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- Biología y Biomedicina
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- Consultoría y Calidad y Seguridad y Difusión
- Análisis y Métodos Biológicos
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- Consultoría
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Identificación molecular de especies
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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LABORATORIO DE ECOLOGÍA MOLECULAR y ECOFISIOLOGÍA (LEMF) EBD - Sevilla |
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Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb) IBB - Barcelona |
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Metabolómica y Genómica Vegetal EEAD - Zaragoza |
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Servicio de análisis moleculares en cultivos frutales IHSM - Algarrobo |
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IREC - Ciudad Real |
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COC - Santa Cruz de Tenerife |
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Servicio de biología molecular COMA - Málaga |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: LABORATORIO DE ECOLOGÍA MOLECULAR y ECOFISIOLOGÍA (LEMF)
- Instituto: ESTACION BIOLOGICA DE DOÑANA
- Localidad: Sevilla (Sevilla)
- Web del servicio: http://www.ebd.csic.es/
Este laboratorio tiene como objetivo ofrecer a los usuarios, tanto del CSIC como de otras instituciones, el acceso a técnicas genéticas y genómicas innovadoras, así como el análisis de una amplia gama de variables bioquímicas y metabólicas que permiten conocer distintos parámetros fisiológicos. Destaca además la reciente construcción de un nuevo laboratorio de Nivel 2 de Bioseguridad, que ha ampliado las capacidades de investigación y permitido trabajar con agentes biológicos más peligrosos. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de la ecología molecular, así como investigaciones sobre las adaptaciones fisiológicas y metabólicas que las especies deben realizar para enfrentar patógenos, contaminantes y otros factores ambientales. El estudio de la genética y genómica de los organismos permite conocer cómo están codificadas dichas adaptaciones a nivel molecular y cuál es el papel de las misma
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
En Biología Molecular existen diferentes métodos que permiten la identificación de especies. En el LEM se llevan principalmente mediante PCR especificas o secuenciación de amplicones. Dada la estrecha vinculación del laboratorio con protocolos de recolección de muestras en condiciones subóptimas: muestreos de campo y de museo, es frecuente que las muestras procedan de restos biológicos con DNA escaso y/o degradado. Para su procesado, el laboratorio dispone de los protocolos de trabajo y de la infraestructura necesaria para procesar adecuadamente estas muestras. Concretamente, el laboratorio cuenta con una estancia completamente equipada y aislada del resto que evita contaminaciones provenientes de material genético de mayor calidad, o productos de PCR. En el caso de tratarse de restos fósiles, el centro dispone de un laboratorio de DNA antiguo descrito en el apartado correspondiente| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies 1-5 muestras €/muestra | 36.00 € | 39.42 € | |
| identificación molecular de especies 6-48 muestras €/muestra | 36.02 € | 39.45 € | |
| identificación molecular de especies mas de 49 mue €/muestra | 30.19 € | 33.07 € |
Otras prestaciones de servicio
- Análisis antioxidante métodos de radicales libres
- Análisis bioquímicos clínicos
- Biología Molecular: Amplificación de material genético (PCR, qPCR)
- Citometría de flujo
- Determinación molecular del sexo
- Identificación genética, paternidad, trazabilidad y genotipificación
- Inmunoensayo
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Resistencia a antibacterianos
- Técnicas ELISA
- Tratamiento muestra: Extracción
- Preparación de muestras
- Fragmentación de DNA
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb)
- Instituto: INSTITUTO BOTANICO DE BARCELONA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.ibb.csic.es/
Con el objetivo de maximizar la transferencia de tecnología a las empresas, a otras instituciones de investigación y a la sociedad en general, el IBB creó en 2013 una unidad de servicios (CertIBB). Esta unidad ofrece servicios de formación, análisis y consultoría basados en su personal científico y técnico y sus instalaciones especializadas. El servicio de certificaciones y análisis del IBB tiene la misión de proporcionar a otros centros de investigación, empresas y a la sociedad en general, una serie de herramientas y técnicas moleculares y taxonómicas, así como la prestación de consultoría y formación a través de los servicios. Para ello, el IBB dispone de personal científico y técnico de experiencia probada, de un herbario de referencia con 800000 pliegos, una biblioteca especializada, laboratorios completamente equipados, cámaras de cultivo, invernaderos y mariposario.
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
IDENTIFICACIÓN MOLECULAR DE ORGANISMOS EUCARIOTAS (INSECTOS, PLANTAS Y HONGOS) La identificación molecular mediante código de barras genético (DNA barcoding) ha revolucionado la exploración de la biodiversidad, complementando ampliamente los criterios de identificación taxonómica clásica. Permite la caracterización genética de muestras de tejido de insectos, plantas y hongos y su identificación a nivel de especie mediante el análisis de marcadores moleculares estandarizados. En insectos, grupo megadiverso donde la identificación morfológica puede verse limitada por especies crípticas, estados inmaduros o especímenes dañados, el servicio ofrece la caracterización genética de muestras de tejido (total o parcial), incluyendo cualquier estadio del desarrollo: huevos, larvas, pupas y adultos, así como exuvias o heces. El flujo de trabajo comprende la extracción de ADN de la muestra, la amplificación y obtención de secuencias del fragmento del gen mitocondrial citocromo oxidasa I (COI), el alineamiento de las secuencias obtenidas con repositorios de bases de datos de referencia de COI de insectos, y la identificación a nivel de especie según criterios de similitud genética y cobertura de los datos disponibles. Siempre que es posible, la identificación molecular se complementa con criterios taxonómicos basados en morfología, ecología o distribución geográfica. En plantas, el servicio ofrece la caracterización genética de muestras de tejido vegetal, preferiblemente hojas u otras partes verdes, aunque también es posible a partir de flores u otros tejidos, e incluso de material desecado procedente de pliegos de herbario, hasta nivel de especie. Existe especialización en la identificación molecular de especies de plantas alóctonas o invasoras, lo cual resulta especialmente relevante para el sector productor y distribuidor de planta viva, para la gestión de espacios naturales protegidos y para la productividad de explotaciones agrícolas. El servicio incluye la extracción de ADN de la muestra vegetal y la amplificación y obtención de secuencias código de barras, tanto cloroplásticas como nucleares, entre otras el gen rbcL (rubisco large subunit), el gen matK (maturase K) o la región ITS (intergenic spacer) del ADN ribosómico. Estas regiones resultan especialmente útiles por su variabilidad entre especies y la posibilidad de identificarlas con buena precisión taxonómica, además de ser lo bastante cortas como para secuenciarse con relativa facilidad, lo que las hace idóneas para una identificación rápida y precisa. Las secuencias obtenidas se alinean con repositorios de bases de datos de referencia y se identifican a nivel de especie según criterios de similitud genética, complementando el resultado con criterios taxonómicos basados en morfología, ecología o distribución. En hongos, donde la identificación morfológica de estructuras estériles o inmaduras resulta a menudo inviable, el servicio ofrece la identificación de muestras de esporocarpos, micorrizas y micelio mediante secuenciación Sanger, con especialización en la identificación molecular de micorrizas. Comprende la extracción de ADN de esporocarpos, micorrizas o micelio; la amplificación por PCR y obtención de secuencias de la región ITS del ADN ribosómico nuclear y, si se requiere, de otras regiones complementarias como LSU y SSU para estudios filogenéticos más detallados; y el análisis e identificación taxonómica final mediante el uso comparativo de bases de datos públicas y actualizadas de referencia de hongos.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Identificación molecular de especies de plantas CTAB | 679.78 € | 744.52 € | |
| Identificación molecular de especies de plantas kit | 653.36 € | 715.59 € | |
| Identificación Molecular de Insectos mediante DNA barcoding | 965.04 € | 1056.95 € | |
| Identificación molecular de hongos | 483.63 € | 529.69 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Metabolómica y Genómica Vegetal
- Instituto: ESTACION EXPERIMENTAL AULA DEI
- Localidad: Zaragoza (Zaragoza)
- Web del servicio: http://www.eead.csic.es/
Se ofrecen análisis de metabolitos y material genético en muestras vegetales. Se dispone de instrumentación, programas informáticos, bases de datos, protocolos, información, experiencia y conocimientos técnicos. La plataforma metabolómica, consistente en un UHPLC-MS Q-TOF y paquetes bioinformáticos, fue instalada en junio del 2021. La sección de genómica esta especializada en la aplicación y desarrollo de herramientas moleculares útiles para la mejora genética de cebada, especies frutales y vid. Las prestaciones disponibles son: - Análisis metabolómico mediante LC-Q/TOF MS - Análisis bioinformático de los resultados de metabolómica - Análisis HPLC-MS - Análisis de compuestos por UHPLC-MS-MS-Q-TOF - Estudios de DNA y RNA - Estudios de expresión génica: microchips de DNA y RT-PCR, ddPCR - Genotipificación, SNP, CNV - Asesoramiento de biología molecular en proyectos de mejora vegetal - Identificación molecular de especies - Identificación molecular de poblaciones
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
Los estudios de genómica funcional pueden incluir, desde el diseño de cebadores y análisis para los genes candidato de interés, hasta estudios de expresión génica diferencial en plantas crecidas en condiciones de estrés de hierro y sequía, o estrés combinado por sequía y cambio climático (concentraciones de CO2 y temperaturas elevadas, y limitación en la disponibilidad de agua). Los estudios se realizan en frutales y en vid.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies €/muestra | 214.13 € | 234.52 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio de análisis moleculares en cultivos frutales
- Instituto: INSTITUTO DE HORTOFRUTICULTURA SUBTROPICAL Y MEDITERRANEA LA MAYORA
- Localidad: Algarrobo (Málaga)
- Web del servicio: http://www.ihsm.uma-csic.es/
El servicio de análisis molecular en cultivos frutales, es un apoyo a la investigación en el centro. Se encuentra ubicado en la Estación Experimental La Mayora, Algarrobo-Costa, dentro de la comarca de la Axarquía, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción con numerosas empresas del sector agrícola, así como la colaboración con diferentes grupos de investigación del mismo sector. El objetivo principal del Servicio es prestar soporte científico y tecnológico para el análisis molecular de diferentes cultivos frutales a grupos de investigación y a diferentes empresas del sector agrícola que así lo requieran, en el ámbito nacional e internacional.
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
El servicio cuenta con tres laboratorios: un primer laboratorio donde se lleva acabo el proceso de extracción de ADN; un segundo laboratorio para realizar las PCR y un tercer laboratorio con analizadores de fragmentos para análisis de los mismos.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Caracterización molecular de especies €/muestra | 28.50 € | 31.22 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Molecular Ecology Service
- Instituto: INSTITUTO DE INVESTIGACION EN RECURSOS CINEGETICOS
- Localidad: Ciudad Real (Ciudad Real)
- Web del servicio: http://www.irec.es
El servicio ofrece apoyo a la investigación y asesoramiento en el empleo de técnicas moleculares para abordar cuestiones evolutivas, biogeográficas, ecológicas y de conservación y gestión de la biodiversidad. El servicio está preparado para la conservación de muestras de estudio (invasivas y no invasivas), extracción de ADN/ARN, puesta a punto y optimización de marcadores, amplificación por PCR, realización de electroforesis y análisis de geles, y preparación de muestras para su posterior secuenciación/genotipado. Igualmente, se ofrece servicio de análisis bioinformáticos a partir de los resultados obtenidos, así como asesoramiento y colaboración a la hora de interpretar los resultados. El servicio está concebido para colaborar activamente en el desarrollo de distintos estudios relacionados con la ecología molecular. Se ofrece, además, la posibilidad de realizar muestreos de campo para la toma de muestras biológicas y su posterior análisis en el laboratorio.
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
PCR especificas o secuenciación de amplicones para la identificación a nivel específico de muestras biológicas (sangre, tejidos, plumas, heces)| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies €/muestra | 38.85 € | 42.55 € |
Otras prestaciones de servicio
- Amplificación por PCR
- Análisis de fragmentos de DNA
- Determinación molecular del sexo
- Identificación molecular de paternidad
- Identificación molecular de poblaciones
- Muestreo
- Multiplex-PCR
- Quantitative PCR (qPCR)
- Sanger Sequencing
- Tratamiento muestra: Extracción
- Asesoría, consultoría y/o redacción de informes técnicos
- Análisis de muestras de ADN ambiental (eDNA)
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Laboratorio Genética COC
- Instituto: CENTRO OCEANOGRAFICO DE CANARIAS
- Localidad: Santa Cruz de Tenerife (Santa Cruz de Tenerife)
- Web del servicio: http://www.ieo.es/canarias
Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan para hacer frente a las necesidades del las diferentes lineas y proyectos de investigación del IEO con diferentes objetivos que abarcan : la identificación de especies, determinación del sexo de los individuos, determinación de relaciones de parentesco entre individuos, asignación de paternidad, detección de cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilización de marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos, y caracterización de comunidades microbianas.
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
Identificación de especies por PCR específicas (marcador a elegir según grupo taxonómico y objetivo del estudio) a partir de cualquier tipo de resto de tejido que contenga ADN (tejido fresco o seco reciente, preservado en etanol o congelado). La identificación de especies incluye extracción de ADN, amplificación por PCR, secuenciación de amplicones (servicio que se subcontrata fuera de las instalaciones), análisis de calidad de secuencias, homología con secuencias en las bases de datos, filogenia y elaboración de informe.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies €/muestra | 622.31 € | 681.57 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio de biología molecular
- Instituto: CENTRO OCEANOGRAFICO DE MALAGA
- Localidad: Málaga (Málaga)
- Web del servicio: http://www.ieo.es/malaga
El Centro Oceanográfico de Málaga (COMA) del Instituto Español de Oceanografía (IEO) cuenta entre sus instalaciones con un laboratorio de biología molecular y genética cofinanciado por el fondo europeo de desarrollo regional, y dotado de un conjunto de instrumentos que permiten aplicar técnicas de biología molecular a muestras biológicas y ambientales. El personal asociado al laboratorio tiene formación y amplia experiencia en biología molecular aplicada a recursos vivos marinos. Este conjunto de recursos materiales y humanos constituyen el servicio de biología molecular del COMA que presta apoyo a la investigación y el asesoramiento en ciencias marinas.
Identificación molecular de especies
Descripción de la prestación
Identificación genética de muestras de tejido de animales marinos (peces teleósteos, elasmobranquios, tortugas y aves marinas). El servicio incluye desde la extracción de ADN hasta la amplificación por PCR y secuenciación de marcador mitocondrial COI. La clasificación taxonómica se realiza mediante análisis comparativo con secuencias de referencia en bases de datos públicas. Consultar disponibilidad y plazo de entrega de resultados en función de la especie y volumen de muestras a caracterizar.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| identificación molecular de especies por barcoding (10 mues) | 574.57 € | 629.30 € | |
| Caracterización molecular de especies (1 muestra) | 218.65 € | 239.47 € |