- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
-
- Proteómica
FASP digestion
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
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IIBB - Barcelona |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Institute: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana. El laboratorio ocupa un espacio de 90 m2 en el que se disponen 4 espectrómetros de masas (4800 MALDI-TOF/TOF, Quantum Triple Quadrupole , LTQ Velos Linear ion trap y Orbitrap XL), diversos sistemas acoplados para cromatografía líquida convencional y nanocapilar (2xAgilet 1200, 2X Agilent 1100) y un sistema de IEF preparativo (IEF off-gel). Dispone asimismo de un robot para digestión automática (DigestPro MS, Intavis) y de los sistemas necesarios para la realización de geles 2D de tamaño pequeño y grande (2 x IPGphor y 2 x Ettan Dalt VI (GE), Protean y MiniProtean (BioRad)) así como para la adquisición y análisis de las imágenes (Scanner y SameSpots software). Dispone asimismo de aparataje propio necesario para el trabajo diario (centrífugas, arcones, etc).
FASP digestion
Benefit description
FASP (Filter Aided Sample Preparation. See Wisniewski JR et al, 2009). A method for the treatment of proteins which are obtained with high concentrations of SDS (insoluble, membrane proteins) or other substances interfering with trypsin digestion. Between 25-150 µg of protein are loaded into an Amicon centrifugal filter (10-kDa cutoff). The sample in the filter is washed with 8 M Urea buffer followed by centrifugation. Proteins retained in the filter are alkylated and digested in situ. Tryptic peptides are recovered by addition of 3×100 µl of buffer and centrifugation.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Digestión FASP con tripsina | €/muestra | 105.89 € | 144.4 € |
Other services
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Coomassie Gel Staining
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Protein Separation by HPLC
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Tinción de gel con Plata
- Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría