- Áreas de investigación
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- Ciencia y Tecnología de Alimentos
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Metabolómica
Caracterización del metabolismo microbiano
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
|
CNB - Madrid |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: CNB DNA BIOFOUNDRY
- Instituto: CENTRO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: https://www.cnb.csic.es/investigacion/servicios-cientificos/dna-biofoundry/
La Biofoundry de ADN del CNB (CNBIO) ofrece un servicio integral para el diseño, construcción, validación y evolución de rutas metabólicas y circuitos genéticos sintéticos. Los clientes pueden plantear un reto biológico, y el equipo del nodo se encarga de analizar el problema y elaborar un dossier con posibles acciones de I+D+i (Investigación, Desarrollo e Innovación). CNBIO opera siguiendo los principios del ciclo iterativo de optimización DBTL (Design–Build–Test–Learn): • Diseño (Design): CNBIO proporciona modelado metabólico, análisis y diseño in silico de rutas metabólicas, microorganismos y comunidades microbianas optimizados para aplicaciones biotecnológicas, así como análisis a nivel de sistemas de cepas de relevancia clínica. • Construcción (Build): CNBIO ofrece una amplia gama de servicios de clonación y ensamblaje combinatorio automatizado de unidades transcripcionales, permitiendo su expresión tanto en organismos modelo como no modelo. •
Caracterización del metabolismo microbiano
Descripción de la prestación
CNBIO ofrece un servicio de: Consultoría y diseño integral de microorganismos, rutas metabólicas y prototipos mejorados para aplicaciones biotecnológicas. Los clientes pueden plantear un problema biológico y el equipo del nodo se compromete a estudiar el problema y ofrecer un dossier con posibles acciones de I + D + i. Estas soluciones podrán posteriormente implementarse en el servicio mediante un acuerdo específico siguiendo los modelos de contratación del CSIC. DESIGN En Design, CNBIO ofrece: D.1 Asesoramiento técnico-científico para el desarrollo de aplicaciones biotecnológicas. D.2 Modelado metabólico a escala genómica (genome-scale metabolic modelling) de cepas individuales y de comunidades microbianas naturales, sintéticas y de aislados clínicos con análisis comparativo funcional. D.3 Modelado y diseño de comunidades microbianas ambientales, incluyendo su caracterización funcional e identificación de especies clave a partir de datos de secuenciación masiva (16S, 18S, ITS, metagenómica y metatranscriptómica). D.4 Modelado y análisis de microbiomas humanos para la inferencia de interacciones metabólicas y la predicción de sus funcionalidades. D.5 Diseño y optimización de cepas de interés biotecnológico mediante algoritmos computacionales asistidos por IA/ML. BUILD En Build, CNBIO ofrece servicios de ensamblaje modular de ADN mediante MoClo de unidades transcripcionales empleando la tecnología Golden Standard. B.1 Ensamblaje modular de ADN de nivel 1 (Lv1): construcción de unidades transcripcionales individuales. B.2 Ensamblaje modular de ADN de nivel 2 (Lv2): construcción de circuitos genéticos de hasta seis unidades transcripcionales. TEST En Test, CNBIO ofrece la ejecución de protocolos robotizados de biología molecular, experimentos de ingeniería evolutiva automatizada, fabricación aditiva mediante impresión 3D y análisis dirigidos de metabolitos. T.1 Servicio de diseño de flujos de trabajo robotizados en Opentrons (OT-2) Este servicio ofrece el diseño personalizado de flujos de trabajo basados en manipulación automatizada de líquidos mediante plataformas robóticas Opentrons OT-2. T.2 Servicio de evolución adaptativa de laboratorio (ALE) Este servicio ofrece el diseño y ejecución de experimentos de evolución adaptativa en microorganismos modelo y no modelo no patógenos. T.3 Servicio de diseño y fabricación de prototipos CAD 3D Este servicio ofrece el diseño asistido por ordenador (CAD) y la fabricación de prototipos mediante impresión 3D para aplicaciones de laboratorio y bioprocesos. T.4 Análisis dirigido de metabolitos extracelulares mediante HPLC Este servicio ofrece la identificación y cuantificación de metabolitos presentes en sobrenadantes de cultivo, incluyendo azúcares, ácidos orgánicos y compuestos aromáticos, mediante HPLC utilizando estándares de referencia.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Construcción de unidades transcripcionales de nivel 1 (Lv1) | 336.37 € | 368.40 € | |
| Construcción de circuitos genéticos de nivel 2 (Lv2) | 146.24 € | 160.17 € | |
| Asesoramiento científico-técnico | 48.20 € | 52.79 € | |
| Modelado/diseño metabólico de cepas y consorcios microbianos | 64.16 € | 70.27 € | |
| Diseño e implementacion de flujos de trabajo en OT-2 | 58.70 € | 64.29 € | |
| Evolución adaptativa de laboratorio (ALE) | 499.75 € | 547.35 € | |
| Diseño y fabricación de prototipos CAD 3D | 84.72 € | 92.79 € | |
| Análisis de metabolitos extracelulares mediante HPLC | 116.53 € | 127.63 € |
Otras prestaciones de servicio
- No hay prestaciones de servicio asociadas a esta unidad