- Áreas de investigación
-
- Ciencia y Tecnologías Físicas, Matemáticas, Robótica y Computación
- Grupo
-
- TIC, Análisis Computacional y Matemático y Cartográfico
- TIC, Análisis Computacional y Matemático y Cartográfico
- Subagrupación
-
- Informática, Electrónica y Procesado
- Software
Desarrollo de software científico
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
|
CNB - Madrid |
|||
|
SERVICIO DE TÉCNICAS NO DESTRUCTIVAS MNCN - Madrid |
|||
|
Ciencia de datos agrigenómicos y climáticos EEAD - Zaragoza |
|||
|
Servicio de Bioinformática y Biología Computacional IPBLN - Armilla |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: INFORMÁTICA CIENTÍFICA
- Instituto: CENTRO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cnb.csic.es/
Idiomas: EN, ES, FR. Bioinformática: análisis de datos procedentes de secuenciación masiva (NGS), metagenómica, análisis, anotación y ensamblaje de genomas, filogenia, etc. Biocomputación: Modelado y simulación de macromoléculas, e interacciones moleculares, dinámica molecular, docking, análisis de afinidad por drogas, modelos de química cuántica. Computación Científica: modelos matemáticos, estadísticos y epidemiológicos complejos. Desarrollo y programación científica: (+20 lenguajes, web, paralela y distribuída) Formación: Realización de cursos de ámbito internacional en los temas de experiencia del servicio, tales como: Bioestatistics, Phylogeny, Metagenomics, Programming, Molecular Modeling. Coordinación: coordinación con otros servicios, instituciones y grupos de investigación a nivel internacional. Equipamiento: Equipo de cómputo dedicado, acceso a los clusters del CNB, del CSIC y del CESGA. Servidor web: cnb.csic.es
Desarrollo de software científico
Descripción de la prestación
El Servicio cuenta con una larga experiencia en el desarrollo de software científico, tanto de aplicaciones basadas en web, web services, aplicaciones paralelas y distribuñidas, computación en Grid, etc... en un amplio número de técnicas y lenguajes de programación (modernos y antíguos, entre ellos, C, C++, Fortran, Java, Javascript, Python, Perl, PHP, MatLab, SQL, Pascal, Bash, Csh, y muchos otros). Para solicitar la elaboración de una actividad de desarrollo (base de datos, programa, servicio web, etc...) 1) El solicitante debe contactar al Servicio y exponer su problema 2) El Servicio evaluará la existencia de soluciones adecuadas y elaborará una estrategia de trabajo en caso de ser necesario en colaboración con el solicitante 3) El trabajo se hará usando el estado del arte en desarrollo, con la debida documentación, unidades de prueba y depuración, control de versiones, eficiencia, control de calidad, etc... 4) En general, se prefiere el uso de un proceso de desarrollo ágil e iterativo, en el que se añaden prograsivamente mejoras hasta alcanzar la satisfacción del solicitante 5) El solicitante puede cancelar el desarrollo en cualquier momento si considera que los resultados obtenidos hasta el momento son suficientes y no es preciso continuar. 6) El desarrollo se hará en la medida de lo posible usando herramientas distribuídas de desarrollo, coordinación y gestión de versiones (tales como GIT ó SourceForge) para dar acceso inmediato al solicitante a las últimas versiones. 7) Por defecto, todos los desarrollos realizados por el Servicio se entregan bajo una licencia EU-GPL siguiendo los consejos de la UE para los servicios públicos. Si el solicitante desea que el trabajo se realize bajo otra licencia deberá notificarlo por adelantado para su valoración. Coste: El coste up-front del desarrollo no puede establecerse de forma fija. Como norma general, se hará una evaluación preliminar, con un análisis de viabilidad y riesgos y se proporcionará una estimación aproximada del coste mínimo y máximo, periódos de entrega y calidades, usando como unidad de medida la hora de trabajo y basando la estimación en el coste estimado de cada ciclo de desarrollo.. El coste total dependerá del coste de la hora de trabajo, el número de horas estimado para cada ciclo, y el número de ciclos de desarrollo finalmente empleados para satisfacer las necesidades del solicitante.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Desarrollo de software | € / hora | 84.02 € | 92.02 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: SERVICIO DE TÉCNICAS NO DESTRUCTIVAS
- Instituto: MUSEO NACIONAL DE CIENCIAS NATURALES
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.mncn.csic.es/
El Servicio de Análisis por Técnicas No destructivas del MNCN-CSIC de Madrid presta su asistencia a aquellos departamentos y/o grupos de Investigación del MNCN así como a otros organismos o entidades públicas o privadas, que así lo soliciten. El Servicio cuenta con un Microscopio Electrónico de Barrido Ambiental (QUANTA 200, con opción de Alto y Bajo Vacío y modo Ambiental) con EDS y WDS y Peltier de enfriamiento y calentamiento; un Microscopio Electrónico de Barrido de Bajo y Alto Vacío (Inspect) con EDS y Catodoluminiscencia espectral y de imagen en UV-IR; Microscopio Confocal con espectroscopia RAMAN con pletina de enfriamiento, un Microscopio Confocal Espectral de fluorescencia, Tomografía Computerizada de Rayos X (CT-scan), un Microscopio 3D de alta resolución y equipos de apoyo como el de de análisis térmico ATD/ TGA (Perkin Elmer) y un analizador de la distribución del tamaño de partícula por difracción láser (Beckman- Coulter), Secado por punto Crítico y metelizadores de Au
Desarrollo de software científico
Descripción de la prestación
Prestación que consiste en uso de software en una estación de trabajo para el tratamiento de imágenes científicas que permite varias aplicaciones en diferentes áreas. Proporciona el análisis de imágenes bidimensionales y tridimensionales obtenidas en equipamientos científicos como el CT SCAN, Microscopías Electrónicas y Confocales Y Microdifracción de Rayos x. PROGRAMAS INFORMÁTICOS: Last AF-Rugosidad VG Studio MAX: Volúmenes y Porosimetria EVA Y TOPAS: Análisis cualitativo y cuantitativo cristalino| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| desarrollo sw cientifico-DRX EVA Y TOPAS | € / hora | 58.32 € | 63.88 € |
| desarrollo sw cientifico-VG STUDIO Y RUGOSIDAD | € / hora | 64.97 € | 71.16 € |
| desarrollo de sw cientifico-DRX EVA Y TOPAS AUTOSERVICIO | € / h | 58.32 € | 63.88 € |
Otras prestaciones de servicio
- Analisis por microscopía confocal
- Análisis térmico diferencial y termogravimétrico (ATD, TG)
- Asesoramiento y elaboración de informes analíticos
- Caracterización estructural: XRD (Difracción de Rayos X) agregados orientados
- Caracterización estructural: XRD (Difracción de Rayos X) en polvo cualitativo
- Caracterización estructural: XRD (Difracción de Rayos X) en polvo cuantitativo
- Espectroscopía micro-Raman
- Metalización (Sputtering)
- Scanning electron microscopy (SEM): Cryo SEM
- Microscopía Electrónica de Barrido (SEM): Espectroscopia de rayos X por dispersión de energía
- Microscopía electrónica de barrido (SEM) : Microscopio ambiental
- TEM: STEM (Scanning Transmission Microscopy)
- Ciclos térmicos complejos con control riguroso de temperaturas , tiempos y velocidades de calentamiento y enfriamiento
- Tomografía computerizada CT-Scan X-ray
- Microscopía electrónica de barrido (SEM): Microanálisis de rayos X por dispersión de longitudes de onda (WDS) y catodoluminiscence (CL)
- Suministro de reactivos generales y soportes para microscopía
- Microscopía Óptica confocal 3D alta resolución-perfilometría-interferometría
- Secado por punto crítico (Critical Point Dryer)
- Microdifracción de rayos X No destructiva
- Criomicroscopía Correlativa
- Microscopia electrónica de barrido (SEM) : Emisión de Campo - FEGSEM
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Ciencia de datos agrigenómicos y climáticos
- Instituto: ESTACION EXPERIMENTAL AULA DEI
- Localidad: Zaragoza (Zaragoza)
- Web del servicio: http://www.eead.csic.es/
El catálogo de servicios que ofrecemos incluye: [1] Desarrollo de software para el análisis y anotación de resultados de experimentos de secuenciación masiva [2] Ultrasecuenciación: Determinación de regiones enriquecidas en experimentos ChIP-seq. [3] Modelado de estructura de proteínas y ácidos nucleicos. [4] Herramientas para la exploración y análisis interactivo de datos [5] Consultoría y Servicios de datos climáticos Los usuarios interesados en estos servicios deben contactar con los responsables por medio del correo electrónico: compbio@eead.csic.es
Desarrollo de software científico
Descripción de la prestación
Consultoría para el desarrollo de marcadores moleculares, normalmente secuencias de ADN, pero también de proteínas, que puedan servir para la identificación de microorganismos o alelos de interés en una población. Proyectamos software a medida para esta tarea.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Desarrollo de software científicao | € / h | 101.43 € | 111.09 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio de Bioinformática y Biología Computacional
- Instituto: INSTITUTO DE PARASITOLOGIA Y BIOMEDICINA LOPEZ NEYRA
- Localidad: Armilla (Granada)
- Web del servicio: http://www.ipb.csic.es/servicios/Bioinformatica/index.html
La unidad de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina Lopez-Neyra se dedica a dar soporte a los investigadores en sus análisis, así como la colaboración en los análisis de datos a gran escala. Construcción y mantenimiento de una infraestructura computacional que permite a los investigadores implementar soluciones eficaces a la hora de analizar, visualizar o interpretar datos, principalmente genómicos. Formación y fomento de conocimiento a través de cursos y seminarios para los usuarios. Servicios disponibles: 1.Técnicas de Análisis de expresión (RNA-Seq o microarrays) 2.Técnicas de Análisis de asociacion de Genoma (GWAS) 3.Análisis funcionales
Desarrollo de software científico
Descripción de la prestación
El desarrollo de software científico para la bioinformática implica la creación de herramientas de software que se utilizan para procesar y analizar datos biológicos, como secuencias de ADN y proteínas entre otros. Existen programas ya creados que procesan datos en unos formatos predeterminados y que generan unos resultados también en un formato conocido. Sin embargo este no es siempre el caso, hay veces que se necesita crear nuevos programas para nuevos tipos de datos (o datos no estructurados), que necesitan de la creación de un programa a medida capaz de leer esos datos, interpretar su contenido y obtener un resultado de ellos. Normalmente, el flujo de trabajo es el siguiente: * Definición de los requisitos del software: esto implica determinar qué tipo de análisis de datos biológicos se van a realizar con el software y qué características debe tener el software para satisfacer las necesidades del usuario. * Diseño del software: una vez que se han definido los requisitos del software, se diseña la arquitectura y la interfaz del usuario para el software. * Implementación del software: en esta etapa, se codifica el software utilizando lenguajes de programación adecuados para la bioinformática, como Python, R o Perl. * Pruebas del software: se realizan pruebas exhaustivas para asegurarse de que el software funciona como se espera y de que los resultados son precisos y reproducibles. * Documentación del software: se crea una documentación detallada para el software, que incluye información sobre cómo usar el software, cómo interpretar los resultados y cómo citar el software en publicaciones científicas. * Mantenimiento del software: el software debe actualizarse y mantenerse regularmente para garantizar que siga funcionando correctamente y para incorporar nuevas características y funcionalidades. Esta prestación se ofrece con la finalidad de proveer a los interesados la capacidad de analizar datos que hayan sido obtenidos de forma manual (como casos clínicos) o con metodologías fuera de lo común. También sirve para crear nuevos protocolos con software recién publicado que quiera incorporarse en algún proyecto de investigación.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Desarrollo de software científico a medida | € / hora | 48.27 € | 52.87 € |