Sanger Sequencing

El servicio del Laboratorio de Genética del IREC (LGI) lleva a cabo investigación, docencia y formación en ecología, evolución, conservación y gestión de especies animales empleando técnicas moleculares. El servicio ofrece instalaciones, equipamiento, recursos analíticos y asesoramiento científico y técnico. Las técnicas sobre las que se ofrece servicio incluyen: Extracción de ADN y ARN Purificación de ADN y ARN Cuantificación de ADN y ARN Visualización de ADN Amplificación por PCR Lecture y alineamiento de secuencias Análisis de genética de poblaciones Análisis de filogenética y filogenómica Análisis de ADN ambiental (eDNA) Identificación molecular de especies Identificación de individuos Determinación del sexo Determinación de relaciones de parentesco Barcoding Metabarcoding Metagenómica Transcriptómica Elaboración de informes o peritajes Asesoramiento técnicas de análisis

El Servicio de Genómica fue creado en el año 1994 para apoyar con técnicas genómicas la tarea investigadora del personal del IIBm. Además, nuestro laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico. El Servicio dispone de un sistema de gestión de calidad conforme con la Norma UNE-EN ISO 9001:2000. El Servicio pertenece a la red de laboratorios de la CAM. Nº de registro:281.

El Servicio de Análisis de ADN del IBV dispone del equipamiento necesario para llevar a cabo análisis de secuenciación mediante la técnica Sanger (ABI3130XL, Applied Biosystems), mediante pirosecuenciación (GS Junior, Roche) y secuenciación por ligación (SOLiD4, Applied Biosystems). Además tiene implementada la técnica para medir la metilación en islas CpG o genotipar mediante pirosecuenciación (PyroMark MD, Biotage/Qiagen). Igualmente, dispone de un equipo de dHPLC para el genotipado rápido de un número elevado de muestras. Así pues, las aplicaciones que podemos llevar a cabo son: · Secuenciación de ácidos nucleicos (Sanger, NGS: targeted resequencing, exome sequencing, RNAseq, ChIP-Seq, MethylSeq and Metagenomics) · Genotipado de polimorfismos mediante diversas técnicas. · Análisis de fragmentos. · Estudios de ligamiento genético. · Determinación cuantitativa de niveles de metilación en el ADN. · Asesoramiento y análisis bioinformático de proyectos.

El servicio ofrece apoyo a la investigación y asesoramiento en el empleo de técnicas moleculares para abordar cuestiones evolutivas, biogeográficas, ecológicas y de conservación y gestión de la biodiversidad. El servicio está preparado para la conservación de muestras de estudio (invasivas y no invasivas), extracción de ADN/ARN, puesta a punto y optimización de marcadores, amplificación por PCR, realización de electroforesis y análisis de geles, y preparación de muestras para su posterior secuenciación/genotipado. Igualmente, se ofrece servicio de análisis bioinformáticos a partir de los resultados obtenidos, así como asesoramiento y colaboración a la hora de interpretar los resultados. El servicio está concebido para colaborar activamente en el desarrollo de distintos estudios relacionados con la ecología molecular. Se ofrece, además, la posibilidad de realizar muestreos de campo para la toma de muestras biológicas y su posterior análisis en el laboratorio.