DNA y RNA - Estudios de expresión génica: microchips de DNA y RT-PCR, ddPCR - Genotipificación, SNP, CNV - Asesoramiento de biología molecular en proyectos de mejora vegetal - Identificación molecular de especies - Identificación molecular de poblaciones
Molecular identification of species
Benefit description
Functional genomics services can include, from the design of primers and analysis for candidate genes of interest, to differential gene expression in plants grown under stress conditions (iron-induced chlorosis, drought, etc.), or combined stress due to drought and climate change (elevated CO2, and temperature, and limited water availability)| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies €/muestra | muestra | 382.96 € | 419.43 € |
Other services
Service general data
- Support unit: Servicio de análisis moleculares en cultivos frutales
- Institute: INSTITUTO DE HORTOFRUTICULTURA SUBTROPICAL Y MEDITERRANEA LA MAYORA
- Locality: Algarrobo (Málaga)
- Service's web: http://www.ihsm.uma-csic.es/
El servicio de análisis molecular en cultivos frutales, es un apoyo a la investigación en el centro. Se encuentra ubicado en la Estación Experimental La Mayora, Algarrobo-Costa, dentro de la comarca de la Axarquía, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción con numerosas empresas del sector agrícola, así como la colaboración con diferentes grupos de investigación del mismo sector. El objetivo principal del Servicio es prestar soporte científico y tecnológico para el análisis molecular de diferentes cultivos frutales a grupos de investigación y a diferentes empresas del sector agrícola que así lo requieran, en el ámbito nacional e internacional.
Molecular identification of species
Benefit description
The service has three labs; in the first lab DNA extraction is performed; in the second lab PCR are carried out and in the third one fragment analyses are done using Fragment Analyzers.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Caracterización molecular de especies €/muestra | €/muestra | 23.57 € | 25.82 € |
Service general data
- Support unit: Servicio de biología molecular
- Institute: CENTRO OCEANOGRAFICO DE MALAGA
- Locality: Málaga (Málaga)
- Service's web: http://www.ieo.es/malaga
El Centro Oceanográfico de Málaga (COMA) del Instituto Español de Oceanografía (IEO) cuenta entre sus instalaciones con un laboratorio de biología molecular y genética cofinanciado por el fondo europeo de desarrollo regional, y dotado de un conjunto de instrumentos que permiten aplicar técnicas de biología molecular a muestras biológicas y ambientales. El personal asociado al laboratorio tiene formación y amplia experiencia en biología molecular aplicada a recursos vivos marinos. Este conjunto de recursos materiales y humanos constituyen el servicio de biología molecular del COMA que presta apoyo a la investigación y el asesoramiento en ciencias marinas.
Molecular identification of species
Benefit description
Genetic identification of tissue samples from marine fish. The service includes DNA extraction, PCR amplification of mitochondrial or nuclear molecular marker, and taxonomic classification according to the molecular characterization of the sample. Check availability and delivery time for results depending on the species to be characterized.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Identificación molecular de especies de peces marinos | 12 muestras | 751.34 € | 822.89 € |