Peptide Synthesis

El servicio de Química de Proteínas tiene como función principal prestar apoyo científico y técnico a todos los laboratorios de investigación que lo soliciten, tanto de carácter público como privado, en la purificación, cuantificación, identificación y caracterización de proteínas así como en el diseño, síntesis y purificación de péptidos y oligonucleótidos. El servicio cuenta con el siguiente equipamiento: - Secuenciador de proteínas (Applied Biosystems, Procise 494) - Sintetizador de péptidos (AAPPtec, Focus XC). - Sintetizador de oligonucleótidos (Apllied Biosystems 3400) - Analizador de aminoácidos (Biochrom 30) - HPLC (ÄKTA, Amersham Pharmacia Biotech) - LC-MS. HPLC (Surveyor Plus) acoplado a un espectrómetro de masas de trampa de iones LXQ (Thermo Scientific)

Creado en 1999, el servicio de Proteómica del CNB mantiene una plataforma tecnológica para la identificación y caracterización masiva de proteínas, ofreciendo sus servicios tanto al CNB como a investigadores externos. El análisis masivo de proteínas (LC-MS/MS) se lleva a cabo mediante cromatografía nano-HPLC multidimensional acoplada a dos espectrómetros de masas modelo Thermo Orbitrap Explorios OE240 a un instrumento MALDI TOF/TOF MS. La proteómica diferencial o cuantitativa se realiza mediante previo marcaje isotópico estable, metabólico (SILAC) o químico (TMT) en combinación con análisis LC-MS/MS. Podemos realizar análisis dirigido PRM-MS (parallel reaction monitoring), y DIA (Data Independent Acquisition) . Enriquecimiento específico de modificaciones postraduccionales, particularmente fosfopéptidos, seguidos de análisis LC-MS/MS. Análisis de gluten en alimentos mediante la caracterización de prolamina.

La investigación Proteómica implica la identificación y la caracterización de todo el perfil proteico de una célula, tejido u organismo, en un contexto espacial y temporal. El estudio incluye isoformas, mutantes, modificaciones e interacciones proteína-proteína/s. La trayectoria del Servicio de Proteómica ha sido paralela a la evolución de la comunidad científica, y sus objetivos son ofrecer soporte científico-técnico al investigador, con métodos apropiados para la preparación de la muestra y diseñando un flujo de trabajo para cada objetivo. Se utilizan todas las técnicas y equipamiento disponibles, se implementan mejoras en los protocolos, y se interpretan y analizan los resultados obtenidos. La cartera de servicios (a grupos del CBM-SO y a externos) es amplia, desde la confirmación de la secuencia de una proteína recombinante, a la cuantificación relativa de proteomas, la caracterización de modificaciones post-traduccionales y de mutaciones, de interactomas o la secuenciación De Novo