Apoyo en el procesado y análisis de datos

El Servicio de Microscopía Confocal y Electrónica de Transmisión (CTEM) tiene como finalidad satisfacer la creciente demanda de los investigadores del Centro en este ámbito. El Servicio pretende organizar, gestionar, optimizar y fomentar el uso de los grandes equipos de microscopía disponibles en el Instituto. También facilita la preparación estándar de las muestras antes de su observación. El Servicio está disponible tanto para los investigadores de las sublíneas de investigación de la EEZ (servicio interno) como para otras instituciones académicas y comerciales (servicio externo).

El catálogo de servicios que ofrecemos incluye: [1] Desarrollo de software para el análisis y anotación de resultados de experimentos de secuenciación masiva [2] Ultrasecuenciación: Determinación de regiones enriquecidas en experimentos ChIP-seq. [3] Modelado de estructura de proteínas y ácidos nucleicos. [4] Herramientas para la exploración y análisis interactivo de datos [5] Consultoría y Servicios de datos climáticos Los usuarios interesados en estos servicios deben contactar con los responsables por medio del correo electrónico: compbio@eead.csic.es

Este servicio ofrece al Sistema Nacional de Salud y a centros medicos privados nacionales e internacionales, una plataforma altamente especializada para el estudio de la longitud telomérica, su regulación y el análisis de mutaciones asociadas con acortamiento telomérico. El servicio esta especializado en telomeropatías, especialmente disqueratosis congenita, anemia aplásica y fibrosis pulmonar.

Muestreo de organismos, análisis y gestión de datos relacionado con la actividad pesquera. Este servicio científico-técnico deriva de las actividades regulares del “Servei d’Assessorament en Pesca” de ICATMAR. El objetivo principal de este organismo es dar asesoramiento en materia de gestión pesquera a las administraciones públicas, tanto las autonómicas, estatales o europeas. El asesoramiento se basa en la recopilación de datos científicos tanto a través de muestreos de campo de datos pesqueros históricos. Este servicio pone a disposición la infraestructura creada para el asesoramiento a las administraciones para otros proyectos de investigación o entidades, tanto públicas como privadas en el marco de este servicio científico-técnico. Las cuatro grandes prestaciones ofrecidas son: recogida de muestras de campo a bordo de embarcaciones pesqueras, integración y distribución de datos pesqueros, asesoramiento en análisis de datos y asesoramiento en gestión pesquera.

"La ciencia de los datos se ha convertido en un cuarto camino para el descubrimiento científico, además de la experimentación, la modelización y la computación" Provost Martha Pollack Los datos en ciencia son el inicio de la investigación. Extraer información de los datos estructurados (BBDD normalizadas) y datos no estructurados (listados). Consultas a BBDD relacionales usando SQL. Recopilar datos no estructurados mediante web scraping, API y encuestas. Sofisticados métodos analíticos, aprendizaje automático y métodos estadísticos para preparar datos para su modelado predictivo y prescriptivo. Limpiar datos para descartar información irrelevante y prepararlos para preprocesamiento y modelado. Análisis de datos exploratorio para determinar los datos que faltan y buscar tendencias. Comunicar predicciones y hallazgos a gestores y TIC a través de visualizaciones de datos e informes efectivos. Servicios de SIG y cartografía e IDEs. FAIR https://doi.org/10.1038/sdata.2016.18

El Servicio CT del IPE_CSIC es el de Modelización y SIG, que desarrolla técnicas que permiten la manipulación de datos digitales georreferenciados de variables cualitativas o cuantitativas relativas al medio físico o al entorno humano y distribuirlos espacialmente. Su finalidad es proporcionar a los investigadores del Centro la infraestructura necesaria para la realización de cartografía asociada a sus proyectos de investigación, relacionada con patrones de distribución espacial y que necesiten una referencia geoespacial. Los sistemas de información geográfica y la teledetección constituyen en la actualidad herramientas imprescindibles para la adquisición, procesamiento y análisis de la información espacial. Además, la disponibilidad de una serie temporal de información de alta resolución (imágenes de satélite, ortofotos y fotografías aéreas) está permitiendo introducir la variable temporal en los estudios espaciales.

El laboratorio está dedicado al análisis de datos de estudios de metabolómica dirigida y no dirigida, obtenidos mediante técnicas cromatográficas y espectroscópicas. El pre-procesado de datos se realiza mediante un flujo de trabajo que comienza con 1) la detección y deconvolución de las señales obtenidas, mediante algoritmos adecuados y su alineado, 2) la normalización y transformación de los datos pre-procesados y 3) la obtención de la matriz de datos 1D, 2D o 3D. Posteriormente, se realiza el estudio estadístico adecuado (univariado, multivariado, PCA, PLS-DA, clúster...) para obtener una visualización espacio-temporal de los datos. Finalmente, el servicio ofrece la aplicación de técnicas de visualización de datos para diseñar la representación gráfica idónea que permita la exposición de la información adquirida.