- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
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- Genómica
Formación en bioinformática: análisis de datos genómicos, de microchips, programación con PERL, etc.
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: INFORMÁTICA CIENTÍFICA
- Instituto: CENTRO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cnb.csic.es/
Idiomas: EN, ES, FR. Bioinformática: análisis de datos procedentes de secuenciación masiva (NGS), metagenómica, análisis, anotación y ensamblaje de genomas, filogenia, etc. Biocomputación: Modelado y simulación de macromoléculas, e interacciones moleculares, dinámica molecular, docking, análisis de afinidad por drogas, modelos de química cuántica. Computación Científica: modelos matemáticos, estadísticos y epidemiológicos complejos. Desarrollo y programación científica: (+20 lenguajes, web, paralela y distribuída) Formación: Realización de cursos de ámbito internacional en los temas de experiencia del servicio, tales como: Bioestatistics, Phylogeny, Metagenomics, Programming, Molecular Modeling. Coordinación: coordinación con otros servicios, instituciones y grupos de investigación a nivel internacional. Equipamiento: Equipo de cómputo dedicado, acceso a los clusters del CNB, del CSIC y del CESGA. Servidor web: cnb.csic.es
Formación en bioinformática: análisis de datos genómicos, de microchips, programación con PERL, etc.
Descripción de la prestación
El servicio lleva impartiendo cursos de formación desde su formación a principios de los 90 y tiene una larga experiencia docente en cursos locales, nacionales e internacionales, tanto localmente como en múltiples paises e instituciones, a todos los niveles, en una amplia variedad de temas. Formación en Bioestadística, Programación (R, Perl, Python, C, Fortran, etc...), Inteligencia Artificial y Big Data Formación en Análisis de datos de NGS (DNAseq, RNAseq, Proteómica, Pangenómica, Metagenómica, Annotation, etc.), Formación en Biología Computacional (Molecular Mechanics/Dynamics, Quantum Mechanics/Dynamics, Docking, Screening, etc.)| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Formacion (30h course) | € / hora | 1451.45 € | 1589.69 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: BIOINFORMÁTICA MARINA
- Instituto: INSTITUTO DE CIENCIAS DEL MAR
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.icm.csic.es/
El Servicio de Bioinformática Marina (SBM) ofrece soluciones integradas para la gestión, almacenamiento y análisis de datos de secuenciación masiva de ADN de microorganismos marinos, aunque por su infraestructura y funcionamiento, puede también abrirse a otros organismos marinos (peces, cnidarios, etc). El núcleo del servicio es un cluster de computación IBM IDataPlex con 288 unidades de proceso y 1000 GB de RAM en 12 nodos de computación, escalable a 40 nodos, así como un servidor DELL PowerEdge T710 con 16 CPU y 16 GB de RAM y un servidor de backup Supermicro 6047R-E1R36N con 48 TB de almacenamiento. El SBM puede desde realizar análisis completos de datos de secuenciación, a la formación en biología computacional de sus usuarios, pasando por la gestión y desarrollo de software a medida.
Formación en bioinformática: análisis de datos genómicos, de microchips, programación con PERL, etc.
Descripción de la prestación
Formación para habilitar a los usuarios del servicio a trabajar de manera autónoma desde la línea de comandos de entornos UNIX. Sistema de archivos UNIX, ssh, ftp, comandos de bash y awk, envío de trabajos al sistema de gestión de colas SLURM. Iniciación al scripting. Introducción a los programas básicos para el análisis de datos genómicos: BLAST+, QIIME, samtools, fastx toolkit, fastqc, ensambladores, Galaxy, etc. Introducción a R y bioconductor. Condicionado a la contratación de la prestación "uso del cluster bioinformático".| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Formación en bioinformática | € / h | 108.34 € | 173.34 € |