- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
-
- Proteómica
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
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CIB - Madrid |
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SERVICIO DE ANÁLISIS DE PROTEÍNAS IBVF - Sevilla |
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IIBB - Barcelona |
Service general data
- Support unit: PROTEÓMICA Y GENÓMICA
- Institute: CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS MARGARITA SALAS
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.cib.csic.es/es/servicio.php?iddepartamento=29
El servicio Proteómica y Genómica cuenta con el siguiente equipamiento: • Espectrómetro de masas MALDI‑TOF/TOF Autoflex III (Bruker). • Espectrómetro de masas Q-Exactive conectado en línea a un nano-UHPLC Vanquish Neo a través de la fuente de iones NanoSpray Flex NG (Thermo Fisher Scientific). • Espectrómetro de masas de alta resolución Orbitrap Exploris 240 conectado en línea a un nano-UHPLC Vanquish Neo a través de la fuente de iones NanoSpray Flex NG (Thermo Fisher Scientific). • TapeStation 4150 (Agilent). • Termocicladores rt‑PCR iQ5 (Bio‑Rad) y LightCycler 96 (Roche). El servicio está certificado conforme a la norma UNE-EN ISO9001:2015 en "La determinación de la masa molecular por espectrometría de masas". IQNetES-0286-2009_2023-12-26.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Benefit description
Q-Exactive mass spectrometer equipped with a nano ionization source connected on-line to a nano-UHPLC Easy-LC 1000. We also have a Neo Vanquish nano-UHPLC coupled to the Orbitrap Exploris 240 mass spectrometer via the NanoSpray Flex NG ion source (Thermo Scientific). These instruments are suitable for most proteomic analyses. Applications: Identification and quantification of proteins in complex proteomes, in samples of low and medium complexity. identification of phosphorylation sites or other modifications, as well as for performing differential quantitative proteomics experiments (SILAC, iTRAQ, Label-free). SIM (single ion monitoring) and PRM (parallel reaction monitoring) experiments, specific to targeted proteomics.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| LC MS-MS grad 30-60min-QExactive | 295.42 € | 323.56 € | |
| LC MS-MS grad 60-150 min-Qexactive | 343.59 € | 376.31 € | |
| Proteómica cuantitativa libre de marcaje | 539.41 € | 590.79 € | |
| Digestión en columna S-Trap | 34.99 € | 38.33 € | |
| LC MS-MS grad 150-240 min-QExactive | 401.39 € | 439.62 € | |
| LC MS-MS grad 60-150 min-Orbitrap Exploris | 384.87 € | 421.53 € | |
| LC MS-MS grad 30-60 min-Orbitrap Exploris 240 | 291.12 € | 318.84 € | |
| LC MS-MS grad 150-240 min-Orbitrap Exploris | 476.68 € | 522.07 € | |
| Suministro de vial de tripsina Lys C | 56.36 € | 61.73 € | |
| Análisis de datos | 70.02 € | 76.68 € |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE ANÁLISIS DE PROTEÍNAS
- Institute: INSTITUTO DE BIOQUIMICA VEGETAL Y FOTOSINTESIS
- Locality: Sevilla (Sevilla)
- Service's web: http://www.ibvf.csic.es/descripcion-analisis-proteinas
El objetivo principal del Servicio de Análisis de Proteínas del IBVF es la identificación de proteínas de interés biológico, mediante espectrometría de masas. Para ello, cuenta con diferentes equipos para la preparación y el análisis de las muestras: -Sistema para el recorte automatizado de proteínas en gel de una o dos dimensiones, Modelo EXQuest Biorad. -Espectrómetro de masas híbrido, Triple cuadrupolo-TOF acoplado a nanoLC, Modelo 5600, Sciex, que permite análisis LC-MS/MS.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Benefit description
Triptic digestion and separation of complex protein mixtures (more than 50 proteins) by liquid chromatography and identification by triple quadrupole mass spectrometry and time of flight.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Protein identification by LC MSMS (more than 50 proteins) | 365.50 € | 400.31 € |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Institute: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Benefit description
LC MS/MS is an efficient approach either for the exhaustive characterization of a protein sequence or for a general characterization of the proteins in a protein extract or a full proteome. The sample is digested with trypsin and the peptide digests loaded into a capillary chromatography system coupled to the mass spectrometer through a microelectrospray interface (also called nanospray interface). Peptides are separated by reversed phase chromatography using an acetonitrile gradient and directly eluted and ionized into the mass spectrometer. The mass spectrometer perform scan cycles consisting of a full scan from where it determines the mass of the peptide eluting at a given moment, followed by 5-50 consecutive MS/MS scans on the corresponding 5-50 more intense peptide signals detected in the MS scan. Note: When the sequence data obtained cannot be matched against the corresponding database (partially annotated species, presence of unexpected modifications), you may want to perform a de novo analysis of the data using PEAKS software.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 30 min. High Res-MS. / | 265.15 € | 290.40 € | |
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 90 min. High Res-MS. / | 385.27 € | 421.97 € | |
| Identificación de proteínas LC-MSMS. 60 min.High Res-MS | 318.33 € | 348.65 € | |
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 180 min. High Res-MS. | 462.61 € | 506.67 € | |
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 15 min. High Res-MS. | 198.16 € | 217.03 € |
Other services
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría
- Digestión FASP
- Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo