Diseño y clonación

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Proyecto de clonación en Escherichia coli y Lactococcus lactis. Este precio no incluye el coste de los oligos, ni la secuenciación.

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En el nodo CSIC-CIB se ofrecen un servicio de diseño in vivo de microrganismos de interés industrial mediante ingeniería genética y metabólica. El nodo CSIC a través del CIB ofrece la posibilidad de realizar trabajos de ingeniería genética y metabólica con diferentes chasis microbianos de interés industrial, ya sean bacterias (Escherichia coli, Pseudomonas putida, Mycobactrium smegmatis, Corynecaterium glutamicum, etc.) u hongos (Pichia pastoris, Sacharomyces cerevisiae, Aspergillus nidulans, etc.). El servicio ofrece una consultoría y diseño integral. Se ofrece asesoramiento para la mejora del desarrollo de procesos biotenológicos. Los clientes pueden plantear al nodo un problema sobre un proceso de desarrollo biotecnológico y el equipo del nodo se compromete a estudiar el problema y ofrecer un informe con las posibles acciones de I+D+I para resolverlo que posteriormente se podrán acordar con el servicio siguiendo los modelos de contratación del CSIC. El coste del servicio se establece en función de las horas utilizadas de consultoría y diseño. Entre los posibles desarrollos que se pueden estudiar se encuentran los siguientes: - Construcción de cepas como biofactorías. Generar microorganismos a la carta para la producción de compuestos de interés industrial mediante tecnologías de modificación genética. Diseño integral del organismo productor basado en el conocimiento de su metabolismo, apoyado en los modelos metabólicos, y generalmente después de una consultoría previa al otro nodo IBISBA-CNB. Los compuestos producidos pueden ser de difente tipo (metabolitos de bajo peso molecular, polímeros (PHAs, carbohidratos, etc.), enzimas, etc.). Los chasis microbianos que actuarán como biofactorías pueden ser desarrollados a la carta o seleccionados entre chasis ya contrastados (bacterias u hongos). Se proporcionan herramientas y tecnologías de modificación genética, con una posible selección mediante técnicas de ALE (Adaptative Laboratory Evolution). - Test de microorganismos productores. Ensayar las condiciones de fermentación con el microorganismo productor a escala de laboratorio. Producción, extracción y purificación del compuesto de interés industrial. Determinación de medios de cultivo optimizados y un procedimiento operativo estandarizado para la producción por fermentación del compuesto de interés en matraces o en biorreactores de pequeño volumen (1-5 L). Se determinará un método analítico para la cuantificación del compuesto de interés basado en diferentes técnicas (HPLC-MS, GC-MS, RMN, etc.), incluyendo la caracterización completa de proteínas. Se determinará un método para la extracción y purificación del compuesto de interés que más tarde pueda ser escalado a nivel industrial. - Desarrollo de procesos de biotransformación con biocatalizadores. Desarrollo de procesos de producción de compuestos de interés basados en procesos de biotransformación. Estos procesos se basaran en el uso de enzimas previamente aisladas (inmovilizadas o libres) o con células en reposo (resting cells), generalmente después de una consultoría previa. Se ofrece la posibilidad de desarrollar biocatalizadores a la carta mediante técnicas de ingeniería metabólica (células en reposo) e ingeniería de proteínas (catalizadores aislados) utilizando los servicios anteriores de consultoría, diseño y test. Para complementar y asistir a las técnicas de ingeniería de proteínas en el diseño de catalizadores se ofrecen servicios combinados de bioinformática, cristalografía, y/o biofísica. Test de producción a escala de laboratorio en matraces, o en biorreactores de pequeño volumen (1-5 L). Método analítico para la cuantificación del compuesto de interés basado en diferentes técnicas (HPLC-MS,GC-MS, RMN).

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El servicio de clonaje molecular ofrece el diseño, construcción y validación de moléculas recombinantes para aplicaciones de investigación básica, biotecnología y desarrollo tecnológico. La prestación incluye la inserción de secuencias de ADN en vectores adecuados mediante distintas estrategias de clonaje, permitiendo la generación de construcciones personalizadas para expresión génica, estudios funcionales, producción de proteínas recombinantes, edición genética y otras aplicaciones moleculares.