Aislamiento, caracterización, análisis y depósito de fagos

Descripción de la prestación

Depósito de bacteriófagos. ofrece dos tipos de depósito 1.Depósito de bacteriófagos/cepas huésped + información sobre los mismos disponible en la web. 2.Depósito oculto para los usuarios, solo conservación de muestras de fagos/cepas huésped. Incluye test de viabilidad anual y titulación. 2. Suministro de bacteriófagos. tienen como destino: investigación (entidades públicas y privadas), uso compasivo en hospitales (previa aprobación por parte de las autoridades competentes), y comercialización a través de empresas (tras los acuerdos pertinentes). 3. Suministro de cepas huésped. tienen como finalidad la propagación de bacteriófagos a los que son sensibles. 4. Aislamiento de 1 bacteriófago frente a una especie o cepa bacteriana. Se realizará a partir de una muestra proporcionada o no por el usuario, y se aislará como mínimo un fago frente a una cepa o especie bacteriana concreta, enviada por el usuario o de la propia colección. 5. Aislamiento de 5 bacteriófagos frente a una especie o cepa bacteriana. Se realizará a partir de una muestra proporcionada o no por el usuario, y se aislarán como mínimo 5 fagos frente a una cepa o especie bacteriana concreta, enviada por el usuario o de la propia colección. 6. Propagación de bacteriófagos en medio sólido. Requisito imprescindible que tanto el fago como la bacteria huésped estén identificados y se envíen en cultivos puros. La concentración final de la suspensión obtenida puede ser variable según el tipo de fago y su eficiencia de propagación sobre la cepa huésped. 7. Propagación de bacteriófagos en medio líquido. Requisito imprescindible que tanto el fago como la bacteria huésped estén identificados y se envíen en cultivos puros. El servicio permite el escalado en la propagación en volúmenes de hasta 2 litros. La concentración final de la suspensión obtenida puede ser variable según el tipo de fago y su eficiencia de propagación sobre la cepa huésped. 8. Titulación de suspensiones fágicas. Recuento del número de partículas fágicas viables por volumen de la suspensión en la cepa huésped o en otras cepas sensibles al mismo. 9. Concentración de suspensiones fágicas. A partir de una suspensión de fagos se procederá a aumentar el número de partículas por unidad de volumen, habitualmente mediante precipitación con PEG. 10. Purificación por gradiente de cloruro de cesio. A partir de una suspensión de fagos se procederá a aumentar el número de partículas por unidad de volumen, y a la vez purificarlas de cualquier tipo de restos celulares, utilizando un gradiente de densidad. 11. Inducción de profagos con mitomicina C. A partir de cepas lisogénicas, se liberarán los profagos mediante inducción y se aislarán para su caracterización posterior. 12. Extracción de DNA fágico (1 muestra). Se obtendrá el DNA de una suspensión fágica que esté convenientemente concentrada, con una pureza adecuada para su posterior secuenciación. 13. Extracción de DNA fágico (10 muestras). Se obtendrá el DNA de 10 suspensiones fágicas que estén convenientemente concentradas, con una pureza adecuada para su posterior secuenciación. 14. Secuenciación de DNA fágico. Una vez comprobada la calidad del DNA se enviará a una empresa externa. 15. Ensamblaje y anotación de secuencias. Se unirán los fragmentos secuenciados para reconstruir el genoma completo. Posteriormente se realiza la anotación identificando genes, promotores y elementos reguladores. 16. Análisis básico de secuencias genómicas de fagos. Análisis comparativo con las secuencias de otros fagos para ver relaciones evolutivas y filogenéticas. 17. Envío de secuencias a bases de datos. Depósito de secuencias genómicas en repositorios público o privados para su almacenamiento, acceso y análisis. Estas bases de datos permiten compartir información genética con la comunidad científica. 18. Fagogramas. Se determinará el patrón de resistencia/sensibilidad de cepas bacterianas frente a uno o más bacteriófagos. El servicio ofrece la posibilidad