Bioinformatic analysis of DNA-seq experiments: genome assembly and functional annotations

El Servicio de Bioinformática y Bioestadística está organizado en cuatro Áreas principales: - Análisis de datos de secuenciación de nueva generación (NGS). - Análisis de secuencias y predicción de estructura. - Análisis bioestadístico de datos. - Soporte a los usuarios en el acceso a los recursos de computación científica del CSIC.

El servicio ofrece soporte integral en el análisis de datos ómicos, proporcionando pipelines robustos, reproducibles y adaptados a las necesidades de cada proyecto. Metataxonomía 16S : procesado completo de datos de secuenciación 16S, incluyendo control de calidad, eliminación de quimeras, inferencia de ASVs/OTUs, asignación taxonómica y generación de tablas de abundancia. Genomas completos: análisis de genomas bacterianos, fúngicos o virales mediante ensamblado de novo o mapeo, anotación funcional, identificación de genes clave, elementos móviles, resistencia antimicrobiana y comparación genómica. El servicio incluye informes detallados y visualizaciones de estructura genómica y relaciones filogenéticas. Metatranscriptómica: datos de expresión génica en comunidades microbianas complejas, abarcando control de calidad, eliminación de rRNA, ensamblado o mapeo, cuantificación de transcritos y análisis diferencial.