Análisis de imagen digital

Servicio de Microscopía óptica y de fluorescencia dotado para adquisición de imagen con dos microscopios confocales Leica (modelos SP5 y SP8 STED 3X); Un microscopio Leica THUNDER con aclaramiento computacional instantaneo. Cámaras para fluorescencia (K5) y para histología (Flexacam). Un microscopio multidimensional de campo ancho Leica AF6000LX con CCD y software de adquisición y análisis LASX de Leica. Control de tª y CO2. Platina motorizada. Un microscopio DMi8 Leica con cámara sCMOS Orca Flash 4.0 LT y divisor W-View Gemini para la adquisición simultánea de dos canales: GFP y mCherry. Control de tª. Software de adquisición y análisis Metamorph Un Un microscopio Zeiss axioplan de epifluorescencia y contraste de fase con cámara Leica DFC 350FX Un Estereomicroscopio Leica MZ16FA con cámara en color Leica DCF490. Sistema de microfluídica CELLASIC ONIx2 Estacion de trabajo para análisis y procesamiento de imágenes. Huygens: deconvolución y colocalización.

El Servicio de Microscopía Óptica Avanzada (SMOA) es un servicio central de apoyo a la investigación del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. El SMOA dispone de sistemas avanzados de microscopía óptica, así como equipamiento informático especializado en la visualización y el análisis de imágenes. El equipo técnico del SMOA gestiona y mantiene los equipos de microscopía e informáticos, brinda soporte científico-técnico y asesora y forma (mediante seminarios y sesiones teórico-prácticas) a los investigadores en las técnicas de microscopía óptica. Asimismo, el personal del SMOA almacena y distribuye reactivos relacionados con estas técnicas y trabaja para mantener el servicio actualizado, incorporando y configurando nuevos sistemas. El SMOA pertenece a la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada (REMOA), a la Red de Laboratorios e Infraestructuras (RedLab) y a la Plataforma de Microscopía para Biociencias y mantiene una acreditación de calidad y control ISO 9001:2015 (AENOR).

La unidad de microscopía e histología es un servicio de investigación que ofrece la posibilidad de preparar muestras y observarlas por microscopía óptica y confocal. La unidad provee acceso al siguiente equipamiento: Estación automática de deshidratación e inclusión de muestras en parafina, dos criostatos, un vibratomo, un micrótomo, cuatro microscopios de luz transmitida y epifluorescencia, dos de ellos invertidos y todos con microfotografía digital, un microscopio estereológico, un microscopio confocal, y un microscopio spinning disk. También se dispone de una workstation de última generación con diferentes softwares de análisis de imágenes: ImageJ/Fiji, Cell Profiler, LAS X y ZEN Blue. La unidad de histología y microscopia proporciona asistencia técnica desde el diseño de experimentos hasta el análisis de los resultados obtenidos. Su función es proveer un servicio de calidad en técnicas histológicas y microscopia óptica.

Los grupos de Investigación del IPBLN son asistidos por esta unidad de apoyo que además presta sus servicios a otras Instituciones, Hospitales y Empresas en Granada. El servicio se subdivide en dos sub-unidades: Unidad de Microscopía (UM) y la Unidad de Análisis de Imágenes Digitales (UAID). Equipamiento del Servicio (mas detalle en pagina web) Zeiss Axio Imager A1: Microscopio epifluorescencia vertical/Leica DM2000: Microscopio de Luz Transmitida. Digitalizado de imagen/Olympus ix81: Microscopio epifluorescencia invertido. Exp. in vivo/ Leica sp5: Microscopio confocal. Lineas laser: Diodo UV, Argón ( 458,476, 488,496 y 514nm), HeNe 561,HeNe 633/ Leica DMi8 célula viva: platina motorizada, alta sensibilidad, precisión y velocidad. Software avanzado. Iluminacion LED/. Leica sp8 STED: laser blanco. Lightning y STED. El Servicio de Microscopia ofrece asesoria y formación en Análisis de imagen Digital. Dispone de distintos softwares para tal fin: Imaris, Huygens y otros de uso libre.

El Servicio de Microscopía, Confocal e Imagen es un servicio científico-técnico del IRNASA (en adelante SMCI) que se constituye con los objetivos siguientes: - Gestión de los equipos y recursos de Microscopía óptica y confocal en el IRNASA – CSIC, ofreciendo también su servicio a usuarios externos. El SMCI ofrece servicios para la obtención de imágenes y tratamiento para su posterior uso en la investigación, tanto al personal del IRNASA como a otros OPIs, Universidades o empresas privadas.

Permite a los distintos grupos de investigación del IATA, así como de otros centros y empresas, la observación microscópica y la microfotografía digital de distintos tipos de muestras, utilizando diferentes técnicas de microscopía óptica como: campo claro, luz polarizada, contraste de fases, contraste interdiferencial o Nomarsky, y fluorescencia. Para la microscopía de fluorescencia, pueden utilizarse 3 bloques de filtros diferentes para visualizar simultáneamente sobre la misma muestra distintos fluoróforos: DAPI,FITC, TRITC. Ejemplos de muestras con las que habitualmente trabajamos: Fibras y películas de distintos materiales (poliméricos, orgánicos,…) Salsas y masas panarias Rebanadas de pan Microorganismos: bacterias, levaduras y hongos filamentosos Células animales y humanas en cultivo Cortes histológicos Organismos pluricelulares modelo: C. elegans, A. thaliana

El Basque Resource for Advanced Light Microscopy (BRALM) del Instituto Biofisika es un servicio que ofrece equipamiento y recursos punteros de microscopía óptica avanzada y análisis digital de imagen. BRALM se enfoca en el análisis cuantitativo de imagen de eventos celulares a través de la implementación de sofisticados modos de imagen y análisis de datos. BRALM forma parte del nodo "Advanced Light Microscopy Node Bilbao (ALM@BIO)" de la red EuroBioImaging ERIC. Más información: https://bralm.biofisika.org

La Unidad de Histología, ubicada en la zona común de la cuarta planta de IBV-CSIC, incluye: Procesador automático de tejidos semicerrado con sistema de extracción de vapores mediante filtración por carbono activado (Spin Tissue Processor STP 120, Myr), Equipo de inclusión en parafina de muestras histológicas (Modular Tissue Embedding Center 350, Myr), 2 Micrótomos semimotorizados (Rotary microtome HM 340 E, Microm; Micrótomo Histocore Biocut Leica), 2 Criostatos semimotorizados (Leica 1900; CM1860UV), vibrátomo (VT1200 Leica) y Microscopio con cámara integrada (DM750 Leica); Teñidor automatizado (GEMINI, Thermo); y Montador cubreobjetos automatizado (CTM6, Thermo); estufa convencional (Thermo scientific); y Microscopio de rutina (LanOptics BK1000) . Las prestaciones incluyen: 1.- preparación del bloque de parafina; 2) corte con micrótomo (parafina); 3) corte con criostato; 4) corte mediante vibrátomo; 5) tinción y montaje automatizados

Proporciona soporte técnico y formación a los usuarios en técnicas y manejo de equipos de microscopía. Además, lleva a cabo la adquisición y el procesamiento de las imágenes obtenidas mediante este equipamiento u otros dispositivos.

La Unidad MASTER del Centro de Investigaciones Interdisciplinares de Alcalá (Ci2A) es una instalación de microscopía avanzada dedicada a proporcionar servicios de alta calidad en el ámbito de la investigación científica. Esta unidad está equipada con tecnología de vanguardia en microscopía óptica, confocal de alta resolución, mesoscópica y de alto desempeño, lo que permite a los investigadores obtener imágenes detalladas y precisas de muestras biológicas y materiales diversos. Los servicios ofrecidos por la Unidad MASTER están diseñados para satisfacer las necesidades específicas de la comunidad científica, facilitando el acceso a herramientas y técnicas avanzadas de imagen que son fundamentales para el progreso en campos como la neurociencia, la biología celular y molecular, y las ciencias químicas. Además, la unidad cuenta con personal altamente cualificado que brinda asesoramiento y apoyo técnico a los usuarios, garantizando la correcta utilización de los equipo.

Servicio especializado en análisis anatómico de plantas, hongos y líquenes mediante microscopía óptica (campo claro, contraste de interferencia diferencial/DIC y fluorescencia). Ofrecemos preparación completa de muestras, obtención de cortes histológicos y tinciones, así como asesoramiento técnico para facilitar la obtención de resultados de alta calidad en estudios taxonómicos, funcionales y comparativos.