Apoyo en el procesado y análisis de datos

El LAST-EBD es un servicio general de la Estación Biológica de Doñana (EBD) a disposición de todo el personal del centro, y cuya principal misión es la de proveer acceso a cartografía digital, datos de teledetección y asesoramiento en el uso de técnicas GIS. Ofrecemos experiencia técnica para la aplicación de técnicas de GIS y Teledetección en proyectos de investigación o de gestión de recursos naturales que requieren el uso de datos espaciales o geográficos. Centralizamos el acceso y manejo a cartografía digital, principalmente de Andalucía, pero también a otras áreas de España y el mundo. El laboratorio gestiona un banco de imágenes del área de Doñana con más de 600 imágenes de satélite y aéreas. También orienta en el uso de procedimientos y software GIS, búsqueda y disponibilidad de imágenes de satélite o aéreas, y gestiona la adquisición de imágenes de satélite o datos cartográficos necesarios en proyectos de investigación.

El Servicio de Microscopía Confocal y Electrónica de Transmisión (CTEM) tiene como finalidad satisfacer la creciente demanda de los investigadores del Centro en este ámbito. El Servicio pretende organizar, gestionar, optimizar y fomentar el uso de los grandes equipos de microscopía disponibles en el Instituto. También facilita la preparación estándar de las muestras antes de su observación. El Servicio está disponible tanto para los investigadores de las sublíneas de investigación de la EEZ (servicio interno) como para otras instituciones académicas y comerciales (servicio externo).

El catálogo de servicios que ofrecemos incluye: [1] Desarrollo de software para el análisis y anotación de resultados de experimentos de secuenciación masiva [2] Ultrasecuenciación: Determinación de regiones enriquecidas en experimentos ChIP-seq. [3] Modelado de estructura de proteínas y ácidos nucleicos. [4] Herramientas para la exploración y análisis interactivo de datos [5] Consultoría y Servicios de datos climáticos Los usuarios interesados en estos servicios deben contactar con los responsables por medio del correo electrónico: compbio@eead.csic.es

Este servicio ofrece al Sistema Nacional de Salud y a centros medicos privados nacionales e internacionales, una plataforma altamente especializada para el estudio de la longitud telomérica, su regulación y el análisis de mutaciones asociadas con acortamiento telomérico. El servicio esta especializado en telomeropatías, especialmente disqueratosis congenita, anemia aplásica y fibrosis pulmonar.

El propósito del Servicio de Datos de la UTM es dar a conocer qué datos existen y dónde, cuándo, quién y cómo han sido adquiridos, dando accesibilidad a la mayor parte de éstos de forma que puedan ser reutilizados. Para ese fin, el Centro de Datos de la UTM dispone de una Infraestructura de Datos Espaciales (IDE) que consta de un catálogo de campañas con metadatos y enlaces a documentación, sistemas de información geográfica, datos en abierto y otros recursos y aplicaciones de visualización y control de calidad de datos de las campañas oceanográficas referenciadas mediante identificadores permanentes únicos que facilitan la citación en publicaciones derivadas. El servicio también ofrece ayuda técnica en el procesado y creación de productos basados en datos.

Muestreo de organismos, análisis y gestión de datos relacionado con la actividad pesquera. Este servicio científico-técnico deriva de las actividades regulares del “Servei d’Assessorament en Pesca” de ICATMAR. El objetivo principal de este organismo es dar asesoramiento en materia de gestión pesquera a las administraciones públicas, tanto las autonómicas, estatales o europeas. El asesoramiento se basa en la recopilación de datos científicos tanto a través de muestreos de campo de datos pesqueros históricos. Este servicio pone a disposición la infraestructura creada para el asesoramiento a las administraciones para otros proyectos de investigación o entidades, tanto públicas como privadas en el marco de este servicio científico-técnico. Las cuatro grandes prestaciones ofrecidas son: recogida de muestras de campo a bordo de embarcaciones pesqueras, integración y distribución de datos pesqueros, asesoramiento en análisis de datos y asesoramiento en gestión pesquera.

"La ciencia de los datos se ha convertido en un cuarto camino para el descubrimiento científico, además de la experimentación, la modelización y la computación" Provost Martha Pollack Los datos en ciencia son el inicio de la investigación. Extraer información de los datos estructurados (BBDD normalizadas) y datos no estructurados (listados). Consultas a BBDD relacionales usando SQL. Recopilar datos no estructurados mediante web scraping, API y encuestas. Sofisticados métodos analíticos, aprendizaje automático y métodos estadísticos para preparar datos para su modelado predictivo y prescriptivo. Limpiar datos para descartar información irrelevante y prepararlos para preprocesamiento y modelado. Análisis de datos exploratorio para determinar los datos que faltan y buscar tendencias. Comunicar predicciones y hallazgos a gestores y TIC a través de visualizaciones de datos e informes efectivos. Servicios de SIG y cartografía e IDEs. FAIR https://doi.org/10.1038/sdata.2016.18

El laboratorio está dedicado al análisis de datos de estudios de metabolómica dirigida y no dirigida, obtenidos mediante técnicas cromatográficas y espectroscópicas. El pre-procesado de datos se realiza mediante un flujo de trabajo que comienza con 1) la detección y deconvolución de las señales obtenidas, mediante algoritmos adecuados y su alineado, 2) la normalización y transformación de los datos pre-procesados y 3) la obtención de la matriz de datos 1D, 2D o 3D. Posteriormente, se realiza el estudio estadístico adecuado (univariado, multivariado, PCA, PLS-DA, clúster...) para obtener una visualización espacio-temporal de los datos. Finalmente, el servicio ofrece la aplicación de técnicas de visualización de datos para diseñar la representación gráfica idónea que permita la exposición de la información adquirida.