- Áreas de investigación
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- Biología y Biomedicina
- Grupo
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- Proteómica, Genómica y Metabolómica
- Subagrupación
-
- Genómica
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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CIB - Madrid |
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IATA - Paterna |
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CBM - Madrid |
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IPBLN - Armilla |
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IDAEA - Barcelona |
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IIBM - Madrid |
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LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS IC - Madrid |
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CISA - Valdeolmos-Alalpardo |
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CIC - Salamanca |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: PROTEÓMICA Y GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS MARGARITA SALAS
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cib.csic.es/es/servicio.php?iddepartamento=29
PROTEÓMICA El equipamiento actual del Servicio es el siguiente: 2 unidades de isoelectroenfoque Protean IEF cell (BIO-RAD), para la primera dimensión de los geles 2D en tiras de 7 cm de diferentes rangos de pH: 3-10 no lineal, 3-10-lineal y 4-7 lineal. 1 Cubeta multigel Miniprotean Dodecacell (BIO_RAD), para la electroforesis simultánea de hasta 12 geles de 8 x 7 cm. Espectrómetro de masas MALDI-TOF-TOF Autoflex III (Bruker).. Espectrómetro de masas Q-Exactive (Thermo Scientific) dotado de una fuente de ionización nano conectada en línea a un nano-UPLC Easy-LC 1000.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Sistema TapeStation 4150 de Agilent para el control de calidad de muestras de ADN y ARN mediante electroforesis automatizada. Esta plataforma incluye el instrumento, software de procesamiento de datos, reactivos y dispositivos ScreenTape para analizar el tamaño de la muestra, la cantidad y la integridad. Ofrece una evaluación analítica de gran exactitud y precisión.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Tape Station RNA y DNA Sensibilidad Estandar (chip) | € / chip | 85.16 € | 93.27 € |
| Tape Station RNA y DNA Alta Sensibilidad (muestra) | € / muestra | 10.91 € | 11.95 € |
| Tape Station RNA y DNA Sensibilidad Estandar (muestra) | € / muestra | 10.35 € | 11.33 € |
| Tape Station RNA y DNA Alta Sensibilidad (chip) | € / chip | 96.26 € | 105.43 € |
Otras prestaciones de servicio
- 1D Electrophoresis SDS-PAGE
- Identificación y Caracterización - PCR a tiempo real
- Análisis de compuestos por Espectrometría de Masas: MALDI-TOF
- Peptide Mass Fingerprinting MS - MS/MS by MALDI TOF/TOF
- Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)
- Análisis proteómico cuantitativo por TMT
- Cromatografía de afinidad: Enriquecimiento en fosfopétidos para proteómica
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Genómica
- Instituto: INSTITUTO DE AGROQUIMICA Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS
- Localidad: Paterna (Valencia)
- Web del servicio: http://www.iata.csic.es/
Ofrecemos apoyo científico-técnico a grupos de investigación del IATA así como a otros centros de investigación o empresas que deseen utilizar técnicas de estudio global de genomas y de expresión génica. Incluye las técnicas de microarrays de DNA y PCR cuantitativa a tiempo real. Ofrecemos también servicios relacionados, como extracción de ácidos nucleicos a partir de distintos tipos de muestras, cuantificación y control de calidad de las muestras. Por otraparte Este servicio también permite el análisis de proteínas a partir de mezclas complejas con alta reproducibilidad y alta resolución.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Se utiliza un equipo TapeStation (Algilent). Este lleva a cabo una electroforesis automatizada y mediante un software de procesado de datos, permite analizar el tamaño, la cantidad y la integridad de muestras de ADN o ARN para evaluar su idoneidad en aplicaciones posteriores. El equipo utiliza 1 o 2 ul de ADN o ARN y tarda 1 o 2 minutos por muestra.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| TapeStation fungible DNA todo | € / muestra | 11.79 € | 12.07 € |
| TapeStation fungible genérico | € / muestra | 7.62 € | 7.74 € |
| TapeStation sin fungible | € / muestra | 39.55 € | 39.55 € |
| TapeStation fungible DNAg todo | € / muestra | 14.61 € | 15.02 € |
| TapeStation fungible RNA todo | € / muestra | 12.55 € | 12.87 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE BIOLOGIA MOLECULAR SEVERO OCHOA
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cbm.uam.es/genomica
El Servicio de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO es responsable de la implementación y desarrollo de tecnologías de biología molecular y genómica. La filosofía del servicio radica fundamentalmente en adaptarse lo más posible a las necesidades del usuario. Por ello, el modelo de funcionamiento es muy abierto y se basa en dos aspectos principales: la atención individualizada (tanto en diseño como realización y análisis de experimentos) y la posibilidad de uso autónomo (mediante reserva electrónica) de la mayoría de los equipos adscritos al servicio. Esto permite al usuario decidir su nivel de implicación en cada proyecto según sus necesidades y circunstancias.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Determinación de calidad de ADN y RNA, control de calidad de librerías de NGS y análisis de fragmentos mediante el equipo QSep100| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Calidad de RNA (R1) | muestra | 7.78 € | 8.52 € |
| Calidad de DNA Standart (S2) | muestra | 5.86 € | 6.42 € |
| Calidad de DNA High Sensitivity (S1) | muestra | 9.12 € | 9.99 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: UNIDAD DE GENÓMICA IPBLN
- Instituto: INSTITUTO DE PARASITOLOGIA Y BIOMEDICINA LOPEZ NEYRA
- Localidad: Armilla (Granada)
- Web del servicio: http://www.ipb.csic.es/servicios/GenomicaySintesisdeOligonucleotidos/index.html
La Unidad de Genómica es parte integrante de los Servicios de Apoyo a la Investigación del centro. Se encuentra ubicada en el PT de Ciencias de la Salud de Granada, lo que le proporciona un enclave privilegiado para la cooperación e interacción científica con multitud de grupos de investigación en el sector biosanitario. El objetivo principal de la Unidad es prestar soporte científico y tecnológico en el área de la genómica a los grupos de investigación en el ámbito nacional que lo requieran, así como la implementación de nuevas tecnologías y protocolos de utilidad para el desarrollo de la actividad científica. Entre los servicios ofertados se cuentan: secuenciación de DNA, análisis de fragmentos de DNA, purificación automática de ácidos nucléicos, síntesis de oligonucleótidos y análisis de calidad de RNA. Asímismo, la Unidad desempeña labores de formación y asesoramiento del personal investigador y colabora activamente en tareas de divulgación científica.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
El análisis de calidad de RNA mediante electroforesis en chip permite verificar la integridad de las muestras de RNA de forma previa a su utilización en ensayos tales como expresión génica, microarrays, RNA-seq etc... El análisis proporciona la concentración y el RIN o RNA integrity number. La solicitud se hará por chips completos, teniendo capacidad cada chip para 12 muestras de RNA. El análisis podrá realizarse tanto en la modalidad de RNA total eucariota sensibilidad estándar, como en modalidad RNA mensajero sensibilidad estandard. 1. Las muestras se entregarán en tubos de 0.2, 0.5 o 1.5 ml claramente identificadas. 2. Se entregará al servicio un volumen mínimo de muestra de 3 ul en el siguiente rango de concentración: RNAtotal..... 25-500 ng/ul mRNA...........25-250 ng/ul 3. Los RNAs se entregarán en H2O o TE. 4. Las muestras serán entregadas directamente al personal de la Unidad de Genómica. Todas las muestras deberán ir acompañadas de su correspondiente solicitud debidamente cumplimentada. 5.El usuario recibirá via correo electronico un informe en formato ".pdf" conteniendo: Concentración y RIN de cada muestra. Histórico de la electroforesis. Electroferograma Imagen virtual del gel Equipamiento: Bioanalyzer 2100 Agilent| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| RNA StdSens | chip (12 muestras) | 82.61 € | 90.48 € |
Otras prestaciones de servicio
- Análisis de fragmentos de DNA
- Preparación, purificación o cuantificación de muestras de DNA y RNA
- Secuenciación de DNA
- Consultoría Experimental y Técnica
- Electroforesis capilar
- Ultrasecuenciación - NGS - Secuenciación de segunda generación - Secuenciación masiva en paralelo
- Preparación de librerías genómicas y transcriptómicas
- Transcriptómica espacial
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: TOXICOGENÓMICA AMBIENTAL
- Instituto: INSTITUTO DE DIAGNOSTICO AMBIENTAL Y ESTUDIOS DEL AGUA
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.idaea.csic.es
El Servicio de Toxicogenómica Ambiental ofrece un equipamiento y un personal altamente especializado que permite la aplicación de varias técnicas: • Extracción y cuantificación de ARN y ADN • Control de calidad de ARN • Electroforesis en gel de agarosa • Detección de genes • Análisis de expresión génica • Análisis de variación genética. Además, el STA ofrece la posibilidad de estudiar la toxicidad de un compuesto, mezcla o muestra siguiendo las pautas de la OCDE, como Ensayo de Toxicidad Aguda en Embriones de Pez Zebra; Test de Reproducción en Daphnia magna; Test de inmovilización aguda en Daphnia sp.; y Test de inhibición del crecimiento en algas. Además, el STA ofrece una plataforma de lipidómica para analizar al composición en lípidos de muestras biológicas, que incluye extracción, análisis y procesado de datos. También se ofrecen ensayos in-vitro (lineas celulares de peces y humanas) para detectar disruptores endocrinos que modulan el balanc
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Analisis de la integridad del ARN mediante electroforesis en gel (tecnología microfluídica) 2100 Bioanalyzer (Agilent)| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| 1 chip de RNA (12 muestras) | €/chip (12 muestras) | 107.52 € | 117.76 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: GENÓMICA
- Instituto: INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMEDICAS SOLS-MORREALE
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: https://www.iib.uam.es/portal/web/genomica/presentacion
El Servicio de Genómica fue creado en el año 1994 para apoyar con técnicas genómicas la tarea investigadora del personal del IIBm. Además, nuestro laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico. El Servicio dispone de un sistema de gestión de calidad conforme con la Norma UNE-EN ISO 9001:2000. El Servicio pertenece a la red de laboratorios de la CAM. Nº de registro:281.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
ANALISIS DE INTEGRIDAD DE RNA. CUANTIFICACION ESPECTROFOTOMÉTRICA O FLUORIMETRICA La integridad de las muestras de RNA es fundamental en el contexto de los análisis de expresión génica mediante la tecnología de microarrays o de PCR en tiempo real. El Bionalizador 2100 permite la caracterización cualitativa y cuantitativa de muestras de RNA total o RNA mensajero (RNAm) basándose en los patrones de movilidad electroforética de las muestras en una matriz de gel que se introduce en unos chips formados por una serie de microcanales y depósitos en miniatura interconectados a través de los cuales migran electroforéticamente los ácidos nucleicos. El valor del número de integridad del RNA (RIN) facilita la determinación objetiva de la calidad del RNA que se utilizará en experimentos posteriores. Este valor que va desde el 1 al 10, se basa en la cuantificación de productos de degradación del RNA a lo largo de toda su migración electroforética. La espectrofotometría UV/Visible nos permite confirmar que contamos con cantidad suficiente de ácidos nucleícos (DNA/RNA) de calidad adecuada antes de llevar a cabo ensayos de PCR cuantitativa en tiempo real (QRTPCR), análisis de SNPS (Polimorfismos de nucleótido único) o la secuenciación automática de muestras de DNA de plásmidos, cósmidos, productos de PCR...La principal ventaja de trabajar con el espectrofotómetro NanoDrop ND1000 es que la medida se lleva acabo a partir de 1 ó 1,5 ¿l de muestra sin ayuda de ningún tipo de cubeta ya que la muestra se pipetea directamente sobre la superficie de medida. El rango de medida para muestras de DNA es de 2-3700 ng/ul y para RNA de 2-3000 ng/ul. El Servicio también cuenta con un fluorímetro (Qubit) que permite, mediante la utilización de sondas fluorescentes, cuantificar de forma altamente específica muestras de DNA, RNA o proteínas. El Servicio dispone de diferentes kits en función del tipo de muestra y su concentración. COMO TRAER LAS MUESTRAS AL SERVICIO Los usuarios deberán traer al Servicio 3 ul de las muestras que deseen analizar en el equipo en tubos de 1.5 ml (1 ul se empleará para cuantificar la muestra en el Nanodrop previamente a elegir el chip a emplear; 1 ul se empleará para el análisis de integridad en el Bioanalizador). Aquellos que no dispongan de muestra suficiente que consulten en el Servicio. El Servicio emite un informe con los resultados Para más información consultar: https://www.iib.uam.es/portal/web/genomica/normas| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Determinación integridad RNA | € / muestra | 5.7 € | 6.24 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: LABORATORIO DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS
- Instituto: INSTITUTO CAJAL
- Localidad: Madrid (Madrid)
- Web del servicio: http://www.cajal.csic.es/
Las tecnologías ómicas son aquellas basadas en metodologías que permiten la obtención de grandes cantidades de datos acerca uno o millones de analitos de una muestra o de millones de células independientemente, con el objetivo de obtener una visión global y a la vez profunda de los cambios moleculares asociados a un estado fisiológico o patológico. El laboratorio de tecnologías ómicas, pretende aportar estas tecnologías a los estudios en neurociencia que se realizan en el CSIC y en nuestro entorno. El laboratorio está equipado con lo necesario para hacer estudios de secuenciación masiva tanto de genomas completos, como de transcriptomas de tejido completo o de célula única y el análisis bioinformático de los resultados gracias a nuestra unidad de bioinformática integrada en nuestro laboratorio.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Para la preparación de librerías para NGS es fundamental, la validación de la cantidad y la calidad de los ARN purificados. Para ello en este servicio, los ARN se cuantificarán mediante espectrofotometría con el sistema One nanodrop (thermofisher). Si la cantidad de RNA es suficiente (>0.5mg/ml) y esta libre de interferencias (Ratio 260/280nm aprox 1.8-2; ratio 260/230 2-2.2), entocnes, se validará la integridad de los ARN mediante sistema de electroforesis capilar en gel y detección por fluorescencia (Bioptic, Inc). Este sistema permite analizar en pequeños volumnes de muestras, la calidad de un RNA a partir de la ratio entre las señales del rRNA 18S y 28S. Valores de ratio 18S/28S entre 7 y 10 se consideran válidos para los siguientes protocolos de preparación de librerías para NGS.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| ANALISIS DE CALIDAD DE RNA | 1 muestra | 50.77 € | 55.6 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: Secuenciación
- Instituto: CENTRO DE INVESTIGACION EN SANIDAD ANIMAL
- Localidad: Valdeolmos-Alalpardo (Madrid)
El servicio de secuenciación del CISA permite potenciar los estudios moleculares dirigidos a la diagnosis y prevención de patógenos animales de alto riesgo y con gran impacto económico; así como también los estudios moleculares derivados de la investigación básica. El laboratorio ofrece su servicio a cuantas instituciones públicas o privadas pudieran necesitar de estas técnicas como apoyo a su investigación o al diagnóstico.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Determinación de calidad, integridad y tamaño de ADN y ARN. Equipo: 4200 TapeStation Agilent.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Determinación de calidad y tamaño ADN y ARN | € / chip | 8.39 € | 9.19 € |
Otras prestaciones de servicio
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: UNIDAD DE GENÓMICA
- Instituto: CENTRO DE INVESTIGACION DEL CANCER
- Localidad: Salamanca (Salamanca)
- Web del servicio: http://www.cicancer.org/
La Unidad de Genómica ofrece soporte integral tanto al IBMCC como a usuarios externos, brindando servicios completos de secuenciación y microarrays. Gestionamos todo el proceso analítico de principio a fin, comenzando por la muestra experimental (ARN total, ADN genómico, plásmidos o fragmentos de PCR, según el análisis). Nuestros servicios abarcan todos los pasos de la genómica, incluido el asesoramiento técnico sobre diseño experimental y control de calidad de las muestras proporcionadas. Las instalaciones y los protocolos experimentales cuentan con la certificación ISO 9001, lo que garantiza estándares de alta calidad. Además, nuestro Sistema de Gestión de Seguridad y Salud Ocupacional está certificado bajo el sistema OHSAS 18001, lo que refleja nuestro compromiso de mantener un ambiente de trabajo seguro y conforme.
Análisis de calidad de RNA, DNA, ácidos nucleicos
Descripción de la prestación
Análisis, cuantificación y control de calidad de muestras de ADN, ARN y proteínas utilizando el bioanalizador Agilent 2100, una plataforma de electroforesis automatizada.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Análisis calidad RNA Nano kit | 1 muestra | 4.45 € | 4.88 € |