- Áreas de investigación
-
- Ciencia y Tecnología de Materiales
- Humanidades
- Ciencias Sociales
- Grupo
-
- TIC, Análisis Computacional y Matemático y Cartográfico
- TIC, Análisis Computacional y Matemático y Cartográfico
- Análisis y métodos en Ciencias Sociales
- Subgroup
-
- Análisis Numérico y Estadístico
- Modelado y Simulación Multifísica
- Análisis Numérico y Estadístico
Scientific advice in modelling, computing and simulation
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
|
CNB - Madrid |
|||
|
Servicio de análisis y determinación estructural IPNA - San Cristóbal de La Laguna |
|||
|
LABORATORIO DE ESPECTRO-RADIOMETRÍA Y TELEDETECCIÓN AMBIENTAL (SpecLab) ICA - Madrid |
|||
|
SERVICIO DE INSTRUMENTACIÓN, MODELIZACIÓN, ANÁLISIS Y PROCESAMIENTO EN OCEANOGRAFÍA (IMAPEO) IIM - Vigo |
|||
|
IEM - Madrid |
|||
|
IFISC - Palma de Mallorca |
|||
|
IMEDEA - Esporles |
Service general data
- Support unit: INFORMÁTICA CIENTÍFICA
- Institute: CENTRO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.cnb.csic.es/
Idiomas: EN, ES, FR. Bioinformática: análisis de datos procedentes de secuenciación masiva (NGS), metagenómica, análisis, anotación y ensamblaje de genomas, filogenia, etc. Biocomputación: Modelado y simulación de macromoléculas, e interacciones moleculares, dinámica molecular, docking, análisis de afinidad por drogas, modelos de química cuántica. Computación Científica: modelos matemáticos, estadísticos y epidemiológicos complejos. Desarrollo y programación científica: (+20 lenguajes, web, paralela y distribuída) Formación: Realización de cursos de ámbito internacional en los temas de experiencia del servicio, tales como: Bioestatistics, Phylogeny, Metagenomics, Programming, Molecular Modeling. Coordinación: coordinación con otros servicios, instituciones y grupos de investigación a nivel internacional. Equipamiento: Equipo de cómputo dedicado, acceso a los clusters del CNB, del CSIC y del CESGA. Servidor web: cnb.csic.es
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
The Service has a long and ample experience in the analysis of scientific data. We can provide consultancy in all our areas of expertise, including: Bioinformatics (Sequence Analysis, genomics, proteomics, metagenomics, pangenomics, DNAseq, RNAseq, etc...) Biocomputing (structure prediction, molecular modelling, Molecular Mechanics, Molecular Dynamics, Quantum Mechanics, Quantum Dynamics, Docking, Drug Screening, etc...) Phylogeny (methods based on Distances, Parsimony, Maximum Likelihood, Bayesian, Phylogenomics, geo-phylogeny, etc...) Computational Chemistry (Quantum Mechanics, Quantum Dynamics, Optimization, Electronic Structure, Reaction modelling, etc...) Systems modelling (Systems Biology, metabolic models, reaction models, population models, interaction networks, etc...) Advanced Biostatistics (Multivariate Analysis, CCA, PCA, Longitudinal Analysis, TIme Series, Curve fitting, Non-linear models, epidemiology, etc...) Programming (various operating systems and languages: C, C++, Fortran, Java, Python, Perl, PHP, SQL, Ada, Pascal, Modula, MatLab, etc...) Project Management (ISO 21500) Risk Management (UNE/ISO/ANSI 31000, 31004)| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Bioinformatics: DNAseq RNAseq Pangen .Metagen. Proteom | Hora o fracción | 89.67 € | 98.21 € |
| Biología Computacional | Hora o fracción | 89.67 € | 98.21 € |
| Muestreo | Hora o fracción | 89.67 € | 98.21 € |
| Systems Biology | Hora o fracción | 89.67 € | 98.21 € |
Service general data
- Support unit: Servicio de análisis y determinación estructural
- Institute: INSTITUTO DE PRODUCTOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA
- Locality: San Cristóbal de La Laguna (Santa Cruz de Tenerife)
- Service's web: http://www.ipna.csic.es/
El servicio de análisis y determinación estructural incluye diversas técnicas utilizadas para determinar la composición elemental y la estructura molecular de sustancias químicas puras o de mezclas de las mismas. Adicionalmente se podrán cuantificar las sustancias en mezclas simples o complejas. El servicio dispone de equipos de: 1.- Análisis elemental 2.- Infrarrojo 3.- UV-visible 4.- Polarímetro para determinación de actividad óptica 5.- Espectrometría de masas 6.- Espectroscopía de resonancia magnética nuclear 7.- UV-Con esfera integradora 8.- Servicio de cálculo científico 9.- Sistema de purificación de disolvente (SPS)
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
The service will be in charge of providing reliable results about structures, conformations, transition states, reaction coordinates, etc. in close collaboration with the end user, leading to the structural determination of small, medium and large size organic and organometallic molecules.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Cálculos de Mecánica Molecular y Dinámica Molecular | Hora o fracción | 53.31 € | 58.39 € |
| Cálculos Ab-initio | Hora o fracción | 53.31 € | 58.39 € |
| Simulación Espectroscópica | Hora o fracción | 53.31 € | 58.39 € |
Other services
- Análisis de compuestos: GC-MS
- Análisis de compuestos: MS MALDI-ToF
- Análisis de compuestos: RMN
- Análisis de compuestos: UPLC-MS-MS-QTOF
- Análisis elemental CHSN
- Caracterización de actividad óptica, dicroísmo circular y dispersión óptica rotatoria
- Procesamiento e interpretación de espectros
- Espectroscopía: ATR-FTIR (Attenuated Total Reflection - IRTF)
- Spectroscopy: UV - Visible spectral reflectometry
- Análisis de compuestos: MS ESI-TOF
- Formación en uso de software científico
Service general data
- Support unit: LABORATORIO DE ESPECTRO-RADIOMETRÍA Y TELEDETECCIÓN AMBIENTAL (SpecLab)
- Institute: INSTITUTO DE CIENCIAS AGRARIAS
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.ica.csic.es/
SpecLab desarrolla investigación básica y aplicada en el campo de la teledetección y, más concretamente, en la espectroscopia de laboratorio y de campo. Una de las actividades principales del laboratorio es el diseño e implementación de campañas de campo y laboratorio para obtener mediciones espectrales que permitan derivar, por sí solos o en combinación con la información de sensores aerotransportados y / o a bordo de satélites, parámetros biofísicos de la vegetación e indicadores relevantes para la gestión ambiental tanto en ecosistemas naturales como en zonas agrícolas. El laboratorio se fundó el 1 de Septiembre de 2007 y está gestionado por el grupo de investigación "Análisis Geográfico multi-escalar del Cambio Global" del ICA-CSIC. Este grupo tiene una amplia experiencia en el uso de herramientas y técnicas de espectroscopía de campo y en el procesamiento e interpretación de datos de sensores aéreos y satelitales.
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
Development, implementation, and application of radiative transfer models and models associated with land surface processes or Earth-atmosphere exchange, based on data obtained through proximal and remote sensing systems.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| CONSULTORÍA CIENTÍFICA EN MODELIZACIÓN, COMPUTACIÓN Y SIMULA | Hora o fracción | 104.75 € | 114.73 € |
Other services
- Análisis, adquisición y tratamiento de imágenes de satélite y de ortofotografía aérea
- Adquisición y procesamiento de imágenes hiperespectrales y térmicas desde plataformas aéreas
- Calibración de espectrorradiómetros
- Adquisición de firmas espectrales en campo y en laboratorio mediante espectro-radiómetro portátil (rango óptico)
- Adquisición de información geográfica con GPS y/o PDA y/o dispositivos móviles. Diseño de secuencias de adquisición de datos en campo
- Adquisición de series temporales de datos sobre recursos naturales
Service general data
- Support unit: SERVICIO DE INSTRUMENTACIÓN, MODELIZACIÓN, ANÁLISIS Y PROCESAMIENTO EN OCEANOGRAFÍA (IMAPEO)
- Institute: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES MARINAS
- Locality: Vigo (Pontevedra)
- Service's web: http://www.iim.csic.es/
En el Servicio IMAPeO realizamos todos los pasos para garantizar obtener datos representativos y rigurosos. - Asesoramiento técnico en diseño de toma, procesado e interpretación de datos. - Desarrollo y mejora de equipos oceanográficos. - Integración de equipos. - Toma de datos y muestras. - Procesado y análisis de datos oceanográficos. - Modelización.
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| General | Hora o fracción | 648.54 € | 710.31 € |
Service general data
- Support unit: Física Macromolecular
- Institute: INSTITUTO DE ESTRUCTURA DE LA MATERIA
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.biophym.iem.csic.es/index.php/en/
Microscopía electrónica de transmisión (JEOL 2100) equipado con detector EDX (ULTIMAX, Oxford) Microscopio de fuerza atómica (Multimode 8 Bruker y controlador Nanoscope V) Microscopio óptico con luz polarizada (NIKON EclipseE600POL con placa calefactora Metler Toledo FP82HT) Cromatografia SEC-4T (Viscotek, OmniSEC, Malvern) y SLS/ DLS (Zetasizer Nano, Malvern) Calorimetría diferencial de barrido a baja temperatura (DSC8500 Perkin Elmer) Espectroscopia ATR-FTIR (Spectrum One, Perkin Elmer) Medidas de angulo de contacto superficial (Biolin Theta Flex) Espectroscopia dieléctrica (Novocontrol) Análisis reológico en los modos de torsión y extensión (DHR20, TA Instruments) y capilar (Smart Rheo, CEAST) Microrreologia DLS (Zetasizer Nano, Malvern) Microfluidica de cizalla y extensión (m-VROC II, RheoSense) Dispersión de rayos X a bajo ángulo - SAXS (Nanostar C) Asesoramiento en modelos atomísticos, de grano grueso y en la mesoescala en química, biología y materiales.
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
Advice for preparing atomistic, coarse-grained and mesoscale models in chemistry, biology and material sciences: Selection of the software to carry out the simulations. Advice on the use of molecular simulation software Materials Studio and Discovery Studio available at the CSIC. Preparation and advice on the methods to be used depending on the problem to be solved. Execution of short simulations in a group's own cluster with CPUs and GPUs. Recommendations for using the CSIC cluster and the CESGA Finesterrae III supercomputer. Preparation of scripts to execute jobs on both computers. Analysis of results from simulations based on quantum calculations and molecular dynamics.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| CONSULTORÍA CIENTÍFICA EN MODELIZACIÓN, COMPUTACIÓN Y SIMULA | Hora o fracción | 135.47 € | 148.38 € |
| Cálculos Ab-initio | Hora o fracción | 135.47 € | 148.38 € |
| Simulación Espectroscópica | Hora o fracción | 135.47 € | 148.38 € |
| Cálculos de Mecánica Molecular y Dinámica Molecular | Hora o fracción | 135.47 € | 148.38 € |
Other services
- Análisis reológico
- Caracterización estructura: Microscopía optica
- Caracterización de tamaño de partículas: Dynamic light scattering (DLS)
- Microscopía de barrido: AFM contacto
- Calorimetría diferencial de barrido de baja temperatura
- Caracterización dieléctrica
- Cromatografía de exclusión por tamaños, SEC
- Determinación de la viscosidad
- Liofilización
- Determinación de ángulo de contacto en superficie
- Uso de cámara / cabina / campana de atmósferas controladas o modificadas
Service general data
- Support unit: Data Analytics @IFISC
- Institute: INSTITUTO DE FISICA INTERDISCIPLINAR Y SISTEMAS COMPLEJOS
- Locality: Palma de Mallorca (Balears)
- Service's web: http://ifisc.uib-csic.es
En base a experiencia ganada en proyectos de investigación y contratos con empresas, el IFISC crea una unidad de servicios dedicada a la minería y al análisis de Big Data dando servicio a IFISC, CSIC y entidades externas. Esto comprende: colección y análisis de datos de Twitter, telefonía móvil, tarjetas de crédito, Flighradar24, redes de transporte urbano, censo, resultados electorales geolocalizados, electrocardiogramas, electro y magneto-encefalogramas, poblaciones de animales y corrientes marinas. Actualmente se recogen y analizan más de 40 GB/día de datos de sistemas socio-técnicos, biomédicos y medioambientales. Se han realizado estudios de población, de movilidad, transporte y turismo, uso del suelo, desigualdad económica en ciudades, propagación de retrasos en tráfico aéreo y epidemias en base a datos geolocalizados, análisis de arritmias cardiacas, encefalogramas, migraciones y conectividad espacial de fauna marina con datos satelitales.
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
Data analysis and modeling in the life and environmental sciences. This encompasses the development of methods for large-scale data collection, efficient storage, data and time-series analysis, and modeling. Activities may involve sampling variations (for locally held data), data analysis, the development of new analytical methods, and scientific consulting. While we are open to other applications, our experience includes working with ecological data, spatial data regarding crop diseases (Xylella fastidiosa), species abundance, and the spatial coverage of species such as *Posidonia* along the Mediterranean coast, as well as data related to biomedicine and neuroscience.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Muestreo | Hora o fracción | 56.31 € | 61.67 € |
| Análisis | Hora o fracción | 63.85 € | 69.93 € |
| Consultoría científica | Hora o fracción | 74.91 € | 82.04 € |
Service general data
- Support unit: Data Lab
- Institute: INSTITUTO MEDITERRANEO DE ESTUDIOS AVANZADOS
- Locality: Esporles (Balears)
- Service's web: http://www.imedea.uib-csic.es
Data Lab ofrece asesoramiento y herramientas para proyectos de investigación que manejen grandes bases de datos, estadísticas avanzadas, y/o aprendizaje automático. Sus técnicos están especializados en ciencia de datos e inteligencia artificial aplicada al análisis de imágenes. El uso de IA en datos ambientales, como sensores, secuenciación genética, imágenes o vídeos, está en crecimiento. Estas técnicas permiten detectar objetos, derivar parámetros de interés y realizar clasificaciones y segmentaciones. Sus tareas incluyen asesoramiento en IA, análisis de imágenes, entrenamiento de redes neuronales y organización de bases de datos.
Scientific advice in modelling, computing and simulation
Benefit description
Scientific consultancy and computational support for the development, implementation and execution of numerical models, simulations and high-performance scientific computing. Includes the design of computational workflows, the optimisation and parallelisation of scientific code, and the execution of simulations requiring intensive computing capacity. The service is supported by high-performance cluster infrastructure (CPU and GPU) available around the clock.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Consultoría científica en modelización, computación y simula | Hora o fracción | 1960.51 € | 2147.22 € |