Extraction, purification or quantitation of DNA and RNA samples

El servicio de transgenesis es una unidad compartida entre el CNB y CBMSO e integrada en el Campus Internacional de Excelencia UAM+CSIC. Su mision es apoyar a los grupos de investigación en la creación establecimiento o intercambio de estirpes de raton genéticamente alteradas. La unidad ofrece asesoramiento cientifico y técnico para la obtención del modelo de raton mas adecuado, bien por transgénesis aditiva o mutagénesis dirigida (modelos KO, KI o condicionales) con células ES o mediante edicion genetica (CRISPR). La unidad también realiza rederivaciones sanitarias para incorporar lineas procedentes de intercambios cuyo estado sanitario impide la entrada directa, genotipaciones bajo demanda, edicion genetica de lineas celulares y obtencion de embriones y líneas ES. Se cuenta con un laboratorio de microinyección y electroporacion, laboratorio de cultivo de células ES y laboratorio de biologia molecular, asi como espacio asignado en los animalarios de ambos centros CNB y CBMSO.

El Servicio de Genómica del CNB es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.

En el Servicio de Biología Molecular Marina se desarrolan diferentes técnicas de biología molecular basadas en el estudio de los ácidos nucléicos de organismos marinos. El servicio consta de quatro termocicladores, equipos de electroforesis, equipo qPCR (Cfx, Biorad), equipo para geles PFGE (CHEF DR-II, Biorad), equipo Gel Doc con software de análisis (iBright CL 1500, Invitrogen), fluorómetro (Qubit Q32857, Invitrogen), espectrofotómetro UV-Vis (NanoDrop One,Thermo Scientific) y analizador de biomoléculas (QSep100, Bio Optic) Además, consta de otros equipos necesarios como centrífugas, horno de hibridación, baño térmico, incubador térmico, desecador con bomba de vacío, campanas de flujo laminar, microondas, vórtex y placa agitadora/calefactora, entre otros, para el desarrollo de los diferentes protocolos.

La Unidad de Genómica es parte integrante de los Servicios de Apoyo a la Investigación del centro. Se encuentra ubicada en el PT de Ciencias de la Salud de Granada, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción científica con multitud de grupos de investigación en el sector biosanitario. El objetivo principal de la Unidad es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica. Entre los servicios ofertados se cuentan: secuenciación de DNA, análisis de fragmentos de DNA, purificación automática de ácidos nucléicos, síntesis de oligonucleótidos y análisis de calidad de RNA. Asímismo, la Unidad desempeña labores de formación y asesoramiento del personal investigador y colabora activamente en tareas de divulgación científica.

El Laboratorio de Sistemática Molecular (LSM) del Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC), se creó en 1997 con la finalidad de aplicar técnicas de biología molecular al estudio de la biodiversidad vegetal y fúngica desde tres disciplinas principales: 1.Sistemática (Taxonomía y Filogenia) 2.Biología Evolutiva 3.Ecología La incorporación de la biología molecular en los estudios sistemáticos, ha contribuido a ampliar la comprensión de la historia evolutiva (Biogeografía, Ecología Evolutiva, Biología de la Conservación). Desde su creación el LSM ha sido un apoyo fundamental clave en la producción científica, que incluye un gran número de artículos científicos en revistas de alto impacto. Las técnicas en biología molecular utilizadas en el laboratorio : • Extracción de ADN de plantas y hongos • Amplificación de ADN nuclear y citoplásmico mediante PCR • Purificación de productos amplificados • Clonación de genes • Técnicas fingerprinting RFLP, AFLP, etc

Este laboratorio tiene como objetivo ofrecer a los usuarios, tanto del CSIC como de otras instituciones, el acceso a técnicas genéticas y genómicas innovadoras, así como el análisis de una amplia gama de variables bioquímicas y metabólicas que permiten conocer distintos parámetros fisiológicos. Destaca además la reciente construcción de un nuevo laboratorio de Nivel 2 de Bioseguridad, que ha ampliado las capacidades de investigación y permitido trabajar con agentes biológicos más peligrosos. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de la ecología molecular, así como investigaciones sobre las adaptaciones fisiológicas y metabólicas que las especies deben realizar para enfrentar patógenos, contaminantes y otros factores ambientales. El estudio de la genética y genómica de los organismos permite conocer cómo están codificadas dichas adaptaciones a nivel molecular y cuál es el papel de las misma

Este servicio dispone de la infraestructura necesaria para implementar protocolos de Barcoding, Metabarcoding y Metagenómica. Se ofrecen los siguientes servicios: i) Extracción, purificación y cuantificación de ADN ii) Barcoding de metazoa iii) Metabarcoding de Metazoa iv) preparación de librerías ddRADseq. Equipamiento disponible: KingFisher Flex, Tecan Feedom EVO 150 workstation, Infinite® MNano+, Agilent Bioanalyzer 2100, BluePippin

El Servicio de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.

La secuenciación masiva (Next Generation Sequencing) permite estudiar los genomas a un nivel de resolución imposible de abordar con las tecnologías de genómica tradicionales. La secuenciación masiva permite: • Secuenciación rápida de genomas completos (reordenamientos y duplicaciones). • Mayor profundidad en el análisis de regiones diana específicas para la detección de variantes poco frecuentes. • Secuenciación de transcriptomas completos y detección de variantes de RNA y sitios de procesamiento alternativo. • Análisis de metilomas completos o de interacciones del DNA con proteínas. • Estudio de la diversidad microbiana en humanos o en el medio ambiente

El servicio emplea técnicas moleculares para abordar fundamentalmente el estudio de procesos evolutivos, centrados en la Sistemática (taxonomía y filogenia) y el análisis de variación genética para determinar la estructura poblacional, en la mayoría de los casos, con fines de conservación y gestión de especies. De esta forma, el laboratorio está preparado para conservar las muestras de estudio, extraer ácidos nucleicos (ADN y ARN) y proteínas, amplificar por PCR y clonación, analizar geles, preparar las muestras para su secuenciación, o analizar a tiempo real la amplificación de distintos marcadores moleculares. Aunque el laboratorio ha sido concebido para ser un servicio de usuarios, sus técnicos están preparados para dar formación, orientación y colaborar en el desarrollo de distintos estudios. De esta forma, visitantes de otros centros, apoyados por el personal del MNCN, tienen acceso al uso de este laboratorio.

El servicio de edición genética de ratón es una unidad compartida entre el CNB y CBMSO e integrada en el Campus Internacional de Excelencia UAM+CSIC. Su misión es apoyar a los grupos de investigación en la creación de líneas de ratón genéticamente alteradas. La unidad ofrece asesoramiento científico y técnico para la obtención del modelo de ratón más adecuado, bien por transgénesis aditiva o mutagénesis dirigida (modelos KO, KI o condicionales) con células ES o mediante edición genética (CRISPR). La unidad también da apoyo al animalario del CBM en rederivaciones sanitarias para incorporar lineas procedentes de intercambios cuyo estado sanitario impide la entrada directa, genotipaciones bajo demanda, edición genética de líneas celulares y obtención de embriones y líneas ES. Se cuenta con un laboratorio de microinyección y electroporacion, laboratorio de cultivo de células ES y laboratorio de biología molecular, así como espacio asignado en los animalarios de ambos centros CNB y CBM

El Servicio de Toxicogenómica Ambiental ofrece un equipamiento y un personal altamente especializado que permite la aplicación de varias técnicas: • Extracción y cuantificación de ARN y ADN • Control de calidad de ARN • Electroforesis en gel de agarosa • Detección de genes • Análisis de expresión génica • Análisis de variación genética. Además, el STA ofrece la posibilidad de estudiar la toxicidad de un compuesto, mezcla o muestra siguiendo las pautas de la OCDE, como Ensayo de Toxicidad Aguda en Embriones de Pez Zebra; Test de Reproducción en Daphnia magna; Test de inmovilización aguda en Daphnia sp.; y Test de inhibición del crecimiento en algas. Además, el STA ofrece una plataforma de lipidómica para analizar al composición en lípidos de muestras biológicas, que incluye extracción, análisis y procesado de datos. También se ofrecen ensayos in-vitro (lineas celulares de peces y humanas) para detectar disruptores endocrinos que modulan el balanc

El Servicio científico-Técnico de Genotipado Molecular es un servicio de creación reciente en el IPE-CSIC, diseñado para la realización de trabajos moleculares y asesoría cualificada. El servicio está orientado a trabajos de metabarcoding, filogenias moleculares, genética de poblaciones, biogeografía, transcriptómica, etc... y para ello se ofrecen servicios específicos de extracción de ADN en diferentes modalidades, cuantificación de ácidos nucleicos y asesoría científico técnica. El Servicio C-T de Genotipado Molecular dispone del equipamiento básico necesario para poner a punto técnicas de trabajo con ADN (extracción, cuantificación y amplificación), así como la preparación del material orientado a técnicas de Secuenciación de Nueva Generación (preparación de librerías, incubaciones de restricción o hibridaciones y enriquecimientoS). Actualmente, los análisis de genotipado molecular son una herramiento básica en botánica, ecología o zoología.

El Servicio de Citometría (SGC) es una plataforma de investigación común de uso abierto a todos los miembros del Instituto (Centro de Investigación del Cáncer) así como a otros grupos clínicos y de investigación externos. Su objetivo es apoyar la investigación y la educación en citometría. Las actividades más relevantes incluyen el análisis y clasificación celular con fines de investigación, con más de 50 técnicas diferentes actualmente establecidas y disponibles en el área de inmunofenotipado, análisis del ciclo celular, apoptosis, resistencia a fármacos y cribado, cuantificación de proteínas fosforiladas y sus vías de señalización intracelular asociadas, entre otras. Además, proporciona pruebas de apoyo al diagnóstico de cáncer que sirven de plataforma común para el diagnóstico inmunofenotípico de leucemias y linfomas para el RTICC español del Instituto de Salud Carlos III. Paralelamente, en el SGC hay varios proyectos de investigación en curso orientados a la tecnología.

El servicio de Biología Molecular Marina del IEO de A Coruña permite la aplicación de técnicas de biología molecular basadas en el análisis del contenido de ácidos nucleicos (ADN y ARN) y las secuencias de nucleótidos que representan la estructura de dichos ácidos nucleicos, que nos permiten analizar su identidad (ADN), actividad (ARN) y el rol en el funcionamiento de los ecosistemas marinos. Además, se preparan las muestras para analizar genes específicos (ejemplos de trabajos de investigaciones previas: amoA, nifH) para estudiar su función en procesos biológicos clave en ecosistemas marinos. Este servicio da soporte a los investigadores del COAC-A Coruña del Centro Nacional del Instituto Español de Oceanografía (IEO) y de otros centros del IEO, así como a usuarios externos, y también ofrece formación de estudiantes. El responsable del laboratorio es el encargado de garantizar el equipamiento, recursos técnológicos y materiales para el procesado de las muestras.

El Servicio de Genómica fue creado en el año 1994 para apoyar con técnicas genómicas la tarea investigadora del personal del IIBm. Además, nuestro laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico. El Servicio dispone de un sistema de gestión de calidad conforme con la Norma UNE-EN ISO 9001:2000. El Servicio pertenece a la red de laboratorios de la CAM. Nº de registro:281.

La Unidad de Biología Molecular forma parte de los Servicios Científico-Técnicos del Centro de Neurociencias Cajal (CNC). Su objetivo es proporcionar infraestructura, equipamiento y apoyo científico-técnico especializado para impulsar la investigación en Biología Molecular y favorecer el desarrollo de nuevas metodologías y tecnologías. La Unidad ofrece servicios para la obtención, manipulación y caracterización de ácidos nucleicos, adaptados a las necesidades de grupos de investigación, organismos públicos y entidades privadas. Entre sus prestaciones se incluyen la extracción y purificación de ADN y ARN, la amplificación y cuantificación mediante PCR convencional, PCR a tiempo real (qPCR) y PCR digital (dPCR), la clonación y análisis de constructos genéticos, el genotipado de animales y el análisis de datos moleculares. Asimismo, proporciona asesoramiento técnico en diseño experimental, selección de metodologías e interpretación de resultados.

En el Servicio de Genómica del Instituto de Biología Evolutiva (IBE) utilizamos técnicas de biología molecular convencionales y de vanguardia para facilitar el análisis y caracterización de genes y material genético de cualquier organismo. Nuestro objetivo es el de ayudar a comprender el funcionamiento del genoma y su influencia en la evolución de la vida, así como su papel en la salud.

El Centro Oceanográfico de Málaga (COMA) del Instituto Español de Oceanografía (IEO) cuenta entre sus instalaciones con un laboratorio de biología molecular y genética cofinanciado por el fondo europeo de desarrollo regional, y dotado de un conjunto de instrumentos que permiten aplicar técnicas de biología molecular a muestras biológicas y ambientales. El personal asociado al laboratorio tiene formación y amplia experiencia en biología molecular aplicada a recursos vivos marinos. Este conjunto de recursos materiales y humanos constituyen el servicio de biología molecular del COMA que presta apoyo a la investigación y el asesoramiento en ciencias marinas.

Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan para hacer frente a las necesidades del las diferentes lineas y proyectos de investigación del IEO con diferentes objetivos que abarcan : la identificación de especies, determinación del sexo de los individuos, determinación de relaciones de parentesco entre individuos, asignación de paternidad, detección de cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilización de marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos, y caracterización de comunidades microbianas.