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Tipo de expresión:
Doctorado: Propuesta de dirección de tesis doctoral/temática para solicitar ayuda predoctoral ("Hosting Offer o EoI")

Ámbito:
BIOLOGIA DE SISTEMAS

Área:
Vida

Modalidad:
Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores (antiguas FPI)

Referencia:
PIF2024

Centro o Instituto:
MISION BIOLOGICA DE GALICIA

Investigador:
JULIO RODRIGUEZ BANGA

Palabras clave:
Biología computacional, MODELADO MATEMÁTICO, INCERTIDUMBRE, OPTIMIZACIÓN

Documentos anexos:
666117.pdf

PIF2024 - MODELADO MECANISTICO en BIOLOGIA DE SISTEMAS (PID2023-146275NB-C22)

MODELADO MECANISTICO BASADO EN DATOS, CUANTIFICACION DE LA INCERTIDUMBRE Y OPTIMIZACION EN BIOLOGIA DE SISTEMAS Este proyecto y su plan formativo están centrados en la biología de sistemas computacional a nivel celular y de rutas bioquímicas. Utilizará un enfoque de modelado mecanicista dinámico, que juega un papel central en la biología de sistemas debido a su capacidad para entender las complejidades de las redes bio-moleculares. Al simular interacciones a lo largo del tiempo, proporciona una comprensión integral de cómo funcionan estos sistemas y su respuesta ante cambios. Este enfoque es particularmente útil para predecir los resultados ante perturbaciones e intervenciones, así como para probar y generar hipótesis. Estos modelos mecanicistas tienen varias ventajas sobre los modelos puramente basados en datos: mejor poder predictivo, mayor interpretabilidad y menor dependencia de la cantidad de medidas. Objetivos principales del plan formativo: (1) métodos automáticos de construcción de modelos dinámicos, incluyendo el descubrimiento de ecuaciones mecanicistas a partir de datos; (2) métodos de estimación de parámetros y cuantificación de incertidumbre; (3) técnicas de optimización para problemas de biología de sistemas; (4) aplicaciones en inferencia regulatoria en rutas metabólicas de microorganismos, el diseño y optimización de comunidades microbianas y el análisis de rutas de señalización celular de gran tamaño.
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