- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
-
- Proteómica
Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
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SERVICIO DE ANÁLISIS DE PROTEÍNAS IBVF - Sevilla |
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IIBB - Barcelona |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE ANÁLISIS DE PROTEÍNAS
- Institute: INSTITUTO DE BIOQUIMICA VEGETAL Y FOTOSINTESIS
- Locality: Sevilla (Sevilla)
- Service's web: http://www.ibvf.csic.es/descripcion-analisis-proteinas
El objetivo principal del Servicio de Análisis de Proteínas del IBVF es la identificación de proteínas de interés biológico, mediante espectrometría de masas. Para ello, cuenta con diferentes equipos para la preparación y el análisis de las muestras: -Sistema para el recorte automatizado de proteínas en gel de una o dos dimensiones, Modelo EXQuest Biorad. -Espectrómetro de masas híbrido, Triple cuadrupolo-TOF acoplado a nanoLC, Modelo 5600, Sciex, que permite análisis LC-MS/MS.
Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
Benefit description
Triptic digestion and separation of simple protein mixtures (less than 5 proteins) by liquid chromatography and identification by triple quadrupole mass spectrometry and time of flight.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Protein identification by LC MSMS (less than 5 Proteins) | € / muestra | 276.61 € | 302.95 € |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Institute: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana. El laboratorio ocupa un espacio de 90 m2 en el que se disponen 4 espectrómetros de masas (4800 MALDI-TOF/TOF, Quantum Triple Quadrupole , LTQ Velos Linear ion trap y Orbitrap XL), diversos sistemas acoplados para cromatografía líquida convencional y nanocapilar (2xAgilet 1200, 2X Agilent 1100) y un sistema de IEF preparativo (IEF off-gel). Dispone asimismo de un robot para digestión automática (DigestPro MS, Intavis) y de los sistemas necesarios para la realización de geles 2D de tamaño pequeño y grande (2 x IPGphor y 2 x Ettan Dalt VI (GE), Protean y MiniProtean (BioRad)) así como para la adquisición y análisis de las imágenes (Scanner y SameSpots software). Dispone asimismo de aparataje propio necesario para el trabajo diario (centrífugas, arcones, etc).
Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
Benefit description
LC MS/MS is an efficient approach either for the exhaustive characterization of a protein sequence or for a general characterization of the proteins in a protein extract or a full proteome. The sample is digested with trypsin and the peptide digests loaded into a capillary chromatography system coupled to the mass spectrometer through a microelectrospray interface (also called nanospray interface). Peptides are separated by reversed phase chromatography using an acetonitrile gradient and directly eluted and ionized into the mass spectrometer. The mass spectrometer perform scan cycles consisting of a full scan from where it determines the mass of the peptide eluting at a given moment, followed by 5-10 consecutive MS/MS scans on the corresponding 5-10 more intense peptide signals detected in the MS scan. The identification of the peptides on the digest and hence of the original protein, is carried out from the MS/MS data using a search engine such as Sequest or Mascot. Note: When the sequence data obtained cannot be matched against the corresponding database (partially annotated species, presence of unexpected modifications), you may want to perform a de novo analysis of the data using PEAKS software.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 30 min. High Res-MS. | € / muestra | 271.33 € | 370 € |
Other services
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Coomassie Gel Staining
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Protein Separation by HPLC
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Tinción de gel con Plata
- Digestión FASP
- Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría