- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Proteómica
Digestión FASP
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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IIBB - Barcelona |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: SERVICIO DE PROTEÓMICA IIBB
- Instituto: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS DE BARCELONA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://proteomica.uab.cat
Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana. El laboratorio ocupa un espacio de 90 m2 en el que se disponen 4 espectrómetros de masas (4800 MALDI-TOF/TOF, Quantum Triple Quadrupole , LTQ Velos Linear ion trap y Orbitrap XL), diversos sistemas acoplados para cromatografía líquida convencional y nanocapilar (2xAgilet 1200, 2X Agilent 1100) y un sistema de IEF preparativo (IEF off-gel). Dispone asimismo de un robot para digestión automática (DigestPro MS, Intavis) y de los sistemas necesarios para la realización de geles 2D de tamaño pequeño y grande (2 x IPGphor y 2 x Ettan Dalt VI (GE), Protean y MiniProtean (BioRad)) así como para la adquisición y análisis de las imágenes (Scanner y SameSpots software). Dispone asimismo de aparataje propio necesario para el trabajo diario (centrífugas, arcones, etc).
Digestión FASP
Descripción de la prestación
FASP (Filter Aided Sample Preparation. Ver Wisniewski JR et al, 2009). Método para el tratamiento de proteínas en soluciones con alta concentraciones de SDS (p.e. proteínas de membrana) o con otras substancias que interfieren con la digestión tríptica. Entre 25-150 µg de proteína se cargan en un filtro Amicon (10-kDa tamaño de corte). La muestra se lava en el filtro con tampón 8 M Urea seguido de centrifugación. Las proteínas retenidas en el filtro se alquilan y digieren in situ. Los péptidos trípticos se recuperan mediante la adición de 3 x 100 µl de tampón y centrifugación.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Digestión FASP con tripsina | €/muestra | 105.89 € | 144.4 € |
Otras prestaciones de servicio
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Coomassie Gel Staining
- Determinación de modificaciones postraduccionales
- Estudio proteómico cuantitativo comparativo por MRM
- Protein Identification by LC-MS/MS (<5 Proteins)
- Protein Identification by LC-MS/MS (<50 proteins)
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Protein Separation by HPLC
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Tinción de gel con Plata
- Identificación de proteínas mediante secuenciación de novo
- Análisis de datos, diseño de experimentos, formación y asesoría