- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Proteómica
Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: PROTEÓMICA Y GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS MARGARITA SALAS
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cib.csic.es/es/servicio.php?iddepartamento=29
PROTEÓMICA El equipamiento actual del Servicio es el siguiente: 2 unidades de isoelectroenfoque Protean IEF cell (BIO-RAD), para la primera dimensión de los geles 2D en tiras de 7 cm de diferentes rangos de pH: 3-10 no lineal, 3-10-lineal y 4-7 lineal. 1 Cubeta multigel Miniprotean Dodecacell (BIO_RAD), para la electroforesis simultánea de hasta 12 geles de 8 x 7 cm. Espectrómetro de masas MALDI-TOF-TOF Autoflex III (Bruker).. Espectrómetro de masas Q-Exactive (Thermo Scientific) dotado de una fuente de ionización nano conectada en línea a un nano-UPLC Easy-LC 1000.
Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
Descripción de la prestación
Identificación por espectrometría de masas MALDI-TOF/TOF de proteínas separadas en geles. Esta aproximación se basa en la determinación precisa de las masas de los péptidos obtenidos por digestión enzimática (huella peptídica). Adicionalmente, se puede identificar y caracterizar proteínas mediante la tecnología de ¿tiempo de vuelo¿ en tándem (TOF/TOF) aislando y fragmentando iones peptídicos de interés y determinando las masas de sus correspondientes fragmentos.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Identificación de proteínas por MALDI-TOF/TOF | € / muestra | 122.14 € | 133.77 € |
Otras prestaciones de servicio
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
- Identificación y Caracterización - PCR a tiempo real
- Análisis de compuestos por Espectrometría de Masas: MALDI-TOF
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Cromatografía de afinidad: Enriquecimiento en fosfopétidos para proteómica
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: PROTEÓMICA
- Instituto: INSTITUTO DE QUIMICA AVANZADA DE CATALUÑA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.iqac.csic.es
El objetivo principal del servicio es dar apoyo científico y tecnológico en el área de la proteómica a los investigadores del IQAC y IDAEA así como de otros ámbitos, tanto públicos como privados. Entre nuestras principales actividades se encuentra la separación, cuantificación, identificación y caracterización de péptidos y proteínas en sistemas de interés biológico y biomédico mediante técnicas de electroforesis bidimensional y espectrometría de masas. Otras actividades que realizamos mediante espectrometría de masas es la determinación de la masa molecular de diferentes especies moleculares tanto de origen sintético como ambiental facilitando así su elucidación estructural. El servicio dispone de la técnica MALDI MSImaging que permite detectar la distribución de moléculas de diferentes masa en un corte de tejido u otro tipo de material sin necesidad de marcaje. El laboratorio dispone de un sistema completo de separación de proteínas mediante electroforesis bidimensional.
Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
Descripción de la prestación
A partir del digerido tríptico se puede realizar también la identificación de la proteína mediante huella peptídica (datos MS), combinada o no con la(s) secuencia(s) de péptidos (datos MS/MS). Cuando se requieran espectros de fragmentación (MS/MS), se seleccionarán las 3 masas mayoritarias dentro de cada una de las huellas peptídicas. La identificación de proteínas se realizará combinando ambos tipos de espectros (MS-MS/MS) obtenidos para cada muestra y usando como motor de búsqueda MASCOT (MatrixScience, UK) sobre bases de datos públicas de secuencias de proteína. La fragmentación de los péptidos puede hacerse fácilmente mediante la técnica LIFT (descomposición metaestable) o bien mediante "Collision-Induced Dissociation" (fragmentación de alta energía).| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| PMF MS-MS/MS by MALDI TOF/TOF 1 a 8 muestras | € por muestra | 56.64 € | 62.03 € |
| PMF MS-MS/MS by MALDI TOF/TOF 9 a 40 muestras | € / muestra | 34.3 € | 37.57 € |