Análisis de imagen digital

El Servicio de Microscopía Óptica Avanzada (SMOA) es un servicio central de apoyo a la investigación del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. El SMOA dispone de sistemas avanzados de microscopía óptica, así como equipamiento informático especializado en la visualización y el análisis de imágenes. El equipo técnico del SMOA gestiona y mantiene los equipos de microscopía e informáticos, brinda soporte científico-técnico y asesora y forma (mediante seminarios y sesiones teórico-prácticas) a los investigadores en las técnicas de microscopía óptica. Asimismo, el personal del SMOA almacena y distribuye reactivos relacionados con estas técnicas y trabaja para mantener el servicio actualizado, incorporando y configurando nuevos sistemas. El SMOA pertenece a la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada (REMOA), a la Red de Laboratorios e Infraestructuras (RedLab) y a la Plataforma de Microscopía para Biociencias y mantiene una acreditación de calidad y control ISO 9001:2015 (AENOR).

La unidad de microscopía e histología es un servicio de investigación que ofrece la posibilidad de preparar muestras y observarlas por microscopía óptica y confocal. La unidad provee acceso al siguiente equipamiento: Estación automática de deshidratación e inclusión de muestras en parafina, dos criostatos, un vibratomo, un micrótomo, cuatro microscopios de luz transmitida y epifluorescencia, dos de ellos invertidos y todos con microfotografía digital, un microscopio estereológico, un microscopio confocal, y un microscopio spinning disk. También se dispone de una workstation de última generación con diferentes softwares de análisis de imágenes: ImageJ/Fiji, Cell Profiler, LAS X y ZEN Blue. La unidad de histología y microscopia proporciona asistencia técnica desde el diseño de experimentos hasta el análisis de los resultados obtenidos. Su función es proveer un servicio de calidad en técnicas histológicas y microscopia óptica.

Los grupos de Investigación del IPBLN son asistidos por esta unidad de apoyo que además presta sus servicios a otras Instituciones, Hospitales y Empresas en Granada. El servicio se subdivide en dos sub-unidades: Unidad de Microscopía (UM) y la Unidad de Análisis de Imágenes Digitales (UAID). Equipamiento del Servicio (mas detalle en pagina web) Zeiss Axio Imager A1: Microscopio epifluorescencia vertical/Leica DM2000: Microscopio de Luz Transmitida. Digitalizado de imagen/Olympus ix81: Microscopio epifluorescencia invertido. Exp. in vivo/ Leica sp5: Microscopio confocal. Lineas laser: Diodo UV, Argón ( 458,476, 488,496 y 514nm), HeNe 561,HeNe 633/ Leica DMi8 célula viva: platina motorizada, alta sensibilidad, precisión y velocidad. Software avanzado. Iluminacion LED/. Leica sp8 STED: laser blanco. Lightning y STED. El Servicio de Microscopia ofrece asesoria y formación en Análisis de imagen Digital. Dispone de distintos softwares para tal fin: Imaris, Huygens y otros de uso libre.

El Servicio de Microscopía, Confocal e Imagen es un servicio científico-técnico del IRNASA (en adelante SMCI) que se constituye con los objetivos siguientes: - Gestión de los equipos y recursos de Microscopía óptica y confocal en el IRNASA – CSIC, ofreciendo también su servicio a usuarios externos. El SMCI ofrece servicios para la obtención de imágenes y tratamiento para su posterior uso en la investigación, tanto al personal del IRNASA como a otros OPIs, Universidades o empresas privadas.

Permite a los distintos grupos de investigación del IATA, así como de otros centros y empresas, la observación microscópica y la microfotografía digital de distintos tipos de muestras, utilizando diferentes técnicas de microscopía óptica como: campo claro, luz polarizada, contraste de fases, contraste interdiferencial o Nomarsky, y fluorescencia. Para la microscopía de fluorescencia, pueden utilizarse 3 bloques de filtros diferentes para visualizar simultáneamente sobre la misma muestra distintos fluoróforos: DAPI,FITC, TRITC. Ejemplos de muestras con las que habitualmente trabajamos: Fibras y películas de distintos materiales (poliméricos, orgánicos,…) Salsas y masas panarias Rebanadas de pan Microorganismos: bacterias, levaduras y hongos filamentosos Células animales y humanas en cultivo Cortes histológicos Organismos pluricelulares modelo: C. elegans, A. thaliana

El Basque Resource for Advanced Light Microscopy (BRALM) del Instituto Biofisika es un servicio que ofrece equipamiento y recursos punteros de microscopía óptica avanzada y análisis digital de imagen. BRALM se enfoca en el análisis cuantitativo de imagen de eventos celulares a través de la implementación de sofisticados modos de imagen y análisis de datos. BRALM forma parte del nodo "Advanced Light Microscopy Node Bilbao (ALM@BIO)" de la red EuroBioImaging ERIC. Más información: https://bralm.biofisika.org

Proporciona soporte técnico y formación a los usuarios en técnicas y manejo de equipos de microscopía. Además, lleva a cabo la adquisición y el procesamiento de las imágenes obtenidas mediante este equipamiento u otros dispositivos.

La Unidad MASTER del Centro de Investigaciones Interdisciplinares de Alcalá (Ci2A) es una instalación de microscopía avanzada dedicada a proporcionar servicios de alta calidad en el ámbito de la investigación científica. Esta unidad está equipada con tecnología de vanguardia en microscopía óptica, confocal de alta resolución, mesoscópica y de alto desempeño, lo que permite a los investigadores obtener imágenes detalladas y precisas de muestras biológicas y materiales diversos. Los servicios ofrecidos por la Unidad MASTER están diseñados para satisfacer las necesidades específicas de la comunidad científica, facilitando el acceso a herramientas y técnicas avanzadas de imagen que son fundamentales para el progreso en campos como la neurociencia, la biología celular y molecular, y las ciencias químicas. Además, la unidad cuenta con personal altamente cualificado que brinda asesoramiento y apoyo técnico a los usuarios, garantizando la correcta utilización de los equipo.