FPU2023-Aplicación de métodos avanzados de genómica comparativa al estudio de las bases genéticas de resistencia antimicrobiana

La resistencia a los antibióticos es hoy uno de los mayores problemas de salud global; un fenómeno natural agravado por el uso excesivo e inadecuado de estos fármacos. La secuenciación genómica de las bacterias infecciosas promete convertirse en una herramienta de diagnóstico preciso y completo de resistencias antibióticas. Para ello es necesario conocer de ante mano los genes y mutaciones que causan estos fenotipos. El proyecto contempla los siguientes objetivos principales: (1) caracterizar nuevos mecanismos de resistencia a antibióticos mediante métodos avanzados de genómica comparativa, incluyendo estudios de asociación del genoma completo. (2) determinar la resistencia a antibióticos cuantitativamente mediante métodos estadísticos y aprendizaje automático (“machine learning”). (3) estudiar la prevalencia y mecanismos genéticos de resistencia cruzada y sensibilidad colateral en cepas clínicas. (4) desarrollar herramientas bioinformáticas de acceso libre para procesar secuencias genómicas brutas y predecir las resistencias a antibióticos genotípicamente. El proyecto contempla colaboraciones y estancias con investigadores en España y Reino Unido. La/el candidata/o seleccionada/o contribuirá a la ejecución de estos objetivos, y a la docencia universitaria y supervisión de estudiantes de grado y máster. También podrá participar en otros proyectos en marcha y aprender sobre la variedad de aplicaciones clínicas y en salud pública de la genómica microbiana.