- Áreas de investigación
-
- Biología y Biomedicina
- Grupo
-
- Análisis y Métodos Físicos
- Subgroup
-
- Acústica y Ultrasonidos
Fragmentación de DNA
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
|
LABORATORIO DE ECOLOGÍA MOLECULAR y ECOFISIOLOGÍA (LEMF) EBD - Sevilla |
|||
|
Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb) IBB - Barcelona |
|||
|
LABORATORIO DE SISTEMÁTICA MOLECULAR RJB - Madrid |
|||
|
SERVICIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOQUÍMICA IBFG - Salamanca |
Service general data
- Support unit: LABORATORIO DE ECOLOGÍA MOLECULAR y ECOFISIOLOGÍA (LEMF)
- Institute: ESTACION BIOLOGICA DE DOÑANA
- Locality: Sevilla (Sevilla)
- Service's web: http://www.ebd.csic.es/
Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de ecología molecular: identificar el sexo de los individuos, identificar individuos de poblaciones salvajes mediante sus heces, determinar relaciones de parentesco entre individuos, detectar cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilizar marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos. Los marcadores nucleares se pueden desarrollar, optimizar y tipar para conocer mejor las relaciones entre individuos, poblaciones y especies. Se ofrece asimismo la posibilidad de secuenciar tanto genes diana mediante secuenciación Sanger como secuenciación de nueva generación de genomas enteros para estudios de genética poblacional, genética funcional y filogenias. las técnicas basadas en ARN están actualmente en expansión
Fragmentación de DNA
Benefit description
Para la fragmentación del ADN de manera precisa y controlada, sin dañarlo, muy importante en la preparación de librerías para secuenciación de nueva generación (NGS), el laboratorio dispone de un equipo de ultrasonicación basado en campo acústico enfocado COVARIS E220. El tamaño de los fragmentos de ADN es ajustable, con un rango de entre 150 y 5000 pb. Se realiza en tubos cerrados para evitar contaminaciones y el equipo permite procesar tanto muestras individuales, como grupos de 8 o 96 muestras.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Fragmentación ADN por ultrasonicación (COVARIS) 50ul | €/muestra | 17.49 € | 19.15 € |
| Fragmentación ADN por ultrasonicación (COVARIS) placa 96 | €/muestra | 12.56 € | 13.75 € |
| Fragmentación ADN por ultrasonicación (COVARIS) 50ul o 130ul | € / muestra | 14.41 € | 15.78 € |
| Fragmentación ADN por ultrasonicación (COVARIS) 130ul | €/muestra | 13.93 € | 15.25 € |
Other services
- Análisis antioxidante métodos de radicales libres
- Análisis bioquímicos clínicos
- Biología Molecular: Amplificación de material genético (PCR, qPCR)
- Citometría de flujo
- Determinación molecular del sexo
- Identificación genética, paternidad, trazabilidad y genotipificación
- Identificación molecular de especies
- Inmunoensayo
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Resistencia a antibacterianos
- Técnicas ELISA
- Tratamiento muestra: Extracción
- Preparación de muestras
Service general data
- Support unit: Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb)
- Institute: INSTITUTO BOTANICO DE BARCELONA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://www.ibb.csic.es/
Con el objetivo de maximizar la transferencia de tecnología a las empresas, a otras instituciones de investigación y a la sociedad en general, el IBB creó en 2013 una unidad de servicios (CertIBB). Esta unidad ofrece servicios de formación, análisis y consultoría basados en su personal científico y técnico y sus instalaciones especializadas. El servicio de certificaciones y análisis del IBB tiene la misión de proporcionar a otros centros de investigación, empresas y a la sociedad en general, una serie de herramientas y técnicas moleculares y taxonómicas, así como la prestación de consultoría y formación a través de los servicios. Para ello, el IBB dispone de personal científico y técnico de experiencia probada, de un herbario de referencia con 800000 pliegos, una biblioteca especializada, laboratorios completamente equipados, cámaras de cultivo, invernaderos y mariposario.
Fragmentación de DNA
Benefit description
Descripción: La fragmentación del ADN es un paso fundamental para la construcción de librerías genómicas para la posterior aplicación de protocolos de secuenciación de nueva generación, además de otras aplicaciones (ver detalles en el apartado de Aplicaciones). Entre los diferentes métodos existentes (agentes físicos, químicos y enzimáticos), este servicio ofrece la fragmentación mediante sonicación, proceso a través del cual las muestras de ADN son sujetas a cizallamiento hidrodinámico por exposición a breves períodos de sonicación controlada. Este proceso es altamente eficiente en comparación con otros métodos, llegando a alcanzar una alta sensibilidad. Se trata de un proceso reproducible e independiente del personal que lo realiza, condiciones ambientales o cambio de equipo. Equipamiento disponible: Sonicador Qsonica - Q800R3 (https://www.sonicator.com/products/q800r-sonicator). Sistema de fragmentación de ADN y cromatina en líquido. El equipo permite realizar la fragmentación de ADN dentro de un rango objetivo de tamaños considerablemente amplio (de 150 bp hasta 3 kb). El tamaño a fragmentar dependerá del objetivo metodológico posterior. Es capaz de procesar de una hasta 18 muestras simultáneamente. El volumen requerido para cada una de ellas oscila entre 50 µl y 1 mL. Se utilizan tubos comerciales de medida y forma estándar de laboratorio molecular (0,3 mL tubos PCR, 0,5 mL tubos PCR y 1,5 mL tubos de poliestireno). El tiempo programable es de 1 segundo a 10 horas. Catálogo de aplicaciones técnicas del equipamiento: - Obtención de fragmentos de ADN para la construcción de librerías genómicas para aplicaciones de secuenciación de alto rendimiento (NGS) incluyendo: whole genome sequencing, genome skimming, sequence capture, RAD-seq, GBS. - Fragmentación de cromatina - ChIP y ChIP-seq - Transcriptómica (RNA-seq) - Extracción de proteínas - Lisis celular Servicio ofrecido: - Asesoramiento en la preparación y análisis de muestras - Realización de test de ajuste de tiempo de fragmentación y condiciones de sonicación - Optimización de protocolos y asistencia técnica para solución de problemas| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Fragmentación de ADN (10 muestras) | 10 muestras | 56.18 € | 61.53 € |
Service general data
- Support unit: LABORATORIO DE SISTEMÁTICA MOLECULAR
- Institute: REAL JARDIN BOTANICO
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.rjb.csic.es/
El Laboratorio de Sistemática Molecular (LSM) del Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC), se creó en 1997 con la finalidad de aplicar técnicas de biología molecular al estudio de la biodiversidad vegetal y fúngica desde tres disciplinas principales: 1.Sistemática (Taxonomía y Filogenia) 2.Biología Evolutiva 3.Ecología La incorporación de la biología molecular en los estudios sistemáticos, ha contribuido a ampliar la comprensión de la historia evolutiva (Biogeografía, Ecología Evolutiva, Biología de la Conservación). Desde su creación el LSM ha sido un apoyo fundamental clave en la producción científica, que incluye un gran número de artículos científicos en revistas de alto impacto. Las técnicas en biología molecular utilizadas en el laboratorio : • Extracción de ADN de plantas y hongos • Amplificación de ADN nuclear y citoplásmico mediante PCR • Purificación de productos amplificados • Clonación de genes • Técnicas fingerprinting RFLP, AFLP, etc
Fragmentación de DNA
Benefit description
Fragmentación de ADN con equipo de ultrasonicación focalizada COVARIS M220| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Fragmentación ADN por ultrasonicación (COVARIS) 130ul | €/muestra | 19.6 € | 21.46 € |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOQUÍMICA
- Institute: INSTITUTO DE BIOLOGIA FUNCIONAL Y GENOMICA
- Locality: Salamanca (Salamanca)
- Service's web: http://ibfg.usal-csic.es
El Servicio de Biología Molecular y Bioquímica del IBFG es una Unidad de apoyo a la Investigación, tanto de equipamiento para distintas tareas experimentales como de realización de trabajos de experimentación relacionadas con la Biología Molecular y Bioquímica. Nuestro apoyo Técnico abarca desde el entrenamiento correcto y eficaz de los nuevos usuarios en el uso de los diferentes equipos que componen la Unidad, hasta la revisión, calibración y mantenimiento de dichos equipos. Nuestro objetivo principal es dar apoyo científico-técnico a través de nuestros Servicios a nuestro Instituto como a otros Organismos públicos o Instituciones privadas que requieran nuestros servicios. También son posibles todo tipo de Consultas técnicas y científicas relacionadas con la Biología Molecular y Bioquímica. El usuario tiene el derecho y el deber de conocer la normativa.
Fragmentación de DNA
Benefit description
Fragmentación de ADN con equipos de ultrasonicación Bioruptor Standard UCD-300 Diagenode y Bioruptor Plus Diagenode| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Fragmentación de ADN (6 muestras) | 6 muestras | 43.93 € | 48.12 € |
Other services
- Estudios de expresión génica: microchips de DNA y RT-PCR, ddPCR
- Expresión y purificación de macromoléculas (HPLC, FPLC, DLS, Ultracentrífuga, columnas de purificación, biblioteca de plásmidos)
- Quantitative PCR (qPCR)
- Nanodrop: Spectrophotometry of liquid samples
- Preparación de células competentes de Escherichia coli