- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subgroup
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- Proteómica
Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
Service general data
- Support unit: PROTEÓMICA Y GENÓMICA
- Institute: CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS MARGARITA SALAS
- Locality: Madrid (Madrid)
- Service's web: http://www.cib.csic.es/es/servicio.php?iddepartamento=29
PROTEÓMICA El equipamiento actual del Servicio es el siguiente: 2 unidades de isoelectroenfoque Protean IEF cell (BIO-RAD), para la primera dimensión de los geles 2D en tiras de 7 cm de diferentes rangos de pH: 3-10 no lineal, 3-10-lineal y 4-7 lineal. 1 Cubeta multigel Miniprotean Dodecacell (BIO_RAD), para la electroforesis simultánea de hasta 12 geles de 8 x 7 cm. Espectrómetro de masas MALDI-TOF-TOF Autoflex III (Bruker).. Espectrómetro de masas Q-Exactive (Thermo Scientific) dotado de una fuente de ionización nano conectada en línea a un nano-UPLC Easy-LC 1000.
Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
Benefit description
MALDI-TOF/TOF MS for protein identification of gel separated proteins. This approximation is based on the determination of accurate masses of peptides formed by enzymatic digestion (peptide mass fingerprinting). Additionally, the system can more definitively identify and characterize proteins by tandem time-of-flight (TOF/TOF) technology isolating and fragmenting a molecular ion of interest and measuring the fragment ion masses.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Identificación de proteínas por MALDI-TOF/TOF | € / muestra | 122.14 € | 133.77 € |
Other services
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
- Identificación y Caracterización - PCR a tiempo real
- Análisis de compuestos por Espectrometría de Masas: MALDI-TOF
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Cromatografía de afinidad: Enriquecimiento en fosfopétidos para proteómica
Service general data
- Support unit: PROTEÓMICA
- Institute: INSTITUTO DE QUIMICA AVANZADA DE CATALUÑA
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://www.iqac.csic.es
El objetivo principal del servicio es dar apoyo científico y tecnológico en el área de la proteómica a los investigadores del IQAC y IDAEA así como de otros ámbitos, tanto públicos como privados. Entre nuestras principales actividades se encuentra la separación, cuantificación, identificación y caracterización de péptidos y proteínas en sistemas de interés biológico y biomédico mediante técnicas de electroforesis bidimensional y espectrometría de masas. Otras actividades que realizamos mediante espectrometría de masas es la determinación de la masa molecular de diferentes especies moleculares tanto de origen sintético como ambiental facilitando así su elucidación estructural. El servicio dispone de la técnica MALDI MSImaging que permite detectar la distribución de moléculas de diferentes masa en un corte de tejido u otro tipo de material sin necesidad de marcaje. El laboratorio dispone de un sistema completo de separación de proteínas mediante electroforesis bidimensional.
Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
Benefit description
Protein identification could be performed by peptide fingerprint (MS data) combined or not with the (s) sequence (s) peptide (MS / MS data). When fragmentation spectra (MS / MS) are required, the three majority masses will be selected for each peptide fingerprints. Protein identification will be performed by combining both types of spectra (MS-MS / MS) obtained for each sample using MASCOT search engine (MatrixScience, UK) on public databases of protein sequences. The fragmentation of peptides can be easily done through technical LIFT (metastable decomposition) or by "Collision-Induced Dissociation" (high energy fragmentation).| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| PMF MS-MS/MS by MALDI TOF/TOF 1 a 8 muestras | € por muestra | 56.64 € | 62.03 € |
| PMF MS-MS/MS by MALDI TOF/TOF 9 a 40 muestras | € / muestra | 34.3 € | 37.57 € |