- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Proteómica
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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CIB - Madrid |
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SERVICIO DE ANÁLISIS DE PROTEÍNAS IBVF - Sevilla |
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IIBB - Barcelona |
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Plataforma de Inmunopeptidómica (IPP) IIBB - Barcelona |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: PROTEÓMICA Y GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS MARGARITA SALAS
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cib.csic.es/es/servicio.php?iddepartamento=29
El servicio Proteómica y Genómica cuenta con el siguiente equipamiento: • Espectrómetro de masas MALDI‑TOF/TOF Autoflex III (Bruker). • Espectrómetro de masas Q-Exactive conectado en línea a un nano-UHPLC Vanquish Neo a través de la fuente de iones NanoSpray Flex NG (Thermo Fisher Scientific). • Espectrómetro de masas de alta resolución Orbitrap Exploris 240 conectado en línea a un nano-UHPLC Vanquish Neo a través de la fuente de iones NanoSpray Flex NG (Thermo Fisher Scientific). • TapeStation 4150 (Agilent). • Termocicladores rt‑PCR iQ5 (Bio‑Rad) y LightCycler 96 (Roche). El servicio está certificado conforme a la norma UNE-EN ISO9001:2015 en "La determinación de la masa molecular por espectrometría de masas". IQNetES-0286-2009_2023-12-26.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Descripción de la prestación
Espectrómetro de masas Q-Exactive dotado de una fuente de ionización nano conectada en línea a un nano-UHPLC Easy-LC 1000. Tambíen disponemos de un nano-UHPLC Neo Vanquish acoplado al espectrómetro de masas Orbitrap Exploris 240 a través de la fuente de iones NanoSpray Flex NG (Thermo Scientific). Estos equipos son adecuados para la mayoría de los análisis proteómicos. Aplicaciones: Identificación y cuantificación de proteínas en proteomas complejos, en muestras de baja y media complejidad. identificación de sitios de fosforilación u otras modificaciones, así como para la realización de experimentos de proteómica cuantitativa diferencial (SILAC, iTRAQ, Label-free). experimentos SIM (single ion monitoring) y PRM (parallel reaction monitoring), propios de proteómica dirigida (targeted proteomics).| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| LC MS-MS grad 30-60min-QExactive | 295.42 € | 323.56 € | |
| LC MS-MS grad 60-150 min-Qexactive | 343.59 € | 376.31 € | |
| Proteómica cuantitativa libre de marcaje | 539.41 € | 590.79 € | |
| Digestión en columna S-Trap | 34.99 € | 38.33 € | |
| LC MS-MS grad 150-240 min-QExactive | 401.39 € | 439.62 € | |
| LC MS-MS grad 60-150 min-Orbitrap Exploris | 384.87 € | 421.53 € | |
| LC MS-MS grad 30-60 min-Orbitrap Exploris 240 | 291.12 € | 318.84 € | |
| LC MS-MS grad 150-240 min-Orbitrap Exploris | 476.68 € | 522.07 € | |
| Suministro de vial de tripsina Lys C | 56.36 € | 61.73 € | |
| Análisis de datos | 70.02 € | 76.68 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: SERVICIO DE ANÁLISIS DE PROTEÍNAS
- Instituto: INSTITUTO DE BIOQUIMICA VEGETAL Y FOTOSINTESIS
- Localidad: Sevilla (Sevilla)
- Web del servicio: http://www.ibvf.csic.es/descripcion-analisis-proteinas
El objetivo principal del Servicio de Análisis de Proteínas del IBVF es la identificación de proteínas de interés biológico, mediante espectrometría de masas. Para ello, cuenta con diferentes equipos para la preparación y el análisis de las muestras: -Sistema para el recorte automatizado de proteínas en gel de una o dos dimensiones, Modelo EXQuest Biorad. -Espectrómetro de masas híbrido, Triple cuadrupolo-TOF acoplado a nanoLC, Modelo 5600, Sciex, que permite análisis LC-MS/MS.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Descripción de la prestación
Digestión triptica y separación de mezclas compejas de proteínas (más de 50 proteínas) mediante cromatografía líquida e identificación mediante espectrometría de masas triple cuadrupolo y tiempo de vuelo.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Protein identification by LC MSMS (more than 50 proteins) | 365.50 € | 400.31 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Instituto: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Descripción de la prestación
La cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas en tándem, o LC-MS/MS, es una técnica altamente eficaz para la caracterización detallada de la secuencia de una proteína y para el análisis global de las proteínas presentes en un extracto proteico o en un proteoma completo. El proceso comienza con la digestión de la muestra mediante tripsina. Los péptidos resultantes se introducen en un sistema de cromatografía capilar conectado en línea al espectrómetro de masas mediante una interfaz de microelectrospray o nanospray. A continuación, los péptidos se separan por cromatografía de fase reversa utilizando un gradiente de acetonitrilo. Tras la separación, se eluyen y se ionizan directamente en el espectrómetro de masas. El equipo realiza ciclos de adquisición que incluyen un barrido completo, en el que se determina la relación masa/carga de los péptidos que eluyen en cada momento, seguido de entre 10 y 30 análisis MS/MS sobre los iones más abundantes detectados. Estos espectros de fragmentación permiten identificar los péptidos presentes en la muestra y, a partir de ellos, las proteínas de origen. La identificación se lleva a cabo mediante la comparación de los datos de MS/MS con bases de datos de secuencias utilizando diferentes motores de búsqueda. Análisis de novo: Cuando los datos no pueden compararse adecuadamente con una base de datos de referencia —por ejemplo, en especies parcialmente anotadas o en presencia de modificaciones inesperadas—, es posible realizar una secuenciación de novo mediante el software PEAKS.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 30 min. High Res-MS. / | 265.15 € | 290.40 € | |
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 90 min. High Res-MS. / | 385.27 € | 421.97 € | |
| Identificación de proteínas LC-MSMS. 60 min.High Res-MS | 318.33 € | 348.65 € | |
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 180 min. High Res-MS. | 462.61 € | 506.67 € | |
| Identificación de proteínas LC-MS/MS. 15 min. High Res-MS. | 198.16 € | 217.03 € |
Otras prestaciones de servicio
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría
- Digestión FASP
- Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Plataforma de Inmunopeptidómica (IPP)
- Instituto: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.iibb.csic.es
La Plataforma de Inmunopeptidómica (IPP) ofrece apoyo científico-técnico para la identificación y caracterización de péptidos presentados por moléculas HLA/MHC mediante inmunoafinidad y espectrometría de masas. El servicio incluye asesoramiento en el diseño experimental, evaluación de viabilidad de muestras, procesamiento de células, tejidos o fluidos compatibles, inmunoprecipitación de complejos HLA de clase I y/o clase II, preparación de péptidos, análisis por LC-MS/MS y apoyo bioinformático para la interpretación de resultados. La plataforma está orientada al estudio de repertorios inmunopeptídicos en contextos de autoinmunidad, inflamación, infección, cáncer, trasplante, respuesta inmune y descubrimiento de antígenos.
Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
Descripción de la prestación
La cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas en tándem, o LC-MS/MS, es una técnica altamente eficaz para la caracterización detallada de los péptidos de HLA aislados por inmunoafinidad. El extracto peptídico purificado se inyectan en un sistema de cromatografía capilar conectado en línea al espectrómetro de masas mediante una interfaz de microelectrospray o nanospray. A continuación, los péptidos se separan por cromatografía de fase reversa utilizando un gradiente de acetonitrilo. Tras la separación, se eluyen y se ionizan directamente en el espectrómetro de masas. El equipo realiza ciclos de adquisición que incluyen un barrido completo, en el que se determina la relación masa/carga de los péptidos que eluyen en cada momento, seguido de entre 10 y 30 análisis MS/MS sobre los iones más abundantes detectados. Estos espectros de fragmentación permiten identificar los péptidos presentes en la muestra y, a partir de ellos, las proteínas de origen.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Identificación de péptidos HLA por HR-LC-MS/MS. 30 min grad. | 265.15 € | 290.40 € | |
| Identificación de péptidos HLA por HR-LC-MS/MS. 60 min grad. | 318.33 € | 348.65 € |