- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Proteómica, Genómica y Metabolómica
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- Genómica
- Proteómica
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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CBM - Madrid |
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IPBLN - Armilla |
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IBE - Barcelona |
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Servicio Científico-Técnico de Genotipado IPE - Zaragoza |
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LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS Y BIOINFORMATICA CI2A - Alcalá de Henares |
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CNB - Madrid |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE BIOLOGIA MOLECULAR SEVERO OCHOA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cbm.uam.es/genomica
El Servicio de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Preparación de librerías para NGS (bulk y célula única).| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Librerias 3'mRNA | 94.10 € | 103.06 € | |
| Single Cell Chip 10X | 570.58 € | 624.92 € | |
| Single Cell Combinatorial bacording procesado de muestras | 1256.53 € | 1376.20 € | |
| Recuento de células en contador automático | 9.83 € | 10.76 € | |
| Single cell Raphsody "Whole genome transriptome" | 2703.50 € | 2960.97 € | |
| Single cell Rhapsody prueba carga cartucho | 408.73 € | 447.65 € | |
| SIngle cell Rhapsody carga de cartucho | 1458.60 € | 1597.51 € | |
| Single cell Rhapsody generación librería a partir de "beads" | 389.70 € | 426.81 € | |
| Single cell 10X GEM-X 3´ gene expresion | 2963.53 € | 3245.77 € | |
| Single cell 10X FLEX gene expresion | 1326.76 € | 1453.12 € | |
| Single cell 10X GEM-X 3´ gene expression OCM | 914.04 € | 1001.10 € | |
| Procesado de muestras | 44.22 € | 48.43 € | |
| Single cell 10X generación de librería | 217.22 € | 237.91 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: UNIDAD DE GENÓMICA IPBLN
- Instituto: INSTITUTO DE PARASITOLOGIA Y BIOMEDICINA LOPEZ NEYRA
- Localidad: Armilla (Granada)
- Web del servicio: http://www.ipb.csic.es/servicios/GenomicaySintesisdeOligonucleotidos/index.html
La Unidad de Genómica es parte integrante de los Servicios de Apoyo a la Investigación del centro. Se encuentra ubicada en el PT de Ciencias de la Salud de Granada, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción científica con multitud de grupos de investigación en el sector biosanitario. El objetivo principal de la Unidad es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica. Entre los servicios ofertados se cuentan: secuenciación de DNA, análisis de fragmentos de DNA, purificación automática de ácidos nucléicos, síntesis de oligonucleótidos y análisis de calidad de RNA. Asímismo, la Unidad desempeña labores de formación y asesoramiento del personal investigador y colabora activamente en tareas de divulgación científica.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
En la Unidad de Genómica IPBLN somos expertas en la preparación de librerías genómicas y transcriptómicas para diversas aplicaciones: metabarcoding, metagenómica, RNA-seq, metatranscriptómica, ChIP-seq, RIP-seq, etc...Las librerías pueden generarse en bulk a partir de muestras de DNA o RNA obtenidas de material biológico, o bien pueden generarse en el contexto de ensayos de célula única. Para esto último disponemos de la plataforma de secuenciación de célula única de alto rendimiento Rhapsody de BD Biosciences. En resolución de célula única se puede realizar ensayos de transcriptomica, perfil inmunológico, accesibilidad de cromatina o multiome (estudios combinados de ATACseq+RNA-seq), pudiendo realizarse proteómica asociada. Cada proyecto se gestiona de manera personalizada, de acuerdo a los objetivos científicos del grupo investigador y a las necesidades específicas de las muestras ajustando los protocolos de ser necesario.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Bloqueo PCR | 1.26 € | 1.38 € | |
| Librerías RNA total | 239.06 € | 261.83 € | |
| QC Librerías Bioanalyzer HS | 136.59 € | 149.59 € | |
| Cuantificación Librerías ddPCR | 137.03 € | 150.08 € | |
| SingleCell MXK Human | 272.62 € | 298.58 € | |
| SingleCell AbSeq | 45.66 € | 50.00 € | |
| SingleCell Captura WTA/Panel | 1915.94 € | 2098.41 € | |
| SingleCell Librería Panel | 652.75 € | 714.92 € | |
| SingleCell Librería WTA | 291.08 € | 318.80 € | |
| Fragmentación DNA/RNA Covaris | 13.45 € | 14.73 € | |
| Librerías DNA | 77.12 € | 84.46 € | |
| Librerías Metabarcoding | 25.54 € | 27.98 € | |
| Librerías mRNA | 123.75 € | 135.53 € | |
| Librerías DNA Tagmentación | 106.74 € | 116.91 € | |
| SingleCell MXK Mouse | 198.51 € | 217.42 € | |
| SingleCell MXK Núcleo | 73.91 € | 80.95 € | |
| SingleCell Captura ATAC | 1962.71 € | 2149.64 € | |
| SingleCell Captura Multiomica | 2448.34 € | 2681.52 € | |
| SingleCell Librería ATAC | 596.34 € | 653.14 € | |
| SingleCell Librería Multiómica | 773.81 € | 847.51 € | |
| SingleCell Librería VDJ | 533.75 € | 584.58 € |
Otras prestaciones de servicio
- Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
- Análisis de fragmentos de DNA
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Secuenciación de DNA
- Consultoría Experimental y Técnica
- Electroforesis capilar
- Ultrasecuenciación - NGS - Secuenciación de segunda generación - Secuenciación masiva en paralelo
- Transcriptómica espacial
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: SERVICIO DE GENÓMICA
- Instituto: INSTITUTO DE BIOLOGIA EVOLUTIVA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.ibe.upf-csic.es
En el Servicio de Genómica del Instituto de Biología Evolutiva (IBE) utilizamos técnicas de biología molecular convencionales y de vanguardia para facilitar el análisis y caracterización de genes y material genético de cualquier organismo. Nuestro objetivo es el de ayudar a comprender el funcionamiento del genoma y su influencia en la evolución de la vida, así como su papel en la salud.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
El Servicio de Genómica ofrece la preparación de librerías para diferentes aplicaciones de secuenciación masiva, adaptando los protocolos al tipo de muestra, al organismo de estudio y a los objetivos específicos de cada proyecto. Entre las principales prestaciones se incluyen: - Librerías de metabarcoding, destinadas al análisis de comunidades biológicas mediante la amplificación y secuenciación de regiones marcadoras específicas. Esta metodología puede aplicarse a estudios de biodiversidad, microbiomas, dieta, ecología molecular y ADN ambiental. - Librerías de Hi-C, orientadas al estudio de la organización tridimensional del genoma, el análisis de interacciones entre regiones cromosómicas y el apoyo al ensamblaje de genomas a escala cromosómica. - Librerías de ddRAD-seq, basadas en la digestión del DNA con enzimas de restricción y la selección de fragmentos. Son especialmente útiles para la identificación de variantes genéticas, genotipado, estudios de estructura poblacional, filogeografía y genética de la conservación. - Preparación de otras librerías bajo demanda, según las necesidades técnicas y científicas del proyecto. El servicio puede abarcar las distintas etapas del proceso, incluyendo la evaluación inicial de las muestras, la selección u optimización del protocolo, la preparación y purificación de las librerías, su cuantificación y el control de calidad previo a la secuenciación. Cada solicitud se evalúa de forma personalizada para determinar la viabilidad del proyecto y establecer los requisitos de cantidad, concentración, pureza e integridad del material de partida. También se tienen en cuenta la plataforma de secuenciación prevista, la cobertura deseada y el tipo de análisis posterior.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Librería RADseq 8 muestras con extracción de DNA | 628.72 € | 688.60 € | |
| Librería HiC Preparación del DNA y Control de Calidad | 348.55 € | 381.75 € | |
| Librería RADseq-8 muestras de DNA | 476.52 € | 521.91 € | |
| Librería HiC Acondicionamiento del DNA y librería-post CQ | 1129.96 € | 1237.57 € | |
| Librerías Metabarcoding | 9468.90 € | 10370.70 € | |
| Librerías Metabarcoding SIN extracción de DNA | 6683.89 € | 7320.45 € | |
| DNA Barcoding | 157.42 € | 172.41 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio Científico-Técnico de Genotipado
- Instituto: INSTITUTO PIRENAICO DE ECOLOGIA
- Localidad: Zaragoza (Zaragoza)
- Web del servicio: http://www.ipe.csic.es/
El Servicio científico-Técnico de Genotipado Molecular es un servicio de creación reciente en el IPE-CSIC, diseñado para la realización de trabajos moleculares y asesoría cualificada. El servicio está orientado a trabajos de metabarcoding, filogenias moleculares, genética de poblaciones, biogeografía, transcriptómica, etc... y para ello se ofrecen servicios específicos de extracción de ADN en diferentes modalidades, cuantificación de ácidos nucleicos y asesoría científico técnica. El Servicio C-T de Genotipado Molecular dispone del equipamiento básico necesario para poner a punto técnicas de trabajo con ADN (extracción, cuantificación y amplificación), así como la preparación del material orientado a técnicas de Secuenciación de Nueva Generación (preparación de librerías, incubaciones de restricción o hibridaciones y enriquecimientoS). Actualmente, los análisis de genotipado molecular son una herramiento básica en botánica, ecología o zoología.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Condiciones generales: Preparación de librerías genómicas o genotecas de ADN con el kit NEBNext Ultra II para muestras ya fragmentadas o con el kit NEBNext Ultra II FS para muestras sin fragmentar (consultar idoneidad) para flujo posterior en NGS en plataforma Illumina. Se tarifa en bloques de 8 muestras. Casos específicos. Contactar con los responsables del servicio.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Genoteca con NEBNext Ultra II 8 muestras | 96.43 € | 105.61 € | |
| Genoteca con NEBNext Ultra II FS 8 muestras | 106.80 € | 116.98 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS Y BIOINFORMATICA
- Instituto: CENTRO DE INVESTIGACIONES INTERDISCIPLINARES DE ALCALA
- Localidad: Alcalá de Henares (Madrid)
Las tecnologías ómicas son aquellas basadas en metodologías que permiten la obtención de grandes cantidades de datos acerca uno o millones de analitos de una muestra o de millones de células independientemente, con el objetivo de obtener una visión global y a la vez profunda de los cambios moleculares asociados a un estado fisiológico o patológico. El laboratorio de tecnologías ómicas, pretende aportar estas tecnologías a los estudios en neurociencia que se realizan en el CSIC y en nuestro entorno. El laboratorio está equipado con lo necesario para hacer estudios de secuenciación masiva tanto de genomas completos, como de transcriptomas de tejido completo o de célula única y el análisis bioinformático de los resultados gracias a nuestra unidad de bioinformática integrada en nuestro laboratorio.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Preparación de librerías de NGS para RNAseq, scRNAseq y scRNAseq espacial| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Preparación de librerías de scRNAseq de tejido fijado 10x | 554.08 € | 606.85 € | |
| Libreria SMARTseq | 143.00 € | 156.62 € | |
| Librería scRNAseq 10xgenomics Next Gem Epi ATA+multiome | 4879.57 € | 5344.29 € | |
| Libreria Trasncriptoma NGS Illumina | 299.38 € | 327.89 € | |
| Librería single cell 3' 10xgenomics | 3614.76 € | 3959.02 € | |
| Librería Spatial Single cell RNAseq. Curio sin slide | 593.50 € | 650.02 € | |
| Librerías de scRNAseq de tejido fijado 10xgen sin reactivos | 554.08 € | 606.85 € | |
| Librerías de célula única Illumina T20 | 1511.46 € | 1655.41 € | |
| Librerías de NGS de trasncriptoma humano Iontorrent | 2204.72 € | 2414.69 € | |
| Librerías de NGS de trasncriptoma de ratón iontorrent | 2208.16 € | 2418.46 € | |
| Visium HD 3' Spatial Gene Expression | 6146.31 € | 6731.67 € | |
| Visium HD Spatial Panel Gene Expression 6,5mm | 6127.25 € | 6710.79 € | |
| Visium HD Spatial Panel Gene Expression 11mm | 7595.66 € | 8319.06 € | |
| Xenium in situ Gene Expression v1 SIN REACTIVOS | 695.76 € | 762.02 € | |
| Librería de Transcriptomica espacial Stratamap | 5090.38 € | 5575.17 € | |
| Librerías de célula única Illumina T10 | 1352.91 € | 1481.76 € | |
| Librería de célula única Illumina T100 | 5342.50 € | 5851.31 € |
Otras prestaciones de servicio
- Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
- Secuenciación
- Ultrasecuenciación: Análisis bioinformático de expresión génica diferencial y de procesamiento alternativo en experimentos de RNA-seq
- Ultrasecuenciación: Análisis Bioinformático de expresión génica diferencial en experimentos de célula única (single cell RNA-Seq)
- Disociación mecánico-enzimática de tejidos
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: GENÓMICA EXPERIMENTAL
- Instituto: CENTRO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cnb.csic.es/
El Servicio de Genómica del CNB es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Preparación de librerías para NGS (bulk y célula única).| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Librerias 3'mRNA | 94.10 € | 103.06 € | |
| Recuento de células en contador automático | 9.83 € | 10.76 € | |
| Single Cell Chip 10X | 570.58 € | 624.92 € | |
| Single Cell 10X procesado de muestras | 217.22 € | 237.91 € | |
| Single Cell Combinatorial bacording procesad de muestras | 1256.53 € | 1376.20 € | |
| Single cell Raphsody "Whole genome transriptome" | 2703.50 € | 2960.97 € | |
| Single cell Rhapsody prueba carga cartucho | 408.73 € | 447.65 € | |
| SIngle cell Rhapsody carga de cartucho | 1458.60 € | 1597.51 € | |
| Single cell Rhapsody generación librería a partir de "beads" | 389.70 € | 426.81 € | |
| Single cell 10X GEM-X 3´ gene expresion | 2963.53 € | 3245.77 € | |
| Single cell 10X GEM-X 3´ gene expression OCM | 914.04 € | 1001.10 € | |
| Single cell 10X FLEX gene expresion | 1326.76 € | 1453.12 € | |
| Procesado de muestras | 44.22 € | 48.43 € |