- Áreas de investigación
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- Ciencias Agrarias
- Grupo
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- Análisis y Métodos Biológicos
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- Microbiología
Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en suelo y cultivos
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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Servicio de Organismos Fitopatógenos y de Cuarentena IAS - Córdoba |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Servicio de Organismos Fitopatógenos y de Cuarentena
- Instituto: INSTITUTO DE AGRICULTURA SOSTENIBLE
- Localidad: Córdoba (Córdoba)
- Web del servicio: http://www.ias.csic.es/
El servicio ofrece distintas prestaciones que tienen relación con investigación y desarrollo experimental en temas relacionados con microbioma vegetal en general, y los organismos fitopatógenos en particular incluyendo los de cuarentena. Entre las distintas prestaciones que ofrece el servicio se encuentran: 1) Asesoramiento científico, diseño, establecimiento y monitorización de experimentos en campo y condiciones controladas (invernadero, cámaras, laboratorio). 2) Técnicas de cuantificación y extracción de ácidos nucleicos 3) Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de microorganismos incluyendo fitopatógenos y de cuarentena 4) Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en distintos substratos 5) Diagnóstico específico de agentes fitopatógenos mediante procedimientos clásicos y moleculares 6) Evaluación de productos biológicos/químicos en el control de enfermedades o promoción del crecimiento y caracterización de la resistencia de plantas
Aplicación de NGS para el estudio de poblaciones microbianas en suelo y cultivos
Descripción de la prestación
Aplicación de técnicas de secuenciación masiva (Illumina MiSeq; paired-end: 2 x 300 pb) con primers específicos para el estudio de poblaciones totales de microorganismos (hongos, bacterias, etc.) en muestras de plantas y suelo, heces, agua, alimentos, etc,. Extracción de DNA en caso de ser necesario.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Análisis NGS de microorganismos. No incluye extracción ADN | € / muestra | 48.18 € | 52.77 € |
| Análisis NGS de microorganismos. Incluye extracción ADN | € / muestra | 67.47 € | 73.89 € |
Otras prestaciones de servicio
- Alquiler de módulos y realización de ensayos en invernaderos y fitotrón
- Biología Molecular: Cuantificación de extractos de ácidos nucleicos
- Cultivos de bacterias
- Difusión de actividades
- Organización de visitas y eventos (meetings, workshops, congresos y actividades formativas)
- Diagnóstico específico de hongos, oomicetos y bacterias patógenos de plantas
- Evaluación de eficacia de productos biológicos o químicos en la promoción del crecimiento plantas
- Evaluación de eficacia de productos biológicos o químicos en el control de patógenos de plantas
- Desarrollo y validación de procedimientos de diagnóstico moleculares especie-escecíficos de agentes fitopatógenos
- Diagnóstico molecular especie-específicos de agentes fitopatógenos
- Caracterización de la resistencia de plantas a agentes fitopatógenos
- Aislamiento, purificación, mantenimiento y cultivo de organismos fitopatógenos de cuarentena
- Aislamiento masivo de microorganismos (culturómica)
- Sensores próximos para la estimación de rasgos de vegetación
- Composición y diversidad de comunidades microbianas mediante metabarcoding.
- Asesoramiento científico
- Diseño, establecimiento y monitorización de experimentos