- Áreas de investigación
-
- Biología y Biomedicina
- Grupo
-
- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
-
- Proteómica
Protein identification by de novo sequencing
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
|
IIBB - Barcelona |
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Institute: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana. El laboratorio ocupa un espacio de 90 m2 en el que se disponen 4 espectrómetros de masas (4800 MALDI-TOF/TOF, Quantum Triple Quadrupole , LTQ Velos Linear ion trap y Orbitrap XL), diversos sistemas acoplados para cromatografía líquida convencional y nanocapilar (2xAgilet 1200, 2X Agilent 1100) y un sistema de IEF preparativo (IEF off-gel). Dispone asimismo de un robot para digestión automática (DigestPro MS, Intavis) y de los sistemas necesarios para la realización de geles 2D de tamaño pequeño y grande (2 x IPGphor y 2 x Ettan Dalt VI (GE), Protean y MiniProtean (BioRad)) así como para la adquisición y análisis de las imágenes (Scanner y SameSpots software). Dispone asimismo de aparataje propio necesario para el trabajo diario (centrífugas, arcones, etc).
Protein identification by de novo sequencing
Benefit description
De Novo protein sequencing is the process by which the amino acid sequence of a peptide is derived without prior knowledge of the DNA or protein sequence. This differs from sequence database identification, where the protein/DNA sequence is already known. De Novo protein sequencing are performed by MS/MS (see protein identification) and the MS/MS spectra are interpreted using the PEAKS program.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Gradiente 30 min. High resolution MS. | € / muestra | 271.33 € | 370 € |
| Gradiente 60 min. High resolution MS. | €/ muestra | 318.63 € | 434.49 € |
| Gradiente 90 min. High resolution MS. | € / muestra | 365.63 € | 498.59 € |
| Gradiente 180 min. High resolution MS. | € / muestra | 443.58 € | 604.88 € |
Other services
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Coomassie Gel Staining
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Protein Separation by HPLC
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Tinción de gel con Plata
- Digestión FASP
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría