La Biblioteca del CIB está considerada como la biblioteca de referencia en España en Biología y Biomedicina, por su excelente colección, de revistas y de monografías. De este fondo bibliográfico cabe resaltar el Legado del Doctor Gregorio Marañón. La Biblioteca está integrada en la Red de Bibliotecas del CSIC (URICI) contribuyendo al préstamo interbibliotecario de la Red, al mantenimiento del Catálogo Bibliográfico-CSIC y al depósito de la producción científica de los investigadores del CIB en el repositorio institucional Digital.CSIC.
La Red proporciona el apoyo necesario para el acceso a todos los recursos, impresos y electrónicos, suscritos por el CSIC a través de la Biblioteca Vitual, que permite buscar desde un solo punto en esos recursos, además de los fondos de los catálogos bibliográficos y de archivos y en Digital.CSIC.El Servicio PAPI, facilita el acceso fuera del campus del CSIC. La intranet de la biblioteca es de uso restringido.

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