- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
-
- Genómica
Barcoding, Metabarcoding and Metagenomics
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
|
IPNA - San Cristóbal de La Laguna |
Service general data
Service data
- Support unit: BIODIVERSITY GENOMICS
- Institute: INSTITUTO DE PRODUCTOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA
- Locality: San Cristóbal de La Laguna (Santa Cruz de Tenerife)
- Service's web: https://www.ipna.csic.es/
Service's description
Este servicio dispone de la infraestructura necesaria para implementar protocolos de Barcoding, Metabarcoding y Metagenómica. Se ofrecen los siguientes servicios: i) Extracción, purificación y cuantificación de ADN ii) Barcoding de metazoa iii) Metabarcoding de Metazoa iv) preparación de librerías ddRADseq. Equipamiento disponible: KingFisher Flex, Tecan Feedom EVO 150 workstation, Infinite® MNano+, Agilent Bioanalyzer 2100, BluePippin
Barcoding, Metabarcoding and Metagenomics
Benefit description
-Metazoa Barcoding Service: Quantification, normalization and amplification by PCR of a 658 bp fragment of the 3' end of the COI gene (fragment considered the standard barcode in Metazoa). -Metazoa Metabarcoding Service. An automated service is offered for the preparation of metabarcoding libraries for a 418 bp COI gene fragment (3' end of the gene) for high-throughput sequencing (Illumina platform). Indexing using Illumina Nextera XT kits allows multiplexing of up to 384 samples. It also offers the possibility to create create different steps of the protocolo in isolation. - Automated library preparation for double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRAD-seq).| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Selección Tamaño Fragmento Blue Pippin | 5 muestras | 192.11 € | 210.4 € |
| Preparación de librerías ddRADseq | €/ placa 94 | 1098.45 € | 1203.07 € |
| Amplificación del fragmento de Metabarcoding | €/ placa 94 | 185.38 € | 203.04 € |
| Pooling | €/ placa 96 | 49.29 € | 53.99 € |
| Control de Calidad (BioAnalyzer) | 12 muestras | 110.35 € | 120.86 € |
| MBC_Indexado Kits Nextera XT de Illumina | €/ placa 94 | 645.48 € | 706.96 € |
| Normalizacion dilucion muestra para librería | €/ placa 94 | 93.28 € | 102.17 € |
| Limpieza con esferas magnéticas | placa 94 | 263.33 € | 288.4 € |
| Metabarcoding ext 3' del gen COI | €/ placa 94 | 1436.23 € | 1573.01 € |
| Reconcentración y limpieza | € / muestra | 25 € | 27.38 € |