- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
-
- Genómica
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
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CIB - Madrid |
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IATA - Paterna |
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CBM - Madrid |
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IPBLN - Armilla |
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IDAEA - Barcelona |
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IIBM - Madrid |
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LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS IC - Madrid |
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CISA - Valdeolmos-Alalpardo |
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IBMCC - Salamanca |
Service general data
- Support unit: PROTEÓMICA Y GENÓMICA
- Institute: CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS MARGARITA SALAS
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.cib.csic.es/es/servicio.php?iddepartamento=29
PROTEÓMICA El equipamiento actual del Servicio es el siguiente: 2 unidades de isoelectroenfoque Protean IEF cell (BIO-RAD), para la primera dimensión de los geles 2D en tiras de 7 cm de diferentes rangos de pH: 3-10 no lineal, 3-10-lineal y 4-7 lineal. 1 Cubeta multigel Miniprotean Dodecacell (BIO_RAD), para la electroforesis simultánea de hasta 12 geles de 8 x 7 cm. Espectrómetro de masas MALDI-TOF-TOF Autoflex III (Bruker).. Espectrómetro de masas Q-Exactive (Thermo Scientific) dotado de una fuente de ionización nano conectada en línea a un nano-UPLC Easy-LC 1000.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
The Agilent TapeStation 4150 is a System for DNA and RNA samples Quality Control by automated electrophoresis. This platform includes the instrument, software data processing, reagents and ScreenTape devices to analyze sample size, quantity and integrity.The device offers an evaluation analysis of great accuracy and precision.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Tape Station RNA y DNA Sensibilidad Estandar (chip) | € / chip | 85.16 € | 93.27 € |
| Tape Station RNA y DNA Alta Sensibilidad (muestra) | € / muestra | 10.91 € | 11.95 € |
| Tape Station RNA y DNA Sensibilidad Estandar (muestra) | € / muestra | 10.35 € | 11.33 € |
| Tape Station RNA y DNA Alta Sensibilidad (chip) | € / chip | 96.26 € | 105.43 € |
Other services
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Identificación y Caracterización - PCR a tiempo real
- Análisis de compuestos por Espectrometría de Masas: MALDI-TOF
- Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Cromatografía de afinidad: Enriquecimiento en fosfopétidos para proteómica
Service general data
- Support unit: Genómica
- Institute: INSTITUTO DE AGROQUIMICA Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS
- Locality: Paterna (Valencia)
- Service's web: http://www.iata.csic.es/
Ofrecemos apoyo científico-técnico a grupos de investigación del IATA así como a otros centros de investigación o empresas que deseen utilizar técnicas de estudio global de genomas y de expresión génica. Incluye las técnicas de microarrays de DNA y PCR cuantitativa a tiempo real. Ofrecemos también servicios relacionados, como extracción de ácidos nucleicos a partir de distintos tipos de muestras, cuantificación y control de calidad de las muestras. Por otraparte Este servicio también permite el análisis de proteínas a partir de mezclas complejas con alta reproducibilidad y alta resolución.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
The service is performed using a TapeStation (Algilent). This carries out automated electrophoresis and, using data processing software, giving the size, quantity, and integrity of DNA or RNA samples. This assay allows to assess their suitability for downstream applications. The test uses 1 or 2 ul of DNA or RNA and takes 1 or 2 minutes per sample.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| TapeStation fungible DNA todo | € / muestra | 11.79 € | 12.07 € |
| TapeStation fungible genérico | € / muestra | 7.62 € | 7.74 € |
| TapeStation sin fungible | € / muestra | 39.55 € | 39.55 € |
| TapeStation fungible DNAg todo | € / muestra | 14.61 € | 15.02 € |
| TapeStation fungible RNA todo | € / muestra | 12.55 € | 12.87 € |
Service general data
- Support unit: GENÓMICA
- Institute: CENTRO DE BIOLOGIA MOLECULAR SEVERO OCHOA
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.cbm.uam.es/genomica
El Servicio de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
Determination of DNA and RNA quality, quality control of NGS libraries and fragment analysis using the QSep100 equipment| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Calidad de RNA (R1) | muestra | 7.78 € | 8.52 € |
| Calidad de DNA Standart (S2) | muestra | 5.86 € | 6.42 € |
| Calidad de DNA High Sensitivity (S1) | muestra | 9.12 € | 9.99 € |
Service general data
- Support unit: UNIDAD DE GENÓMICA IPBLN
- Institute: INSTITUTO DE PARASITOLOGIA Y BIOMEDICINA LOPEZ NEYRA
- Locality: Armilla (Granada)
- Service's web: http://www.ipb.csic.es/servicios/GenomicaySintesisdeOligonucleotidos/index.html
La Unidad de Genómica es parte integrante de los Servicios de Apoyo a la Investigación del centro. Se encuentra ubicada en el PT de Ciencias de la Salud de Granada, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción científica con multitud de grupos de investigación en el sector biosanitario. El objetivo principal de la Unidad es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica. Entre los servicios ofertados se cuentan: secuenciación de DNA, análisis de fragmentos de DNA, purificación automática de ácidos nucléicos, síntesis de oligonucleótidos y análisis de calidad de RNA. Asímismo, la Unidad desempeña labores de formación y asesoramiento del personal investigador y colabora activamente en tareas de divulgación científica.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
RNA quality analysis in microfluidic chip electrophoresis allows the assessment of RNA quality prior to downstream applications (quantitative PCR, microarrays, RNA-seq..). This analysis provides RNA concentration and the RNA integrity number. There are two service modalities: a, Eukaryotic total RNA standard sensitivity analysis and b, messenger RNA standard sensitivity analysis. 1. It is required a minimum of 3 ul sample volume. 2. The RNA concentration should be in the following range. Total RNA..... 25-500 ng/ul mRNA...........25-250 ng/ul 3. Samples will be delivered directly to facility staff. 4. Users will receive a pdf document by e-mail containing the results of the analysis. Equipment: Bioanalyzer 2100 Agilent| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| RNA StdSens | chip (12 muestras) | 82.61 € | 90.48 € |
Other services
- Análisis de fragmentos de DNA
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Secuenciación de DNA
- Consultoría Experimental y Técnica
- Electroforesis capilar
- Ultrasecuenciación - NGS - Secuenciación de segunda generación - Secuenciación masiva en paralelo
- Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
- Transcriptómica espacial
Service general data
- Support unit: TOXICOGENÓMICA AMBIENTAL
- Institute: INSTITUTO DE DIAGNOSTICO AMBIENTAL Y ESTUDIOS DEL AGUA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://www.idaea.csic.es
El Servicio de Toxicogenómica Ambiental ofrece un equipamiento y un personal altamente especializado que permite la aplicación de varias técnicas: • Extracción y cuantificación de ARN y ADN • Control de calidad de ARN • Electroforesis en gel de agarosa • Detección de genes • Análisis de expresión génica • Análisis de variación genética. Además, el STA ofrece la posibilidad de estudiar la toxicidad de un compuesto, mezcla o muestra siguiendo las pautas de la OCDE, como Ensayo de Toxicidad Aguda en Embriones de Pez Zebra; Test de Reproducción en Daphnia magna; Test de inmovilización aguda en Daphnia sp.; y Test de inhibición del crecimiento en algas. Además, el STA ofrece una plataforma de lipidómica para analizar al composición en lípidos de muestras biológicas, que incluye extracción, análisis y procesado de datos. También se ofrecen ensayos in-vitro (lineas celulares de peces y humanas) para detectar disruptores endocrinos que modulan el balanc
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
Analysis of RNA integrity by gel electrophoresis (microfluidics technology) 2100 Bioanalyzer (Agilent)| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| 1 chip de RNA (12 muestras) | €/chip (12 muestras) | 107.52 € | 117.76 € |
Service general data
- Support unit: GENÓMICA
- Institute: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS SOLS-MORREALE
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: https://www.iib.uam.es/portal/web/genomica/presentacion
El Servicio de Genómica fue creado en el año 1994 para apoyar con técnicas genómicas la tarea investigadora del personal del IIBm. Además, nuestro laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico. El Servicio dispone de un sistema de gestión de calidad conforme con la Norma UNE-EN ISO 9001:2000. El Servicio pertenece a la red de laboratorios de la CAM. Nº de registro:281.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
RNA QUALITY ASSESMENT: BIOANALIZADOR 2100, Agilent The Agilent 2100 Bioanalyzer system provides sizing, quantitation and quality control of DNA, RNA, proteins and cells on a single platform, providing high quality digital data. Nucleic acids quality is essential for downstream aplications as real-time PCR, NGS sequencing...| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Determinación integridad RNA | € / muestra | 5.7 € | 6.24 € |
Other services
Service general data
- Support unit: LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS
- Institute: INSTITUTO CAJAL
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.cajal.csic.es/
Las tecnologías ómicas son aquellas basadas en metodologías que permiten la obtención de grandes cantidades de datos acerca uno o millones de analitos de una muestra o de millones de células independientemente, con el objetivo de obtener una visión global y a la vez profunda de los cambios moleculares asociados a un estado fisiológico o patológico. El laboratorio de tecnologías ómicas, pretende aportar estas tecnologías a los estudios en neurociencia que se realizan en el CSIC y en nuestro entorno. El laboratorio está equipado con lo necesario para hacer estudios de secuenciación masiva tanto de genomas completos, como de transcriptomas de tejido completo o de célula única y el análisis bioinformático de los resultados gracias a nuestra unidad de bioinformática integrada en nuestro laboratorio.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
For the preparation of libraries for NGS, it is essential to validate the quantity and quality of the purified RNAs. To do this in this service, the RNAs will be quantified by spectrophotometry with the One nanodrop system (Thermofisher). If the amount of RNA is sufficient (>0.5mg/ml) and is free of interference (Ratio 260/280nm approx 1.8-2; ratio 260/230 2-2.2), then the integrity of the RNAs will be validated using capillary gel electrophoresis and fluorescence detection (Bioptic, Inc). This system allows the analysis, in small volumes of samples, of the quality of an RNA from the ratio between the signals of the 18S and 28S rRNA. 18S/28S ratio values between 7 and 10 are considered valid for the following library preparation protocols for NGS.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| ANALISIS DE CALIDAD DE RNA | 1 muestra | 50.77 € | 55.6 € |
Service general data
- Support unit: Secuenciación
- Institute: CENTRO DE INVESTIGACION EN SANIDAD ANIMAL
- Locality: Valdeolmos-Alalpardo (Madrid)
El servicio de secuenciación del CISA permite potenciar los estudios moleculares dirigidos a la diagnosis y prevención de patógenos animales de alto riesgo y con gran impacto económico; así como también los estudios moleculares derivados de la investigación básica. El laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Determinación de calidad y tamaño ADN y ARN | € / chip | 8.39 € | 9.19 € |
Service general data
- Support unit: UNIDAD DE GENÓMICA
- Institute: INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR DEL CANCER DE SALAMANCA
- Locality: Salamanca (Salamanca)
- Service's web: http://www.cicancer.org/
La Unidad de Genómica ofrece soporte integral tanto al IBMCC como a usuarios externos, brindando servicios completos de secuenciación y microarrays. Gestionamos todo el proceso analítico de principio a fin, comenzando por la muestra experimental (ARN total, ADN genómico, plásmidos o fragmentos de PCR, según el análisis). Nuestros servicios abarcan todos los pasos de la genómica, incluido el asesoramiento técnico sobre diseño experimental y control de calidad de las muestras proporcionadas. Las instalaciones y los protocolos experimentales cuentan con la certificación ISO 9001, lo que garantiza estándares de alta calidad. Además, nuestro Sistema de Gestión de Seguridad y Salud Ocupacional está certificado bajo el sistema OHSAS 18001, lo que refleja nuestro compromiso de mantener un ambiente de trabajo seguro y conforme.
RNA, DNA, nucleic acids quality analysis
Benefit description
4. Sizing, quantification, and sample quality control of DNA, RNA, and proteins using the Agilent 2100 Bioanalyzer, a automated electrophoresis platform| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Análisis calidad RNA Nano kit | 1 muestra | 4.45 € | 4.88 € |