- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Genómica
- Proteómica
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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CBM - Madrid |
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IPBLN - Armilla |
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Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb) IBB - Barcelona |
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Servicio Científico-Técnico de Genotipado IPE - Zaragoza |
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LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS IC - Madrid |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE BIOLOGIA MOLECULAR SEVERO OCHOA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cbm.uam.es/genomica
El Servicio de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Preparación de librerías para NGS. Preparación de librerías a partir de célula única.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Single Cell 3'mRNA 10X | muestra | 3317.82 € | 3633.8 € |
| Single Cell mediant Combinatorial bacording proces de muestr | muestra | 890.68 € | 975.51 € |
| Single Cell 10X procesado de muestras | muestra | 150.73 € | 165.08 € |
| Librerias 3'mRNA | muestra | 98.39 € | 107.76 € |
| Single Cell Chip 10X | Chip | 575.52 € | 630.33 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: UNIDAD DE GENÓMICA IPBLN
- Instituto: INSTITUTO DE PARASITOLOGIA Y BIOMEDICINA LOPEZ NEYRA
- Localidad: Armilla (Granada)
- Web del servicio: http://www.ipb.csic.es/servicios/GenomicaySintesisdeOligonucleotidos/index.html
La Unidad de Genómica es parte integrante de los Servicios de Apoyo a la Investigación del centro. Se encuentra ubicada en el PT de Ciencias de la Salud de Granada, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción científica con multitud de grupos de investigación en el sector biosanitario. El objetivo principal de la Unidad es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica. Entre los servicios ofertados se cuentan: secuenciación de DNA, análisis de fragmentos de DNA, purificación automática de ácidos nucléicos, síntesis de oligonucleótidos y análisis de calidad de RNA. Asímismo, la Unidad desempeña labores de formación y asesoramiento del personal investigador y colabora activamente en tareas de divulgación científica.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
En la Unidad de Genómica IPBLN somos expertas en la preparación de librerías genómicas y transcriptómicas para diversas aplicaciones: metabarcoding, metagenómica, RNA-seq, metatranscriptómica, ChIP-seq, RIP-seq, etc...Las librerías pueden generarse en bulk a partir de muestras de DNA o RNA obtenidas de material biológico, o bien pueden generarse en el contexto de ensayos de célula única. Para esto último disponemos de dos plataformas de secuenciación de célula única de alto rendimiento que nos permiten hacer la captura y el etiquetado celular: la plataforma Chromium de 10x Genomics y la plataforma Rhapsody de BD Biosciences. En resolución de célula única se puede realizar ensayos de transcriptomica, perfil inmunológico, accesibilidad de cromatina o multiome (estudios combinados de ATACseq+RNA-seq). Cada proyecto se gestiona de manera personalizada, de acuerdo a los objetivos científicos del grupo investigador y a las necesidades específicas de las muestras ajustando los protocolos de ser necesario.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| SingleCell 10x Chip | Chip | 724.01 € | 792.97 € |
| Single Cell 10x GEMs Multiome | reacción | 6786.25 € | 7432.56 € |
| SingleCell Rhapsody Captura | cartucho | 2525.64 € | 2766.17 € |
| Librerías DNA Tagmentación | muestra | 100.09 € | 109.62 € |
| Librerías RNA total | muestra | 225.76 € | 247.26 € |
| SingleCell Rhapsody Librería WTA | librería | 708.03 € | 775.47 € |
| Fragmentación DNA/RNA Covaris | muestra | 14.93 € | 16.35 € |
| SingleCell 10x FeatBar | muestra | 155 € | 169.77 € |
| Librerías Metabarcoding | muestra | 25.2 € | 27.6 € |
| SingleCell Rhapsody AbSeq | muestra | 44.44 € | 48.68 € |
| SingleCell Rhapsody Librería Panel | librería | 788.54 € | 863.64 € |
| Cuantificación Librerías ddPCR | € / 8 muestras | 130.23 € | 142.63 € |
| Librerías smallRNA | muestra | 157.29 € | 172.27 € |
| Librerías mRNA | muestra | 114.98 € | 125.93 € |
| Librerías DNA | muestra | 76.69 € | 83.99 € |
| SingleCell 10x VDJ | reacción | 99.29 € | 108.75 € |
| QC Librerías Bioanalyzer HS | chip (11 muestras) | 144.65 € | 158.42 € |
| SingleCell 10x CellPlex | muestra | 321.34 € | 351.94 € |
| Bloqueo PCR | muestra | 1.32 € | 1.45 € |
| SingleCell 10x GEMs | reacción | 3944.23 € | 4319.87 € |
| SingleCell 10x Librería | librería | 250.43 € | 274.28 € |
| SingleCell Rhapsody Multiplex | muestra | 287.85 € | 315.27 € |
Otras prestaciones de servicio
- Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
- Análisis de fragmentos de DNA
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Secuenciación de DNA
- Consultoría Experimental y Técnica
- Electroforesis capilar
- Ultrasecuenciación - NGS - Secuenciación de segunda generación - Secuenciación masiva en paralelo
- Transcriptómica espacial
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio de Certificaciones y Análisis del Instituto Botánico de Barcelona (certibb)
- Instituto: INSTITUTO BOTANICO DE BARCELONA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.ibb.csic.es/
Con el objetivo de maximizar la transferencia de tecnología a las empresas, a otras instituciones de investigación y a la sociedad en general, el IBB creó en 2013 una unidad de servicios (CertIBB). Esta unidad ofrece servicios de formación, análisis y consultoría basados en su personal científico y técnico y sus instalaciones especializadas. El servicio de certificaciones y análisis del IBB tiene la misión de proporcionar a otros centros de investigación, empresas y a la sociedad en general, una serie de herramientas y técnicas moleculares y taxonómicas, así como la prestación de consultoría y formación a través de los servicios. Para ello, el IBB dispone de personal científico y técnico de experiencia probada, de un herbario de referencia con 800000 pliegos, una biblioteca especializada, laboratorios completamente equipados, cámaras de cultivo, invernaderos y mariposario.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
SELECCIÓN POR TAMAÑO DE FRAGMENTOS GENÉTICOS En los protocolos de preparación de librerías genómicas para plataformas de secuenciación de alto rendimiento (Next Generation Sequencing) es a menudo necesario aplicar métodos de selección de fragmentos de ADN y ARN por tamaño. Algunos ejemplos de protocolos incluyen la construcción de liberías paired-end, mate-pair o RNAseq. El servicio ofrece realizar una selección por tamaño de fragmentos genéticos de forma automatizada garantizando mayor especificidad en el tamaño de los fragmentos y mayor calidad del DNA/RNA extraído. Servicio ofrecido: - Selección y captura automatizada de fragmentos de ADN y ARN, dentro de un rango de 90 pb a 8 kb, mediante un instrumento PippinPrep (Sage Science). - Cada unidad puede incorporar hasta 4 librerías. -Asesoramiento en la preparación y manipulación de muestras| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Selección por tamaño de fragmentos genéticos - 4 muestras | € / 4 muestras | 175.58 € | 192.3 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio Científico-Técnico de Genotipado
- Instituto: INSTITUTO PIRENAICO DE ECOLOGIA
- Localidad: Zaragoza (Zaragoza)
- Web del servicio: http://www.ipe.csic.es/
El Servicio científico-Técnico de Genotipado Molecular es un servicio de creación reciente en el IPE-CSIC, diseñado para la realización de trabajos moleculares y asesoría cualificada. El servicio está orientado a trabajos de metabarcoding, filogenias moleculares, genética de poblaciones, biogeografía, transcriptómica, etc... y para ello se ofrecen servicios específicos de extracción de ADN en diferentes modalidades, cuantificación de ácidos nucleicos y asesoría científico técnica. El Servicio C-T de Genotipado Molecular dispone del equipamiento básico necesario para poner a punto técnicas de trabajo con ADN (extracción, cuantificación y amplificación), así como la preparación del material orientado a técnicas de Secuenciación de Nueva Generación (preparación de librerías, incubaciones de restricción o hibridaciones y enriquecimientoS). Actualmente, los análisis de genotipado molecular son una herramiento básica en botánica, ecología o zoología.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Condiciones generales: Preparación de librerías genómicas o genotecas de ADN con el kit NEBNext Ultra II para muestras ya fragmentadas o con el kit NEBNext Ultra II FS para muestras sin fragmentar (consultar idoneidad) para flujo posterior en NGS en plataforma Illumina. Se tarifa en bloques de 8 muestras. Casos específicos. Contactar con los responsables del servicio.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Genoteca con NEBNext Ultra II 8 muestras | € /muestras | 83.14 € | 91.06 € |
| Genoteca con NEBNext Ultra II FS 8 muestras | € / muestras | 90.92 € | 99.58 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS
- Instituto: INSTITUTO CAJAL
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cajal.csic.es/
Las tecnologías ómicas son aquellas basadas en metodologías que permiten la obtención de grandes cantidades de datos acerca uno o millones de analitos de una muestra o de millones de células independientemente, con el objetivo de obtener una visión global y a la vez profunda de los cambios moleculares asociados a un estado fisiológico o patológico. El laboratorio de tecnologías ómicas, pretende aportar estas tecnologías a los estudios en neurociencia que se realizan en el CSIC y en nuestro entorno. El laboratorio está equipado con lo necesario para hacer estudios de secuenciación masiva tanto de genomas completos, como de transcriptomas de tejido completo o de célula única y el análisis bioinformático de los resultados gracias a nuestra unidad de bioinformática integrada en nuestro laboratorio.
Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
Descripción de la prestación
Preparación de librerías de NGS para RNAseq, scRNAseq y scRNAseq espacial| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Libreria Trasncriptoma NGS Illumina | € / muestra | 188.43 € | 206.37 € |
| Librerías -Single Cell ATACSeq+RNAseq | € / muestra | 12218.65 € | 13382.33 € |
| Librerías de single cell con resolución espacial 3x3 | 8 secciones | 289.33 € | 316.89 € |
| Librería single cell 3' 10xgenomics | muestra | 3582.61 € | 3923.81 € |
| Libreria SMARTseq | € / muestra | 179.78 € | 196.9 € |
| Librería singel cell RNAseq tejido fijado 10xgenomics | euros / experimento | 3808.33 € | 4171.02 € |