- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Proteómica
Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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IIBB - Barcelona |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Instituto: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana. El laboratorio ocupa un espacio de 90 m2 en el que se disponen 4 espectrómetros de masas (4800 MALDI-TOF/TOF, Quantum Triple Quadrupole , LTQ Velos Linear ion trap y Orbitrap XL), diversos sistemas acoplados para cromatografía líquida convencional y nanocapilar (2xAgilet 1200, 2X Agilent 1100) y un sistema de IEF preparativo (IEF off-gel). Dispone asimismo de un robot para digestión automática (DigestPro MS, Intavis) y de los sistemas necesarios para la realización de geles 2D de tamaño pequeño y grande (2 x IPGphor y 2 x Ettan Dalt VI (GE), Protean y MiniProtean (BioRad)) así como para la adquisición y análisis de las imágenes (Scanner y SameSpots software). Dispone asimismo de aparataje propio necesario para el trabajo diario (centrífugas, arcones, etc).
Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo
Descripción de la prestación
La secuenciación de proteínas de novo es el proceso mediante el cual se deriva la secuencia de aminoácidos de un péptido sin conocimiento previo de la secuencia de ADN o proteína. Esto difiere de la identificación de la base de datos de secuencias, donde ya se conoce la secuencia de proteína / ADN. La secuenciación de proteínas de vovo se realiza mediante MS / MS (consulte la identificación de proteínas) y los espectros MS / MS se interpretan utilizando el programa PEAKS.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Gradiente 30 min. High resolution MS. | € / muestra | 271.33 € | 370 € |
| Gradiente 60 min. High resolution MS. | €/ muestra | 318.63 € | 434.49 € |
| Gradiente 90 min. High resolution MS. | € / muestra | 365.63 € | 498.59 € |
| Gradiente 180 min. High resolution MS. | € / muestra | 443.58 € | 604.88 € |
Otras prestaciones de servicio
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Coomassie Gel Staining
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Protein Separation by HPLC
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Tinción de gel con Plata
- Digestión FASP
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría