PIF2025 - Aprendizaje de grafos para clasificación y segmentación en criotomografía electrónica - (PID2024-158469NB-I00)

El proyecto se desarrollará en el Laboratorio de Métodos Numéricos en Criomicroscopía Electrónica de Tomografía (cryoET), dirigido por el Dr. Daniel Castaño Díez en el Instituto Biofisika (CSIC-EHU), en Leioa, cerca de Bilbao. El grupo se dedica al desarrollo de metodologías computacionales para el análisis e interpretación automatizados de imágenes celulares en 3D, principalmente a través de su plataforma de software propia Dynamo (https://dynamo-em.org). El objetivo del proyecto es ampliar Dynamo mediante la integración de nuevas técnicas de aprendizaje profundo (Deep Learning) para la identificación y caracterización de proteínas pequeñas y flexibles en su entorno natural. En concreto, se plantea el uso de modelado por grafos como punto de partida para la localización de estructuras extensas del entorno celular, como membranas o filamentos. La persona contratada contribuirá al desarrollo de estas metodologías, así como al desarrollo y mantenimiento continuado del software. Además, participará en el análisis de conjuntos de datos de cryoET proporcionados por colaboradores externos.