- Grupo
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- TIC, Análisis Computacional y Matemático y Cartográfico
Administración de sistemas de computación científica
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
|---|---|---|---|
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LABORATORIO DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL CEAB - Blanes |
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ICM - Barcelona |
Service general data
- Support unit: LABORATORIO DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL
- Institute: CENTRO DE ESTUDIOS AVANZADOS DE BLANES
- Locality: Blanes (Girona)
- Service's web: http://www.ceab.csic.es/
Actualmente la instalción del CBLab ocupa una sala climatizada que alberga un "cluster computer" con 284 cores de ejecución, 2,5 Terabytes de memoria RAM y 44 Terabytes de capacidad de almacenamiento en disco duro. El sistema operatio es el Biolinux8 (soportado en Ubuntu 12.04 LTS Server) Linux x64, y un administrador de la cola de espera del sistema "Sun Oracle GridEngine". El cluster puede albergar entre 70-100 usuarios registrados, las principales funcionalidades del cluster son el "code storage" (gitlab), análisis bioinformáticos, generación de modelos ecológicos y servicio de mapeado online de 5-10Gb Ethernet. Los lenguages que admite son R, Matlab, C/C++, Java, Python, SQL y PHP. Dos téccnicos están al cargo de todo el servicio informático, añadir/eliminar software, control y ayuda de los usuarios para paralelizar adecuadmente y/o optimizar los procesos y rutinas de computación. El cluster provee también servicio a científicos externos del CEAB mediante el pago de cuotas.
Administración de sistemas de computación científica
Benefit description
Utilización de clusters (hasta 500 cores) para computación, generación de modelos teóricos, diseño y apoyo al tratamiento de datos y generación de modelos aplicados.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| General | € / h | 16.22 € | 19.31 € |
Service general data
- Support unit: BIOINFORMÁTICA MARINA
- Institute: INSTITUTO DE CIENCIAS DEL MAR
- Locality: Barcelona (Barcelona)
- Service's web: http://www.icm.csic.es/
El Servicio de Bioinformática Marina (SBM) ofrece soluciones integradas para la gestión, almacenamiento y análisis de datos de secuenciación masiva de ADN de microorganismos marinos, aunque por su infraestructura y funcionamiento, puede también abrirse a otros organismos marinos (peces, cnidarios, etc). El núcleo del servicio es un cluster de computación IBM IDataPlex con 288 unidades de proceso y 1000 GB de RAM en 12 nodos de computación, escalable a 40 nodos, así como un servidor DELL PowerEdge T710 con 16 CPU y 16 GB de RAM y un servidor de backup Supermicro 6047R-E1R36N con 48 TB de almacenamiento. El SBM puede desde realizar análisis completos de datos de secuenciación, a la formación en biología computacional de sus usuarios, pasando por la gestión y desarrollo de software a medida.
Administración de sistemas de computación científica
Benefit description
Gestión integral del cluster informático del servicio, incluyendo gestión de usuarios (altas, bajas) y grupos. Gestión de permisos, establecimiento de cuotas de almacenamiento, cálculo y memoria. Gestión de los volumenes de almacenamiento. Configuración y gestión del sistema de colas (SLURM). Auditoría (y en su caso facturación) de horas de procesador, memoria y almacenamiento. Monitorización del estado y la carga del sistema a través de Ganglia y Nagios. Instalación y mantenimiento del sistema operativo, software de terceras partes y librerías. Administración de sistemas (Rdiff-backup, rsync y bacula) para el respaldo de los datos de uso común (bases de datos, secuencias, etc) así como de los datos originales privados y los ficheros de resultados generados por los usuarios.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Administración de sistemas de computación científica | € / h | 143.57 € | 229.7 € |