Diversity and composition of soil microbial communities: metabarcoding.
| Support unit | Support unit Information | Selected service | Other services |
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Servicio de Organismos Fitopatógenos y de Cuarentena IAS - Córdoba |
Service general data
- Support unit: Servicio de Organismos Fitopatógenos y de Cuarentena
- Institute: INSTITUTO DE AGRICULTURA SOSTENIBLE
- Locality: Córdoba (Córdoba)
- Service's web: http://www.ias.csic.es/
El servicio ofrece distintas prestaciones que tienen relación con investigación y desarrollo experimental en temas relacionados con microbioma vegetal en general, y los organismos fitopatógenos en particular incluyendo los de cuarentena. Entre las distintas prestaciones que ofrece el servicio se encuentran: 1) Asesoramiento científico, diseño, establecimiento y monitorización de experimentos en campo y condiciones controladas (invernadero, cámaras, laboratorio). 2) Técnicas de cuantificación y extracción de ácidos nucleicos 3) Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de microorganismos incluyendo fitopatógenos y de cuarentena 4) Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en distintos substratos 5) Diagnóstico específico de agentes fitopatógenos mediante procedimientos clásicos y moleculares 6) Evaluación de productos biológicos/químicos en el control de enfermedades o promoción del crecimiento y caracterización de la resistencia de plantas
Diversity and composition of soil microbial communities: metabarcoding.
Benefit description
Application of massive sequencing techniques (Illumina MiSeq; paired-end: 2 x 300 bp) with specific primers to study the total population of microorganisms (fungi, bacteria, etc.) in plants and soil samples, feces, water, food. DNA extraction if needed.| Options | Unit | Public Sector | Other customers |
|---|---|---|---|
| Análisis NGS de microorganismos. Incluye extracción ADN | € / muestra | 67.47 € | 73.89 € |
| Análisis NGS de microorganismos. No incluye extracción ADN | muestra | 48.18 € | 52.77 € |
Other services
- Alquiler de módulos y realización de ensayos en invernaderos y fitotrón
- Biología Molecular: Cuantificación de extractos de ácidos nucleicos
- Cultivos de bacterias
- Difusión de actividades
- Organización de visitas y eventos (meetings, workshops, congresos y actividades formativas)
- Diagnóstico específico de hongos, oomicetos y bacterias patógenos de plantas
- Evaluación de eficacia de productos biológicos o químicos en la promoción del crecimiento plantas
- Evaluación de eficacia de productos biológicos o químicos en el control de patógenos de plantas
- Desarrollo y validación de procedimientos de diagnóstico moleculares especie-escecíficos de agentes fitopatógenos
- Diagnóstico molecular especie-específicos de agentes fitopatógenos
- Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en suelo y cultivos
- Caracterización de la resistencia de plantas a agentes fitopatógenos
- Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de organismos fitopatógenos de cuarentena
- Aislamiento masivo de microorganismos (culturómica)
- Sensores próximos para la estimación de rasgos de vegetación
- Asesoramiento científico
- Diseño, establecimiento y monitorización de experimentos