DNA sequencing

El Servicio de Secuenciación del IBMCP satisface las necesidades de secuenciación de muestras de ADN que la actividad investigadora de los diversos grupos de este centro y otros de la Comunidad Valenciana genera. Además, cuenta con el equipamiento necesario para abordar estudios relacionados con la expresión génica, la caracterización alélica, la actividad enzimática o el nivel de ploidía de especies de interés ( q-PCR, lectores fosforimager, equipos con cámaras CCD para captura de imágenes fluorescentes y quimioluminiscentes, espectrofotómetros)

La Unidad de Genómica es parte integrante de los Servicios de Apoyo a la Investigación del centro. Se encuentra ubicada en el PT de Ciencias de la Salud de Granada, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción científica con multitud de grupos de investigación en el sector biosanitario. El objetivo principal de la Unidad es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica. Entre los servicios ofertados se cuentan: secuenciación de DNA, análisis de fragmentos de DNA, purificación automática de ácidos nucléicos, síntesis de oligonucleótidos y análisis de calidad de RNA. Asímismo, la Unidad desempeña labores de formación y asesoramiento del personal investigador y colabora activamente en tareas de divulgación científica.

El servicio utiliza técnicas moleculares básicas de trabajo con ácidos nucleicos para identificar especies animales o genes nucleares o mitocondriales. Básicamente se extrae ADN por medio de diferentes protocolos, específicos para cada tipo de tejido o taxon y las secuencias se amplifican por PCR con cebadores ya publicados o de nuevo diseño, se visualizan y purifican. La secuenciación o análisis de fragmentos se realizan en servicios externos al MNCN pero se ensamblan, se interpretan los resultados y se emite un informe del análisis. En numerosas especies la identificación se realiza por barcoding (COI). La determinación molecular del sexo, el análisis poblacional o de paternidad se realiza después de un estudio previo sobre conocimiento publicado de cada especie. Las muestras de tejido, pequeños especímenes o partes de ellos y ADN pueden ser preparado para su preservación en seco a temperatura ambiente y/o transporte por medio de liofilización.

El Laboratorio de Sistemática Molecular (LSM) del Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC), se creó en 1997 con la finalidad de aplicar técnicas de biología molecular al estudio de la biodiversidad vegetal y fúngica desde tres disciplinas principales: 1.Sistemática (Taxonomía y Filogenia) 2.Biología Evolutiva 3.Ecología La incorporación de la biología molecular en los estudios sistemáticos, ha contribuido a ampliar la comprensión de la historia evolutiva (Biogeografía, Ecología Evolutiva, Biología de la Conservación). Desde su creación el LSM ha sido un apoyo fundamental clave en la producción científica, que incluye un gran número de artículos científicos en revistas de alto impacto. Las técnicas en biología molecular utilizadas en el laboratorio : • Extracción de ADN de plantas y hongos • Amplificación de ADN nuclear y citoplásmico mediante PCR • Purificación de productos amplificados • Clonación de genes • Técnicas fingerprinting RFLP, AFLP, etc

La labor de la Unidad de Microbiología consiste en ofrecer apoyo en investigación en el ámbito de la microbiología clásica y molecular, enfocado fundamentalmente a procariotas y levaduras. La Unidad está capacitada para resolver dudas técnicas, aportar ideas, ofrecer orientación para diseño de experimentos, instruir a nuevo personal y colaborar con los diferentes grupos en sus respectivos proyectos poniendo a disposición de todo el que lo necesite el conocimiento, la experiencia o los equipos disponibles. Los servicios ofertados son: * Caracterización de procariotas y levaduras a nivel molecular (RAPD,REP, RISA...) * Identificación por secuenciación ADNr * Preparación muestras para NGS (secuenciación y anotación) * Aislamiento y crioconservación de cepas * Microscopía óptica y fluorescencia (microorganismos, aceite, leche...) * Recuentos de microorganismos * Test de desafío * Test crecimiento / inhibición

El servicio de secuenciación del CISA permite potenciar los estudios moleculares dirigidos a la diagnosis y prevención de patógenos animales de alto riesgo y con gran impacto económico; así como también los estudios moleculares derivados de la investigación básica. El laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico.