Determinación molecular del sexo

Este laboratorio tiene como objetivo ofrecer a los usuarios, tanto del CSIC como de otras instituciones, el acceso a técnicas genéticas y genómicas innovadoras, así como el análisis de una amplia gama de variables bioquímicas y metabólicas que permiten conocer distintos parámetros fisiológicos. Destaca además la reciente construcción de un nuevo laboratorio de Nivel 2 de Bioseguridad, que ha ampliado las capacidades de investigación y permitido trabajar con agentes biológicos más peligrosos. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de la ecología molecular, así como investigaciones sobre las adaptaciones fisiológicas y metabólicas que las especies deben realizar para enfrentar patógenos, contaminantes y otros factores ambientales. El estudio de la genética y genómica de los organismos permite conocer cómo están codificadas dichas adaptaciones a nivel molecular y cuál es el papel de las misma

El servicio emplea técnicas moleculares para abordar fundamentalmente el estudio de procesos evolutivos, centrados en la Sistemática (taxonomía y filogenia) y el análisis de variación genética para determinar la estructura poblacional, en la mayoría de los casos, con fines de conservación y gestión de especies. De esta forma, el laboratorio está preparado para conservar las muestras de estudio, extraer ácidos nucleicos (ADN y ARN) y proteínas, amplificar por PCR y clonación, analizar geles, preparar las muestras para su secuenciación, o analizar a tiempo real la amplificación de distintos marcadores moleculares. Aunque el laboratorio ha sido concebido para ser un servicio de usuarios, sus técnicos están preparados para dar formación, orientación y colaborar en el desarrollo de distintos estudios. De esta forma, visitantes de otros centros, apoyados por el personal del MNCN, tienen acceso al uso de este laboratorio.

El servicio utiliza técnicas moleculares básicas de trabajo con ácidos nucleicos para identificar especies animales o genes nucleares o mitocondriales. Básicamente se extrae ADN por medio de diferentes protocolos, específicos para cada tipo de tejido o taxon y las secuencias se amplifican por PCR con cebadores ya publicados o de nuevo diseño, se visualizan y purifican. La secuenciación o análisis de fragmentos se realizan en servicios externos al MNCN pero se ensamblan, se interpretan los resultados y se emite un informe del análisis. En numerosas especies la identificación se realiza por barcoding (COI). La determinación molecular del sexo, el análisis poblacional o de paternidad se realiza después de un estudio previo sobre conocimiento publicado de cada especie. Las muestras de tejido, pequeños especímenes o partes de ellos y ADN pueden ser preparado para su preservación en seco a temperatura ambiente y/o transporte por medio de liofilización.

El servicio ofrece apoyo a la investigación y asesoramiento en el empleo de técnicas moleculares para abordar cuestiones evolutivas, biogeográficas, ecológicas y de conservación y gestión de la biodiversidad. El servicio está preparado para la conservación de muestras de estudio (invasivas y no invasivas), extracción de ADN/ARN, puesta a punto y optimización de marcadores, amplificación por PCR, realización de electroforesis y análisis de geles, y preparación de muestras para su posterior secuenciación/genotipado. Igualmente, se ofrece servicio de análisis bioinformáticos a partir de los resultados obtenidos, así como asesoramiento y colaboración a la hora de interpretar los resultados. El servicio está concebido para colaborar activamente en el desarrollo de distintos estudios relacionados con la ecología molecular. Se ofrece, además, la posibilidad de realizar muestreos de campo para la toma de muestras biológicas y su posterior análisis en el laboratorio.

Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan para hacer frente a las necesidades del las diferentes lineas y proyectos de investigación del IEO con diferentes objetivos que abarcan : la identificación de especies, determinación del sexo de los individuos, determinación de relaciones de parentesco entre individuos, asignación de paternidad, detección de cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilización de marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos, y caracterización de comunidades microbianas.