Captura genómica y secuenciación de genes de X. fastidiosa en matrices complejas
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
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Servicio de Organismos Fitopatógenos y de Cuarentena IAS - Córdoba |
Service general data
- Support unit: Servicio de Organismos Fitopatógenos y de Cuarentena
- Institute: INSTITUTO DE AGRICULTURA SOSTENIBLE
- Locality: Córdoba (Córdoba)
- Service's web: http://www.ias.csic.es/
El servicio ofrece distintas prestaciones que tienen relación con investigación y desarrollo experimental en temas relacionados con microbioma vegetal en general, y los organismos fitopatógenos en particular incluyendo los de cuarentena. Entre las distintas prestaciones que ofrece el servicio se encuentran: 1) Asesoramiento científico, diseño, establecimiento y monitorización de experimentos en campo y condiciones controladas (invernadero, cámaras, laboratorio). 2) Técnicas de cuantificación y extracción de ácidos nucleicos 3) Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de microorganismos incluyendo fitopatógenos y de cuarentena 4) Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en distintos substratos 5) Diagnóstico específico de agentes fitopatógenos mediante procedimientos clásicos y moleculares 6) Evaluación de productos biológicos/químicos en el control de enfermedades o promoción del crecimiento y caracterización de la resistencia de plantas
Captura genómica y secuenciación de genes de X. fastidiosa en matrices complejas
Benefit description
Enriquecimiento selectivo de fragmentos del genoma de Xylella fastidiosa presentes en muestras donde su ADN está muy diluido o mezclado con grandes cantidades de ADN vegetal, microbiano o ambiental. El proceso combina hibridación dirigida y secuenciación de nueva generación (NGS) para obtener información genética de alta resolución incluso cuando la bacteria está en baja concentración o la muestra contiene inhibidores.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
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| Captura genómica con extracción de ADN | 466.20 € | 510.60 € | |
| Captura genómica sin extracción de ADN | 438.15 € | 479.87 € |
Other services
- Alquiler de módulos y realización de ensayos en invernaderos y fitotrón
- Biología Molecular: Cuantificación de extractos de ácidos nucleicos
- Cultivos de bacterias
- Organización de visitas y eventos (meetings, workshops, congresos y actividades formativas)
- Sequencing by synthesis (Illumina)
- Diagnóstico específico de hongos, oomicetos y bacterias patógenos de plantas
- Evaluación de eficacia de productos biológicos o químicos en la promoción del crecimiento plantas
- Evaluación de eficacia de productos biológicos o químicos en el control de patógenos de plantas
- Desarrollo y validación de procedimientos de diagnóstico moleculares especie-escecíficos de agentes fitopatógenos
- Asesoramiento científico
- Difusión de actividades
- Diagnóstico molecular especie-específicos de agentes fitopatógenos
- Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en suelo y cultivos
- Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de organismos fitopatógenos de cuarentena
- Aislamiento masivo de microorganismos (culturómica)
- Diseño, establecimiento y monitorización de experimentos
- Sensores próximos para la estimación de rasgos de vegetación
- Medida de actividad biológica del suelo mediante respirometría con Oxitop
- Análisis de diversidad funcional y potencial metabólico de comunidades microbianas con Ecoplate
- Ensayos en invernaderos, cámaras de cultivo visitables y fitotrón