PIF2025 - Análisis transcriptómico de la evolución del desarrollo cerebral - (PID2024-162580NB-I00)

Las formas complejas de la vida requieren de diversidad celular. Cómo surgieron nuevos tipos celulares durante la evolución, y como se diversificaron, permanece completamente desconocido. El cerebro es el máximo exponente de la diversidad celular y uno de los productos más complejos de la evolución. Su complejidad celular aumentó desde reptiles y pájaros a mamíferos, lo que se atribuye al aumento en la diversidad de células progenitoras y la sofisticación de sus linajes celulares. El proyecto que aquí se oferta busca identificar mecanismos moleculares necesarios para generar diversidad celular, centrado en la corteza cerebral como modelo. Mediante el plan de trabajo previsto, se identificarán las características genéticas que definen la diversidad de células progenitoras neurales (Células de Glia Radial) en la corteza embrionaria de diversas especies de amniotas (serpiente, pollo, ratón, hurón, humano), y se descubrirán las novedades genómicas que llevaron a su diversificación durante la evolución desde reptiles a los grandes mamíferos. Para ello, esta Tesis Doctoral se basará en el análisis bioinformático de datos de transcriptómica de tejido, células individuales y espacial (uso de genomas raros, identificación de genes homólogos de alta confianza, integración de datos multiespecie, clustering, trazado e interpretación de trayectorias transcriptómicas), así como análisis de datos Tracker-seq para trazado de linajes celulares in vivo mediante códigos genéticos.