DNA microarrays: Análisis bioinformático de patrones de expresión génica (clustering).

Descripción del servicio

Dentro de las distintas aplicaciones disponibles con este tipo de microarrays, en la Unidad de Genómica de Cabimer se ofertan las siguientes: Estudios de expresión génica tradicional mediante ¿3¿ IVT Expression Analysis¿o ¿Prime View¿. Son microarrays (¿3¿ expression arrays¿) que tiene una media de 11 sondas/gen que detectan la región 3¿ del transcrito. Para el análisis convencional de patrones de expresión basado en secuencias predichas y bien anotadas de mensajeros. Estudios de transcriptoma completo que permiten estudios de expresión génica mediante microarrays (¿Gene arrays/Clariom S¿) con 26 sondas/gen diseñadas a lo largo del gen completo. Para estudios de expresión diferencial más completos (al contemplar transcritos sin extremos PolyA: lncRNA, lincRNA,etc.), más concretos y económicos que los ¿3¿ Expression Arrays¿ o ¿Prime View¿. Estudios de variantes de splicing mediante los nuevos ¿Clariom D/Transcriptome Array¿ (Human, Mouse, Rat) con sondas en exones y en las zonas de junction y alternativamente con los ¿Exon Array¿ que consta de 4 sondas/exón y 40 sondas/gen (10 exones). Para estudios de niveles de expresión génica y a nivel de exones. Estudios de small-RNA, para estudios de mecanismos mediados por miRNAs, pre-miRNA, snoRNA, scaRNA y con más de 203 organismos en un mismo enayo. Estudios de regulación de genomas completos para distintas aplicaciones Mapeo transcriptómico con microarrays (¿Whole Genome Arrays¿) que cubren todo el genoma: estudio de expresión génica, splicing aleternativo, miRNA¿. Estudios de interacciones ADN/proteína (ChIP-on-Chip) con distintos tipos de arrays de cobertura total (Tiling Array), Promotores. Estudios de citogenética molecular con alta sensibilidad, especificidad y resolución para la identificación de aberraciones cromosómicas en el control de calidad de líneas celulares (stem cell incl.), estudios prenatales, células tumorales, etc.. en la detección de anormalidades, aberraciones submicroscópicas, pérdidas/ausencia de heterocigosidad, ganancias y pérdidas, disomías uniparentales y mosaicos.