- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Genómica
Barcoding, Metabarcoding y Metagenómica
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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IPNA - San Cristóbal de La Laguna |
Datos Generales del Servicio
Datos del servicio
- Unidad de servicio: BIODIVERSITY GENOMICS
- Instituto: INSTITUTO DE PRODUCTOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA
- Localidad: San Cristóbal de La Laguna (Santa Cruz de Tenerife)
- Web del servicio: https://www.ipna.csic.es/
Descripción del servicio
Este servicio dispone de la infraestructura necesaria para implementar protocolos de Barcoding, Metabarcoding y Metagenómica. Se ofrecen los siguientes servicios: i) Extracción, purificación y cuantificación de ADN ii) Barcoding de metazoa iii) Metabarcoding de Metazoa iv) preparación de librerías ddRADseq. Equipamiento disponible: KingFisher Flex, Tecan Feedom EVO 150 workstation, Infinite® MNano+, Agilent Bioanalyzer 2100, BluePippin
Barcoding, Metabarcoding y Metagenómica
Descripción de la prestación
-Servicio de Barcoding de Metazoa: Cuantificación, normalización y amplificación mediante PCR de un fragmento de 658 pb de extremo 3 del gen COI (fragmento considerado el barcode estándar en Metazoa). -Servicio de Metabarcoding de Metazoa. Se ofrece un servicio automatizado para la elaboración de librerías de metabarcoding para un fragmento del gen COI de 418 pb (extremo 3¿ del gen) para su secuenciación de alto rendimiento (plataforma Illumina). El indexado mediante kits Nextera XT de Illumina nos permite multiplexar hasta 384 muestras. También se ofrece la posibilidad de realizar de forma aislada diferentes pasos del protocolo. - Preparación automatizada de librerías de fragmentos de ADN generados por enzimas de restricción (ddRAD-seq).| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Selección Tamaño Fragmento Blue Pippin | 5 muestras | 192.11 € | 210.4 € |
| Preparación de librerías ddRADseq | €/ placa 94 | 1098.45 € | 1203.07 € |
| Amplificación del fragmento de Metabarcoding | €/ placa 94 | 185.38 € | 203.04 € |
| Pooling | €/ placa 96 | 49.29 € | 53.99 € |
| Control de Calidad (BioAnalyzer) | 12 muestras | 110.35 € | 120.86 € |
| MBC_Indexado Kits Nextera XT de Illumina | €/ placa 94 | 645.48 € | 706.96 € |
| Normalizacion dilucion muestra para librería | €/ placa 94 | 93.28 € | 102.17 € |
| Limpieza con esferas magnéticas | placa 94 | 263.33 € | 288.4 € |
| Metabarcoding ext 3' del gen COI | €/ placa 94 | 1436.23 € | 1573.01 € |
| Reconcentración y limpieza | € / muestra | 25 € | 27.38 € |