Sequencing by synthesis (Illumina)

La secuenciación masiva (Next Generation Sequencing) permite estudiar los genomas a un nivel de resolución imposible de abordar con las tecnologías de genómica tradicionales. La secuenciación masiva permite: • Secuenciación rápida de genomas completos (reordenamientos y duplicaciones). • Mayor profundidad en el análisis de regiones diana específicas para la detección de variantes poco frecuentes. • Secuenciación de transcriptomas completos y detección de variantes de RNA y sitios de procesamiento alternativo. • Análisis de metilomas completos o de interacciones del DNA con proteínas. • Estudio de la diversidad microbiana en humanos o en el medio ambiente

El servicio ofrece distintas prestaciones que tienen relación con investigación y desarrollo experimental en temas relacionados con microbioma vegetal en general, y los organismos fitopatógenos en particular incluyendo los de cuarentena. Entre las distintas prestaciones que ofrece el servicio se encuentran: 1) Asesoramiento científico, diseño, establecimiento y monitorización de experimentos en campo y condiciones controladas (invernadero, cámaras, laboratorio). 2) Técnicas de cuantificación y extracción de ácidos nucleicos 3) Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de microorganismos incluyendo fitopatógenos y de cuarentena 4) Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en distintos substratos 5) Diagnóstico específico de agentes fitopatógenos mediante procedimientos clásicos y moleculares 6) Evaluación de productos biológicos/químicos en el control de enfermedades o promoción del crecimiento y caracterización de la resistencia de plantas